137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15330 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15330  methylamine-specific methylcobalamin coenzyme M methyltransferase  100 
 
 
448 aa  922    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0598  uroporphyrinogen decarboxylase  30.36 
 
 
335 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0731  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  32.08 
 
 
319 aa  143  6e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.20168  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1447  cobalamin B12-binding  31.07 
 
 
556 aa  138  2e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0642463 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2785  MtaA/CmuA family methyltransferase  29.2 
 
 
372 aa  119  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.271038  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2346  methyltransferase MtaA/CmuA  29.41 
 
 
349 aa  109  9.000000000000001e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.189161 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  25.7 
 
 
375 aa  103  5e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0839  uroporphyrinogen decarboxylase  25.47 
 
 
363 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18310  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.93 
 
 
358 aa  102  2e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0417  uroporphyrinogen decarboxylase  26.77 
 
 
357 aa  100  4e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3639  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  30.18 
 
 
339 aa  100  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.739876  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2082  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  28.46 
 
 
344 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1826  uroporphyrinogen decarboxylase  25.16 
 
 
363 aa  99.4  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0808  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.96 
 
 
338 aa  97.8  3e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0076  uroporphyrinogen decarboxylase  24.53 
 
 
363 aa  96.7  8e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.541731  normal  0.38624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1305  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  25.37 
 
 
337 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.536887  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0841  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.23 
 
 
339 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2102  methyltransferase MtaA/CmuA  27.41 
 
 
338 aa  94.4  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1005  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.74 
 
 
345 aa  90.1  7e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0023  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.67 
 
 
337 aa  87.8  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1054  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  29.93 
 
 
339 aa  86.7  7e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0196  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.12 
 
 
335 aa  84  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.343296  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2069  methyltransferase MtaA/CmuA family  25.36 
 
 
348 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.096371  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19560  uroporphyrinogen-III decarboxylase  24.46 
 
 
363 aa  81.3  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000289502 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2100  methyltransferase MtaA/CmuA  27.05 
 
 
350 aa  79.7  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3585  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.26 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.936166  normal  0.073488 
 
 
-
 
NC_002978  WD1028  uroporphyrinogen decarboxylase  27.24 
 
 
338 aa  75.1  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1788  uroporphyrinogen decarboxylase  22.18 
 
 
350 aa  75.5  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2887  uroporphyrinogen decarboxylase  25 
 
 
354 aa  75.5  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.242767  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25860  uroporphyrinogen-III decarboxylase  26.87 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2317  uroporphyrinogen decarboxylase  23.51 
 
 
335 aa  73.9  0.000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0430681  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1688  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  27.94 
 
 
341 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.967324  normal  0.14364 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0452  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.63 
 
 
310 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1714  uroporphyrinogen decarboxylase  23.08 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.451104  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0019  uroporphyrinogen decarboxylase  23.39 
 
 
352 aa  71.2  0.00000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.693326  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0062  uroporphyrinogen decarboxylase  24.21 
 
 
386 aa  70.5  0.00000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.629057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0419  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  26.45 
 
 
348 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.919138  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0600  uroporphyrinogen decarboxylase  23.64 
 
 
314 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  22.87 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.401207  normal  0.983268 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0425  uroporphyrinogen decarboxylase  26.35 
 
 
343 aa  68.2  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0329871 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06391  uroporphyrinogen decarboxylase  24 
 
 
346 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2671  uroporphyrinogen decarboxylase  21.09 
 
 
353 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.181527 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0077  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.64 
 
 
342 aa  65.9  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.268466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2998  uroporphyrinogen decarboxylase  23.32 
 
 
354 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0583  uroporphyrinogen decarboxylase  23.27 
 
 
346 aa  64.7  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06091  uroporphyrinogen decarboxylase  23.64 
 
 
346 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.633731  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3121  uroporphyrinogen decarboxylase  21.38 
 
 
354 aa  64.3  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176103  normal  0.535285 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5159  uroporphyrinogen decarboxylase  21.66 
 
 
350 aa  63.9  0.000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1017  uroporphyrinogen decarboxylase  23.79 
 
 
352 aa  63.5  0.000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4408  uroporphyrinogen decarboxylase  21.09 
 
 
349 aa  63.2  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06481  uroporphyrinogen decarboxylase  23.38 
 
 
346 aa  63.2  0.000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.828005  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2590  uroporphyrinogen decarboxylase  27.98 
 
 
360 aa  63.2  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0918  uroporphyrinogen decarboxylase  22.83 
 
 
352 aa  61.6  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.763067  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5697  methyltransferase MtaA/CmuA family  23.36 
 
 
617 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1825  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  25.27 
 
 
342 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18361  uroporphyrinogen decarboxylase  21.17 
 
 
352 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.28197 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26140  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  24.91 
 
 
341 aa  61.6  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0838  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.76 
 
 
342 aa  60.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2786  methylcobalamin:coenzyme M methyltransferase  23.46 
 
 
355 aa  60.1  0.00000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2103  uroporphyrinogen decarboxylase  22.54 
 
 
339 aa  60.1  0.00000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00554652  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0634  uroporphyrinogen decarboxylase  27.27 
 
 
343 aa  59.7  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000186369  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0693  uroporphyrinogen decarboxylase  22.94 
 
 
351 aa  59.3  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_19188  uroporphyrinogen decarboxylase  21.5 
 
 
409 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28976  predicted protein  20.3 
 
 
365 aa  58.5  0.0000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0707495  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4344  uroporphyrinogen decarboxylase  22.79 
 
 
337 aa  57.8  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.167792  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10691  uroporphyrinogen decarboxylase  20.29 
 
 
351 aa  57  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.88253  normal  0.85423 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19550  uroporphyrinogen-III decarboxylase  23.31 
 
 
373 aa  56.6  0.0000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.288142  hitchhiker  0.0000066757 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3453  uroporphyrinogen decarboxylase  24 
 
 
340 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0575742  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3546  uroporphyrinogen decarboxylase  24.21 
 
 
340 aa  56.6  0.0000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1216  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 
350 aa  55.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3222  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  55.8  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.234724 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17656  predicted protein  20.96 
 
 
339 aa  56.2  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0099841  normal  0.0141903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1147  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 
350 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1713  Uroporphyrinogen decarboxylase (URO-D)  24.7 
 
 
349 aa  55.5  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00218554  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3444  uroporphyrinogen decarboxylase  24.44 
 
 
340 aa  54.7  0.000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5175  uroporphyrinogen decarboxylase  23.61 
 
 
360 aa  54.3  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0841992  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0769  uroporphyrinogen decarboxylase  22.1 
 
 
343 aa  53.5  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000649218  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  22.63 
 
 
339 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0957  uroporphyrinogen decarboxylase  23.15 
 
 
348 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  22.63 
 
 
339 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.267289  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0010  uroporphyrinogen decarboxylase HemE  22.22 
 
 
334 aa  52.4  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0317  uroporphyrinogen decarboxylase  20.6 
 
 
340 aa  52  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2028  uroporphyrinogen decarboxylase  22.51 
 
 
352 aa  52  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.562802  normal 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18446  predicted protein  20.72 
 
 
321 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1088  uroporphyrinogen decarboxylase  24.03 
 
 
350 aa  50.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4338  uroporphyrinogen decarboxylase  22.22 
 
 
354 aa  50.4  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.332252  normal  0.612683 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1846  hypothetical protein  24.02 
 
 
302 aa  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2005  uroporphyrinogen decarboxylase  21.55 
 
 
353 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0134  uroporphyrinogen-III decarboxylase  22.67 
 
 
343 aa  50.1  0.00009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0015  uroporphyrinogen decarboxylase  21.79 
 
 
339 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00367491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1465  uroporphyrinogen decarboxylase  26.77 
 
 
345 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2010  uroporphyrinogen decarboxylase  21.69 
 
 
352 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2734  uroporphyrinogen decarboxylase  21.72 
 
 
359 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.961609  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0016  uroporphyrinogen decarboxylase  23.11 
 
 
340 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.87416  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2750  uroporphyrinogen decarboxylase  22.29 
 
 
340 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1089  uroporphyrinogen decarboxylase  21.27 
 
 
348 aa  48.1  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00641  uroporphyrinogen decarboxylase  22.35 
 
 
380 aa  48.5  0.0003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1086  uroporphyrinogen decarboxylase  20.65 
 
 
354 aa  47.8  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000970328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12693  uroporphyrinogen decarboxylase  25.52 
 
 
357 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000799179  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3245  uroporphyrinogen decarboxylase  22.73 
 
 
340 aa  48.1  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>