270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17530 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17530  lipid-A-disaccharide synthase  100 
 
 
379 aa  771    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00012447  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2261  lipid-A-disaccharide synthase  38.01 
 
 
384 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3751  lipid-A-disaccharide synthase  38.17 
 
 
384 aa  283  3.0000000000000004e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.493392  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3024  lipid-A-disaccharide synthase  37.74 
 
 
379 aa  282  7.000000000000001e-75  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0844  lipid-A-disaccharide synthase  37.47 
 
 
380 aa  277  2e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3232  lipid-A-disaccharide synthase  38.75 
 
 
372 aa  277  2e-73  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.017607  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0767  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 
383 aa  272  6e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3416  lipid-A-disaccharide synthase  37.2 
 
 
380 aa  272  7e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1258  lipid-A-disaccharide synthase  35.95 
 
 
392 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2350  lipid-A-disaccharide synthase  36.66 
 
 
384 aa  268  8e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1753  Lipid-A-disaccharide synthase  36.86 
 
 
387 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00112793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1172  Lipid-A-disaccharide synthase  39.42 
 
 
388 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0400  lipid-A-disaccharide synthase  37.78 
 
 
384 aa  267  2e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.636701  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2625  lipid-A-disaccharide synthase  39.35 
 
 
383 aa  267  2e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0140  lipid-A-disaccharide synthase  37.56 
 
 
388 aa  262  6e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00370869  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2589  lipid-A-disaccharide synthase  38.92 
 
 
377 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.502663  normal  0.0921926 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2711  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 
383 aa  259  7e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2806  lipid-A-disaccharide synthase  40.05 
 
 
383 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136507  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0443  lipid-A-disaccharide synthase  37.5 
 
 
380 aa  253  6e-66  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1322  lipid-A-disaccharide synthase  34.68 
 
 
384 aa  251  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1325  lipid-A-disaccharide synthase  34.68 
 
 
384 aa  249  5e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0632  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 
388 aa  249  6e-65  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0735  lipid-A-disaccharide synthase  35.05 
 
 
376 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.737656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1484  lipid-A-disaccharide synthase  33.42 
 
 
384 aa  248  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.126592  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0411  lipid-A-disaccharide synthase  35.64 
 
 
380 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.39107  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0342  lipid-A-disaccharide synthase  37.57 
 
 
380 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.509929  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1739  glycosyl transferase family protein  36.81 
 
 
382 aa  245  9.999999999999999e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.022854 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1854  lipid-A-disaccharide synthase  35.64 
 
 
388 aa  243  3e-63  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000278056  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0448  lipid-A-disaccharide synthase  36.96 
 
 
383 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0431214  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0412  lipid-A-disaccharide synthase  36.17 
 
 
402 aa  238  1e-61  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1224  lipid-A-disaccharide synthase  35.32 
 
 
411 aa  234  1.0000000000000001e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0475  glycosyl transferase family protein  34.31 
 
 
380 aa  229  6e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.882696  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2535  lipid-A-disaccharide synthase  32.46 
 
 
382 aa  228  1e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2192  lipid-A-disaccharide synthase  34.99 
 
 
372 aa  227  2e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2837  lipid-A-disaccharide synthase  32.41 
 
 
389 aa  225  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2423  lipid-A-disaccharide synthase  33.51 
 
 
378 aa  219  5e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1604  lipid-A-disaccharide synthase  36.09 
 
 
375 aa  219  7.999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0823  lipid-A-disaccharide synthase  34.83 
 
 
363 aa  218  1e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4173  lipid-A-disaccharide synthase  36.09 
 
 
375 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2185  lipid-A-disaccharide synthase  32.03 
 
 
376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1517  lipid-A-disaccharide synthase  33.89 
 
 
378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1262  lipid-A-disaccharide synthase  35.78 
 
 
388 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1547  lipid A disaccharide synthase  34.94 
 
 
380 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1159  lipid-A-disaccharide synthase  35.78 
 
 
375 aa  212  7e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.649767  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1253  lipid-A-disaccharide synthase  32.52 
 
 
419 aa  212  7.999999999999999e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.222228  normal  0.65852 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0488  lipid-A-disaccharide synthase  31.73 
 
 
381 aa  211  1e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.326664 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0138  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 
410 aa  210  3e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0879098 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3513  lipid-A-disaccharide synthase  33.78 
 
 
376 aa  210  4e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0265402  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4069  lipid-A-disaccharide synthase  34.23 
 
 
375 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0368861 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1707  lipid-A-disaccharide synthase  32.43 
 
 
376 aa  209  8e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.212206  normal  0.651239 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2872  lipid-A-disaccharide synthase  31.23 
 
 
385 aa  208  1e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1358  lipid-A-disaccharide synthase  31.56 
 
 
389 aa  208  1e-52  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.239828  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04825  lipid-A-disaccharide synthase  32 
 
 
370 aa  207  2e-52  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.273713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1356  lipid-A-disaccharide synthase  34.44 
 
 
380 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2535  lipid-A-disaccharide synthase  35.74 
 
 
392 aa  206  4e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2802  lipid-A-disaccharide synthase  34.15 
 
 
385 aa  206  5e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.433655  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01385  tetraacyldisaccharide-1-P synthase  32.85 
 
 
382 aa  206  6e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0143818  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3014  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 
385 aa  206  8e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2628  lipid-A-disaccharide synthase  33.88 
 
 
385 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00918901  normal  0.0975507 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2695  lipid-A-disaccharide synthase  33.88 
 
 
385 aa  205  1e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.240899  hitchhiker  0.00356669 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1427  lipid-A-disaccharide synthase  30.91 
 
 
371 aa  204  2e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1391  lipid A disaccharide synthase  31.27 
 
 
378 aa  204  2e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1104  lipid-A-disaccharide synthase  31.76 
 
 
376 aa  203  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000036555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4501  lipid-A-disaccharide synthase  29.84 
 
 
385 aa  202  6e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.197565  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2622  lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 
382 aa  202  8e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.187524  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7057  lipid-A-disaccharide synthase  32.09 
 
 
367 aa  201  9.999999999999999e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.193202  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3449  lipid-A-disaccharide synthase  30.87 
 
 
377 aa  200  3e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1755  lipid-A-disaccharide synthase  33.93 
 
 
382 aa  200  3e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.625796  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1508  lipid-A-disaccharide synthase  30.63 
 
 
382 aa  200  3e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000162544 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0353  lipid-A-disaccharide synthase  31.2 
 
 
385 aa  200  3e-50  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.683095  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1568  lipid-A-disaccharide synthase  34.86 
 
 
393 aa  200  3.9999999999999996e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1642  lipid-A-disaccharide synthase  33.6 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2584  Lipid-A-disaccharide synthase  32.74 
 
 
388 aa  199  5e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.372762  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2572  lipid-A-disaccharide synthase  31 
 
 
368 aa  199  9e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2165  lipid-A-disaccharide synthase  30.56 
 
 
385 aa  197  3e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.361535  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1567  lipid-A-disaccharide synthase  31.89 
 
 
383 aa  197  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0268108  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1361  lipid-A-disaccharide synthase  32.16 
 
 
384 aa  197  3e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.505658  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01116  lipid-A-disaccharide synthase  30.11 
 
 
384 aa  197  4.0000000000000005e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00168511  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0318  lipid-A-disaccharide synthase  30.93 
 
 
385 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3268  lipid-A-disaccharide synthase  32.43 
 
 
384 aa  196  7e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00291513  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38860  lipid-A-disaccharide synthase  32.01 
 
 
380 aa  195  1e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1463  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 
398 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000311571  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1458  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 
398 aa  194  3e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00133768  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3040  lipid-A-disaccharide synthase  33.86 
 
 
377 aa  193  4e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.683865  normal  0.986497 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2889  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 
392 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00252112  normal  0.518921 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1494  lipid-A-disaccharide synthase  31.44 
 
 
398 aa  192  7e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0038622  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2872  lipid-A-disaccharide synthase  32.45 
 
 
383 aa  192  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0341971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1868  lipid-A-disaccharide synthase  34.13 
 
 
402 aa  192  1e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0119678  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1114  lipid-A-disaccharide synthase  33.83 
 
 
376 aa  191  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.460088  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1283  lipid-A-disaccharide synthase  33.83 
 
 
382 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0224286  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0798  lipid-A-disaccharide synthase  34.73 
 
 
372 aa  191  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17220  lipid-A-disaccharide synthase  32.64 
 
 
378 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1285  lipid-A-disaccharide synthase  33.03 
 
 
385 aa  191  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.906554 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1417  lipid-A-disaccharide synthase  32.02 
 
 
390 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.903246  normal  0.0685457 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2967  lipid-A-disaccharide synthase  30.38 
 
 
382 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0634208  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1355  lipid-A-disaccharide synthase  34.24 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.565807  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1291  lipid-A-disaccharide synthase  32.01 
 
 
377 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0853642  normal  0.781949 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0753  hypothetical protein  29.81 
 
 
370 aa  190  4e-47  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1496  lipid-A-disaccharide synthase  32.94 
 
 
378 aa  189  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1152  lipid-A-disaccharide synthase  32.34 
 
 
393 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0153837  normal  0.773654 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>