52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_17180 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_17180  conserved hypothetical protein TIGR00374  100 
 
 
342 aa  667    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09870  conserved hypothetical protein TIGR00374  32.07 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1781  hypothetical protein  30.38 
 
 
346 aa  145  9e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1115  hypothetical protein  27.55 
 
 
337 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2008  integral membrane protein  27.69 
 
 
348 aa  129  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000264184  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2409  hypothetical protein  29.53 
 
 
342 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.753908  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0961  hypothetical protein  26.95 
 
 
340 aa  123  5e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2249  hypothetical protein  29.11 
 
 
344 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2216  integral membrane protein  26.92 
 
 
347 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0546223 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1712  hypothetical protein  28.49 
 
 
352 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1443  hypothetical protein  31.49 
 
 
340 aa  112  8.000000000000001e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1275  hypothetical protein  27.68 
 
 
347 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1276  nitrogenase molybdenum-iron protein alpha and beta chains-like protein  26.93 
 
 
347 aa  101  2e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.868596 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1084  hypothetical protein  27.41 
 
 
353 aa  92.8  7e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2070  hypothetical protein  21.41 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.161421  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1257  hypothetical protein  27.03 
 
 
366 aa  84.3  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00000018752  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  25.68 
 
 
342 aa  83.2  0.000000000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2758  hypothetical protein  25 
 
 
301 aa  77.4  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.823957  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3008  hypothetical protein  25.18 
 
 
352 aa  77.4  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1587  integral membrane protein  27.08 
 
 
338 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.029359  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1341  hypothetical protein  27.41 
 
 
317 aa  71.2  0.00000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.198282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1365  hypothetical protein  24.86 
 
 
374 aa  67.8  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1959  hypothetical protein  24.54 
 
 
354 aa  64.7  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000013815  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1924  hypothetical protein  25.58 
 
 
323 aa  65.1  0.000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00284727  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0622  hypothetical protein  26.67 
 
 
358 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1651  hypothetical protein  26.33 
 
 
334 aa  63.5  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0104013  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1008  hypothetical protein  24.57 
 
 
330 aa  63.2  0.000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00036444  hitchhiker  0.0000000000115467 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56050  hypothetical protein  26.42 
 
 
333 aa  62  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0434  hypothetical protein  24.65 
 
 
357 aa  62.4  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0718822  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4446  hypothetical protein  24.06 
 
 
330 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000651496  hitchhiker  0.0000161544 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0389  integral membrane protein  25.49 
 
 
345 aa  60.1  0.00000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4355  hypothetical protein  23.61 
 
 
330 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00100984  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1439  hypothetical protein  23.39 
 
 
335 aa  60.1  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1853  hypothetical protein  23.53 
 
 
360 aa  59.3  0.00000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0126154  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1368  hypothetical protein  23.61 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.180848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4881  hypothetical protein  26.42 
 
 
333 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.562243  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4434  hypothetical protein  23.4 
 
 
332 aa  57.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.113493  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0911  hypothetical protein  27.05 
 
 
432 aa  57  0.0000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00529353  normal  0.444552 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0739  hypothetical protein  23.15 
 
 
351 aa  54.7  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1321  hypothetical protein  23.26 
 
 
337 aa  53.5  0.000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000273017  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  22.91 
 
 
338 aa  50.8  0.00003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.48 
 
 
340 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  24.6 
 
 
347 aa  47  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0873  hypothetical protein  26.96 
 
 
321 aa  46.2  0.0008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0043  hypothetical protein  26.06 
 
 
363 aa  46.2  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0220  hypothetical protein  23.15 
 
 
333 aa  45.1  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  21.96 
 
 
340 aa  44.7  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  22.55 
 
 
339 aa  44.3  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0184  hypothetical protein  24.78 
 
 
358 aa  43.9  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0384  hypothetical protein  40.35 
 
 
331 aa  43.5  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.11586  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  25.58 
 
 
340 aa  43.5  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17930  hypothetical protein  23.4 
 
 
330 aa  43.1  0.006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558926  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>