86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15920 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_15920  Squalene synthase  100 
 
 		 321 aa  654    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.13397  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4822  Squalene/phytoene synthase  29.36 
 
 		 360 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000193666  normal  0.636776 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0892  Squalene/phytoene synthase  32.24 
 
 		 330 aa  130  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000100627  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1206  Squalene/phytoene synthase  25.44 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000204086  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2280  squalene/phytoene synthase  29.47 
 
 		 359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1173  Squalene/phytoene synthase  24.61 
 
 		 348 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0934  Squalene/phytoene synthase  25.16 
 
 		 348 aa  101  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_10396  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G01220)  29.1 
 
 		 470 aa  98.6  1e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2309  Squalene/phytoene synthase  23.51 
 
 		 350 aa  96.7  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31144  predicted protein  29.1 
 
 		 456 aa  95.9  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83429  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.96 
 
 		 448 aa  92.4  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.274803  normal  0.0738823 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1321  squalene/phytoene synthase  26.94 
 
 		 366 aa  90.9  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13160  predicted protein  27.67 
 
 		 314 aa  90.5  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0902  Squalene/phytoene synthase  27.01 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.883554  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2690  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  28.21 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.286545  normal  0.217848 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0813  squalene synthase  26.95 
 
 		 362 aa  84  0.000000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.493188  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20770  Squalene/phytoene synthase  28.24 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00645323  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC05660  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase, putative  26.81 
 
 		 542 aa  71.6  0.00000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.148096  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2156  squalene/phytoene synthase family protein  25.77 
 
 		 564 aa  70.5  0.00000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0418  squalene/phytoene synthase family protein  25.77 
 
 		 349 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0843  squalene/phytoene synthase family protein  25.43 
 
 		 516 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336434  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1133  squalene/phytoene synthase family protein  25.43 
 
 		 349 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2107  squalene/phytoene synthase family protein  25.43 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.666736  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1762  squalene/phytoene synthase family protein  25.43 
 
 		 513 aa  67  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265717  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1840  squalene/phytoene synthase family protein  25.43 
 
 		 356 aa  67  0.0000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.156378  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0327  squalene/phytoene synthase family protein  25.43 
 
 		 402 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.479613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0124  hypothetical protein  26.03 
 
 		 345 aa  66.6  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0189  squalene/phytoene synthase  26.05 
 
 		 329 aa  66.2  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.433494  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0110  hypothetical protein  26.35 
 
 		 345 aa  65.9  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1784  Squalene synthase  25.16 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2125  phytoene/squalene synthetase family protein  25.4 
 
 		 347 aa  65.5  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4328  squalene/phytoene synthase  24.23 
 
 		 367 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0106814  normal  0.0939133 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2476  Squalene/phytoene synthase  22.8 
 
 		 321 aa  59.7  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0365  Squalene/phytoene synthase  29.58 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1749  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.23 
 
 		 354 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0364934  normal  0.191421 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0169  squalene/phytoene synthase  23.96 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  normal  0.0348824 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3255  squalene/phytoene synthase  25.23 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5617  Squalene/phytoene synthase  25.76 
 
 		 353 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3686  squalene/phytoene synthase  24.22 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.481699 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4104  squalene/phytoene synthase  25.23 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.132439  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4262  squalene/phytoene synthase  25.23 
 
 		 355 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0172457  normal  0.1857 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4159  squalene/phytoene synthase  23.91 
 
 		 354 aa  54.7  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.283896  normal  0.280623 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5450  squalene/phytoene synthase  23.11 
 
 		 351 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.035034 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  28.17 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  25.68 
 
 		 312 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  28.95 
 
 		 505 aa  51.2  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  28.31 
 
 		 280 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  25.29 
 
 		 312 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  24.09 
 
 		 313 aa  50.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0957  squalene/phytoene synthase  25.65 
 
 		 380 aa  50.8  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1894  Squalene/phytoene synthase  27.36 
 
 		 270 aa  49.7  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    unclonable  2.73181e-25 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12760  phytoene/squalene synthetase  27.66 
 
 		 297 aa  49.7  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.614964 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  25.3 
 
 		 302 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4026  Squalene/phytoene synthase  23.62 
 
 		 388 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.600735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0519  Squalene/phytoene synthase  25.24 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000172077  unclonable  0.00000000442805 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0502  Squalene/phytoene synthase  25.24 
 
 		 270 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  28.91 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  36.36 
 
 		 316 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4808  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  25.96 
 
 		 276 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000000603288  normal  0.956727 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1618  squalene/phytoene synthase  28.57 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  21.89 
 
 		 311 aa  47.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  33.33 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0485  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  27.2 
 
 		 348 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.501561  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00920  phytoene synthetase  37.04 
 
 		 279 aa  46.6  0.0006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.632268  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  23.32 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  23.32 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  35.29 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  23.53 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  34.02 
 
 		 325 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  29.09 
 
 		 310 aa  45.4  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  25.46 
 
 		 303 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  37.66 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  24.09 
 
 		 313 aa  44.7  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  28.18 
 
 		 309 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5959  Squalene/phytoene synthase  23.02 
 
 		 278 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.581126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1700  Squalene/phytoene synthase  23.39 
 
 		 355 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.898001  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  24.78 
 
 		 304 aa  44.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_5449  predicted protein  27.62 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2267  Squalene/phytoene synthase  34.41 
 
 		 292 aa  43.9  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  23.29 
 
 		 302 aa  43.5  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2584  squalene/phytoene synthase  25.81 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2638  squalene/phytoene synthase  25.81 
 
 		 287 aa  43.5  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.444406  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  23.44 
 
 		 302 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  25.65 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1262  squalene/phytoene synthase  23.79 
 
 		 348 aa  42.7  0.008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.238367  normal  0.0709995 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  22.92 
 
 		 302 aa  42.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>