More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_15050 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_15050  regulatory protein GntR HTH  100 
 
 
368 aa  739    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.34825  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2737  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  33.06 
 
 
364 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0851  GntR family transcriptional regulator  29.72 
 
 
359 aa  157  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0546465  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2750  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  27.09 
 
 
379 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0161564  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2252  Transcriptional regulators-like protein  28.1 
 
 
364 aa  146  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.717658 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2905  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  27.91 
 
 
372 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.532427  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2901  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  27.84 
 
 
375 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.812562  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0301  regulatory protein GntR HTH  32.29 
 
 
353 aa  137  2e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.814124  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  31.79 
 
 
342 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0485  GntR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
365 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00291499  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3979  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  27 
 
 
366 aa  136  5e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562885  normal  0.577756 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0226  GntR family transcriptional regulator  29.16 
 
 
362 aa  134  3.9999999999999996e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3175  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.6 
 
 
347 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0673  regulatory protein GntR HTH  30.11 
 
 
351 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2059  transcriptional regulator, GntR family with LacI sensor  28.88 
 
 
382 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.256407  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0870  alanine racemase  29.18 
 
 
351 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2049  LacI family transcription regulator  28.47 
 
 
352 aa  129  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.586342  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  30.15 
 
 
368 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.21 
 
 
338 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  29.11 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1012  regulatory protein GntR, HTH  31.44 
 
 
342 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1478  transcriptional regulator, LacI family  29.97 
 
 
348 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.764656  normal  0.890792 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.94 
 
 
336 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1971  LacI family transcription regulator  28.11 
 
 
352 aa  126  5e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.137395  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1374  transcriptional regulator, LacI family  29.62 
 
 
357 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.748872  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  30.91 
 
 
337 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  26.67 
 
 
338 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0363  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 
360 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3470  regulatory protein GntR HTH  29.25 
 
 
364 aa  120  3e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000106127  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  27.48 
 
 
340 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 
333 aa  119  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  30.92 
 
 
337 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0292  LacI family transcription regulator  29.35 
 
 
341 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00151755  n/a   
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  26.82 
 
 
340 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  30.32 
 
 
347 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4008  transcriptional regulator, LacI family  29.43 
 
 
340 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000985107  hitchhiker  0.00000124933 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1699  GntR family transcriptional regulator  26.68 
 
 
392 aa  117  3e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.173754  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  27.57 
 
 
330 aa  117  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  31.85 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  26.34 
 
 
340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0081  GntR family transcriptional regulator  26.58 
 
 
533 aa  115  7.999999999999999e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0322745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  29.96 
 
 
336 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  27.78 
 
 
333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0477  transcriptional regulator, LacI family  28.52 
 
 
352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.49 
 
 
339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  27.8 
 
 
331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  25.93 
 
 
338 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2817  LacI family transcription regulator  31.64 
 
 
339 aa  114  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3040  transcriptional regulator, LacI family  26.89 
 
 
339 aa  114  3e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05070  putative LacI-family transcriptional regulator  28.02 
 
 
339 aa  114  3e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.697537  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.74 
 
 
352 aa  113  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  29.01 
 
 
334 aa  113  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  30.93 
 
 
344 aa  112  8.000000000000001e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  28.53 
 
 
344 aa  112  9e-24  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  25.78 
 
 
368 aa  112  9e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1324  LacI family transcription regulator  25.84 
 
 
336 aa  112  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0131249  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  28.99 
 
 
340 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2376  transcriptional regulator, LacI family  26.61 
 
 
352 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  25.57 
 
 
340 aa  110  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1574  transcriptional regulator, LacI family  27.41 
 
 
337 aa  110  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0559  transcriptional regulator, LacI family  25.84 
 
 
337 aa  110  3e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2228  regulatory protein GntR HTH  27.2 
 
 
370 aa  110  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.916284  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0413  transcriptional regulator, LacI family  27.94 
 
 
358 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1248  transcriptional regulator, LacI family  28.68 
 
 
334 aa  110  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0782052 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  29.34 
 
 
336 aa  110  5e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01581  transcriptional regulator  26.64 
 
 
334 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.62 
 
 
356 aa  110  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  27.84 
 
 
342 aa  109  6e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20880  transcriptional regulator, LacI family  26.71 
 
 
343 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5512  transcriptional regulator, LacI family  27.47 
 
 
340 aa  109  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0234887 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1012  regulatory protein GntR HTH  26.27 
 
 
370 aa  109  8.000000000000001e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1032  DNA-binding transcriptional repressor PurR  29 
 
 
333 aa  109  8.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.872659  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1481  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.08 
 
 
348 aa  109  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  26.81 
 
 
361 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0647  transcriptional regulator, LacI family  25.07 
 
 
357 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0466  transcriptional regulator, LacI family  24.72 
 
 
347 aa  108  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.450137  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2503  transcriptional regulator  30.53 
 
 
339 aa  107  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.117668  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003941  transcriptional regulator LacI family protein  26.64 
 
 
334 aa  108  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  26.29 
 
 
333 aa  107  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  27.73 
 
 
346 aa  107  3e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8123  transcriptional regulator, LacI family  26.67 
 
 
358 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0592322  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4950  putative LacI family transcriptional regulator  25.45 
 
 
341 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.213435  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  25.16 
 
 
346 aa  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2073  transcriptional regulator, LacI family  27.49 
 
 
336 aa  106  5e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000787477  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  25.95 
 
 
353 aa  106  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2686  transcriptional regulator, LacI family  27.81 
 
 
340 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.241666  normal  0.163804 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1067  transcriptional regulator, LacI family  26.77 
 
 
349 aa  106  7e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0326258  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  26.79 
 
 
346 aa  105  8e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.36 
 
 
337 aa  105  9e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0649  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.23 
 
 
318 aa  105  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.174613  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2261  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  27.14 
 
 
348 aa  105  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.276208 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  27.24 
 
 
343 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.9 
 
 
356 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  27.5 
 
 
341 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2711  alanine racemase  26.14 
 
 
342 aa  105  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000872573  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1419  transcriptional regulator, LacI family  26.27 
 
 
356 aa  104  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.933801  normal  0.184887 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3709  galactose operon repressor  28.83 
 
 
333 aa  104  2e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.536559  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1314  transcriptional regulator, LacI family protein  25.96 
 
 
352 aa  104  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  27.27 
 
 
332 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>