23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15450 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15450  conserved hypothetical protein TIGR01319  100 
 
 
464 aa  933    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000232195  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2691  glutamate mutase, MutL  53.21 
 
 
462 aa  487  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4402  glutamate mutase, MutL  50.43 
 
 
460 aa  424  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1024  hypothetical protein  47.96 
 
 
459 aa  412  1e-114  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000932144  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1346  glutamate mutase, MutL  46.48 
 
 
461 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21090  DNA mismatch repair protein MutL  38.81 
 
 
447 aa  294  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1665  methylaspartate mutase  38.72 
 
 
468 aa  286  5e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1482  hypothetical protein  38.56 
 
 
447 aa  281  2e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000544917  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1171  putative component of D-ornithine aminomutase  37.9 
 
 
456 aa  276  4e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000333128  decreased coverage  0.0000285962 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1816  methylaspartate mutase  34.84 
 
 
450 aa  258  1e-67  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0316  hypothetical protein  37.47 
 
 
455 aa  257  2e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3947  glutamate mutase large subunit, B12-dependent  34.9 
 
 
454 aa  233  6e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.455292  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2387  hypothetical protein  34.34 
 
 
445 aa  225  2e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.030749  hitchhiker  0.000291133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0751  putative glutamate mutase mutL  35.37 
 
 
462 aa  224  3e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0831  putative glutamate mutase mutL  34.64 
 
 
462 aa  221  3e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.937814 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2268  hypothetical protein  34.79 
 
 
469 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00276621  normal  0.111523 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2155  glutamate mutase, MutL  33.4 
 
 
471 aa  196  6e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.932369 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0977  hypothetical protein  33.12 
 
 
443 aa  189  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0781  hypothetical protein  29.45 
 
 
613 aa  151  3e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.751545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0192  hypothetical protein  21.96 
 
 
725 aa  65.5  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00309311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2439  hypothetical protein  24.46 
 
 
669 aa  56.6  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0232795 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3650  hypothetical protein  21.89 
 
 
610 aa  55.1  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2217  hypothetical protein  23.93 
 
 
676 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000677217 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>