29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15190 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15190  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 
198 aa  397  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1076  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.17 
 
 
197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0774  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  51.05 
 
 
206 aa  194  6e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.356687  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0637  CRISPR-associated Cas4 family protein  48.4 
 
 
191 aa  194  1e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.042721  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0227  CRISPR-associated Cas4 family protein  46.84 
 
 
209 aa  182  3e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.279714  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3220  CRISPR-associated Cas4 family protein  44.21 
 
 
204 aa  170  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.680334  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6022  CRISPR-associated protein Cas4  42.05 
 
 
195 aa  168  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.318812  normal  0.45154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1765  CRISPR-associated protein Cas4  26.6 
 
 
189 aa  73.9  0.000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1287  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.94 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.826986  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1121  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.19 
 
 
190 aa  60.8  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  hitchhiker  0.00306765  normal  0.769752 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2233  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.02 
 
 
205 aa  58.2  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0652  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.11 
 
 
210 aa  58.2  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.915701  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1142  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.61 
 
 
190 aa  57.4  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.142818  hitchhiker  0.00000342837 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1872  CRISPR-associated Cas4 family protein  20.6 
 
 
198 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3305  CRISPR-associated Cas4 family protein  20.79 
 
 
198 aa  53.5  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.143494  normal  0.352212 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1277  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  26.56 
 
 
189 aa  53.1  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0341356 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0728  CRISPR-associated Cas4 family protein  25.81 
 
 
172 aa  49.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0565  CRISPR-associated protein Cas4  19.47 
 
 
202 aa  48.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.234335  normal  0.250424 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1155  CRISPR-associated Cas4 family protein  20.32 
 
 
212 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1006  CRISPR-associated Cas4 family protein  19.69 
 
 
219 aa  46.2  0.0004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0235  CRISPR-associated Cas4 family protein  18.62 
 
 
211 aa  45.1  0.0008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0851  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  19.9 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.93 
 
 
544 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.59 
 
 
1019 aa  43.9  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1937  hypothetical protein  21.34 
 
 
216 aa  43.1  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.370637  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1859  CRISPR-associated Cas4 family protein  22.04 
 
 
193 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.343722  normal  0.533704 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0605  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  19.79 
 
 
216 aa  41.6  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.452129 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0163  hypothetical protein  24.24 
 
 
197 aa  41.6  0.007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  22.22 
 
 
545 aa  41.2  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>