277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13890 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_13890  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 175 aa  344  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.582346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1271  peptidoglycan-binding LysM  36.27 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000333433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3452  molybdenum ABC transporter, periplasmic molybdate-binding protein  35.92 
 
 		 335 aa  67.4  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  30.47 
 
 		 556 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11320  Peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 173 aa  65.1  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00223945  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2064  polysaccharide deacetylase  34.69 
 
 		 368 aa  64.3  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000028992  hitchhiker  0.000502846 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1211  NLP/P60 protein  32.43 
 
 		 338 aa  64.3  0.0000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000171376  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2097  NLP/P60 protein  33.86 
 
 		 341 aa  63.9  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0215  Lytic transglycosylase catalytic  29.89 
 
 		 733 aa  62.4  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1238  Peptidoglycan-binding LysM  32.77 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000457742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.19 
 
 		 289 aa  61.2  0.000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1303  peptidoglycan-binding LysM  37.37 
 
 		 112 aa  60.8  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.290391  normal  0.428505 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0087  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 620 aa  60.5  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22030  Peptidoglycan-binding LysM  32.04 
 
 		 409 aa  60.5  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3580  peptidoglycan-binding LysM  30.91 
 
 		 544 aa  60.1  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  30.1 
 
 		 518 aa  59.3  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0492  alginate lyase 2  31.34 
 
 		 1556 aa  58.9  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1354  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 		 661 aa  58.5  0.00000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.828484  normal  0.0280405 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1096  cell wall hydrolase, SleB  36.84 
 
 		 304 aa  58.2  0.00000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.345588  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1522  Lytic transglycosylase catalytic  33.04 
 
 		 561 aa  57.8  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00867161  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0883  peptidase M23B  35.92 
 
 		 278 aa  57.4  0.00000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0223  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  35.85 
 
 		 470 aa  57  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1583  lytic transglycosylase, catalytic  28.85 
 
 		 1079 aa  57  0.0000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.000168341  normal  0.0166212 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1429  cell wall hydrolase, SleB  30.39 
 
 		 267 aa  56.6  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000499844  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0925  peptidoglycan binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 327 aa  56.2  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 		 539 aa  56.6  0.0000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  29.7 
 
 		 524 aa  56.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 550 aa  56.6  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1583  peptidoglycan-binding LysM  30.19 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0122  NLP/P60 protein  36.45 
 
 		 301 aa  55.8  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.806641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2827  Peptidoglycan-binding LysM  43.48 
 
 		 130 aa  55.5  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000797997  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  25.83 
 
 		 554 aa  55.1  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  25.58 
 
 		 548 aa  55.5  0.0000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2149  Slt family transglycosylase  28.81 
 
 		 442 aa  55.1  0.0000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.20197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0694  lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 595 aa  55.1  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000324493  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  28.57 
 
 		 1001 aa  55.1  0.0000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1998  peptidoglycan-binding LysM  31.03 
 
 		 123 aa  55.1  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0170304  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2479  lysM domain-containing protein  47.73 
 
 		 520 aa  54.7  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1297  LysM/M23/M37 peptidase  25.23 
 
 		 301 aa  54.3  0.0000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000265037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4147  peptidoglycan-binding LysM  31.73 
 
 		 250 aa  54.3  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0392634 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  30.84 
 
 		 266 aa  53.9  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  47.37 
 
 		 284 aa  53.5  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3560  Peptidoglycan-binding LysM  26.89 
 
 		 446 aa  53.9  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1626  cell wall hydrolase SleB  31.07 
 
 		 253 aa  53.5  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.193546  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0695  Lytic transglycosylase catalytic  28.57 
 
 		 499 aa  53.9  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000410524  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1800  peptidoglycan-binding LysM  35 
 
 		 503 aa  53.9  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.199953  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  33.98 
 
 		 377 aa  53.9  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1627  Peptidoglycan-binding LysM  53.57 
 
 		 207 aa  53.1  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000379646 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  32.97 
 
 		 501 aa  52.8  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0922  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  48.89 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.005941  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  27.73 
 
 		 1021 aa  53.1  0.000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1825  Peptidoglycan-binding LysM  49.02 
 
 		 128 aa  53.5  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06440  polysaccharide deacetylase  33.98 
 
 		 405 aa  52.4  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.467697  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2988  lytic transglycosylase  31.36 
 
 		 503 aa  52  0.000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.351153  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  29 
 
 		 274 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2149  peptidoglycan-binding LysM  54.17 
 
 		 709 aa  52  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2189  lysM domain-containing protein  47.73 
 
 		 520 aa  52  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1199  LysM repeat-containing muramidase  27.93 
 
 		 390 aa  52  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00727449  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2728  Lytic transglycosylase catalytic  25.81 
 
 		 547 aa  51.6  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  33.03 
 
 		 265 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  33.03 
 
 		 265 aa  51.6  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06410  cell wall hydrolase SleB  32.32 
 
 		 546 aa  51.6  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1124  Lytic transglycosylase catalytic  25.81 
 
 		 596 aa  51.2  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.331825  normal  0.414792 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0625  NLP/P60 protein  28.7 
 
 		 466 aa  51.2  0.000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00171515  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2042  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  33.67 
 
 		 617 aa  50.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000130746  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2915  Peptidoglycan-binding LysM  27.59 
 
 		 393 aa  51.2  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.992614  hitchhiker  0.000000148718 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06090  type II and III secretion system protein  37.89 
 
 		 881 aa  50.8  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  28.3 
 
 		 543 aa  50.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2994  peptidoglycan-binding protein  26.26 
 
 		 467 aa  50.8  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00261839  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4425  cell wall hydrolase SleB  46 
 
 		 286 aa  50.4  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  42.55 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2901  glycoside hydrolase family 18  34.34 
 
 		 420 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1010  Slt family transglycosylase  23.74 
 
 		 506 aa  50.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.66 
 
 		 797 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2148  LysM domain-containing protein  40 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.321456  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  42.03 
 
 		 754 aa  49.7  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1299  cell wall hydrolase SleB  52.17 
 
 		 216 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00420178 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3022  NLP/P60 protein  29.69 
 
 		 289 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.618403  normal  0.062405 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03561  LysM domain-containing protein  43.48 
 
 		 253 aa  49.7  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  25.96 
 
 		 511 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  29.41 
 
 		 514 aa  50.1  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1331  CHAP domain-containing protein  47.73 
 
 		 372 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.745429  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1306  CHAP domain-containing protein  47.73 
 
 		 372 aa  48.9  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.387302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3007  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  34.95 
 
 		 230 aa  49.3  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0869  LysM domain/NLP/P60 family protein  33.01 
 
 		 342 aa  48.9  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1169  NLP/P60:peptidoglycan-binding LysM  27.45 
 
 		 341 aa  48.9  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000154936  normal  0.0379935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0017  glycoside hydrolase family 18  36.54 
 
 		 428 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350058  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  24.47 
 
 		 324 aa  48.9  0.00004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0050  Peptidoglycan-binding LysM  41.3 
 
 		 507 aa  48.5  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1755  NLP/P60 protein  27.27 
 
 		 255 aa  48.9  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4010  lytic transglycosylase, catalytic  26.43 
 
 		 507 aa  48.9  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000241761  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.43 
 
 		 165 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2634  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 		 302 aa  48.5  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258799 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2843  peptidoglycan-binding LysM  44 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.175188  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  27.35 
 
 		 517 aa  48.1  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0657  Peptidoglycan-binding LysM  27.61 
 
 		 266 aa  48.1  0.00006  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03571  LysM domain-containing protein  41.3 
 
 		 253 aa  48.1  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  31.93 
 
 		 297 aa  47.8  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0532  cell wall hydrolase/autolysin  27.34 
 
 		 563 aa  48.1  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00749255  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1078  putative lipoprotein NlpD  39.34 
 
 		 283 aa  47.8  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>