More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13880 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  100 
 
 
640 aa  1319    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  48.75 
 
 
2638 aa  635  1e-180  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  50.79 
 
 
843 aa  620  1e-176  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  50.32 
 
 
843 aa  612  9.999999999999999e-175  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  50.47 
 
 
899 aa  605  9.999999999999999e-173  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  49.45 
 
 
1136 aa  600  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  46.23 
 
 
852 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  46.08 
 
 
850 aa  588  1e-167  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  46.23 
 
 
852 aa  591  1e-167  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  46.39 
 
 
852 aa  591  1e-167  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  45.72 
 
 
1043 aa  590  1e-167  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  46.08 
 
 
852 aa  588  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  45.75 
 
 
848 aa  583  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  46.39 
 
 
852 aa  581  1e-164  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  45.82 
 
 
848 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  45.66 
 
 
856 aa  573  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  46.52 
 
 
842 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  45.91 
 
 
852 aa  568  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  45.71 
 
 
841 aa  554  1e-156  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  45.12 
 
 
647 aa  549  1e-155  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  46.66 
 
 
655 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  46.49 
 
 
655 aa  531  1e-149  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  43.03 
 
 
713 aa  527  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  42.88 
 
 
713 aa  522  1e-147  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  43.87 
 
 
713 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  43.87 
 
 
713 aa  522  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  43.39 
 
 
713 aa  522  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  43.71 
 
 
713 aa  519  1e-146  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  43.87 
 
 
713 aa  521  1e-146  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  44.99 
 
 
825 aa  521  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  43.46 
 
 
713 aa  519  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  43.71 
 
 
713 aa  521  1e-146  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  42.24 
 
 
713 aa  505  1e-141  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  43.13 
 
 
1064 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  42.81 
 
 
1064 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  41.11 
 
 
712 aa  489  1e-137  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  41.9 
 
 
874 aa  483  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  41.83 
 
 
718 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  40.48 
 
 
928 aa  449  1e-125  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  39.29 
 
 
1888 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  41.03 
 
 
640 aa  410  1e-113  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  36.25 
 
 
601 aa  381  1e-104  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  38.42 
 
 
766 aa  375  1e-102  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  35.97 
 
 
669 aa  370  1e-101  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  31.86 
 
 
1117 aa  336  9e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.46 
 
 
1176 aa  317  5e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.87 
 
 
891 aa  298  3e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  30.6 
 
 
2156 aa  298  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  29.88 
 
 
1025 aa  295  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  30.18 
 
 
1062 aa  284  4.0000000000000003e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.38 
 
 
946 aa  282  1e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.07 
 
 
1035 aa  283  1e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  28.63 
 
 
991 aa  283  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  26.7 
 
 
1329 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.31 
 
 
1331 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  27.56 
 
 
1328 aa  271  2e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.89 
 
 
1855 aa  271  2.9999999999999997e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  30.72 
 
 
1942 aa  268  2.9999999999999995e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  28.88 
 
 
1429 aa  262  1e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  31.05 
 
 
776 aa  261  3e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  31.46 
 
 
1252 aa  258  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  28.49 
 
 
1472 aa  249  8e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  26.32 
 
 
998 aa  249  1e-64  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.12 
 
 
1975 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  27.58 
 
 
1450 aa  247  6e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  27.1 
 
 
1432 aa  245  1.9999999999999999e-63  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  27.6 
 
 
1248 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.9 
 
 
2068 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  26.38 
 
 
1891 aa  238  3e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  30.15 
 
 
817 aa  222  9.999999999999999e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  28.41 
 
 
1124 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5016  glycogen debranching enzyme GlgX  30.17 
 
 
706 aa  206  1e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2517  glycogen debranching enzyme  31.56 
 
 
774 aa  200  5e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.467247 
 
 
-
 
NC_002620  TC0312  glycosyl hydrolase family protein  27.68 
 
 
666 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0426975  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0296  glycogen debranching enzyme GlgX  26.28 
 
 
724 aa  195  2e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.76134  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  28.1 
 
 
711 aa  193  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  28.1 
 
 
711 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14831  putative isoamylase  27.12 
 
 
668 aa  187  5e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.451746  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0548  glycogen debranching enzyme GlgX  27.61 
 
 
729 aa  187  5e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2859  glycogen debranching enzyme GlgX  28.76 
 
 
690 aa  184  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  27.74 
 
 
718 aa  184  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  31.18 
 
 
721 aa  183  7e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  33.89 
 
 
717 aa  183  9.000000000000001e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0805  glycogen debranching enzyme GlgX  26.51 
 
 
693 aa  183  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2956  glycogen debranching enzyme GlgX  27.21 
 
 
697 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.490165 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15221  putative isoamylase  29.17 
 
 
677 aa  181  2.9999999999999997e-44  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  26.19 
 
 
721 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  31.14 
 
 
700 aa  181  4e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.48 
 
 
1440 aa  180  8e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0893  alpha amylase domain-containing protein  28.31 
 
 
686 aa  180  9e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0763625  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0815  glycogen debranching protein GlgX  27.99 
 
 
721 aa  179  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000104975 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  29.48 
 
 
1440 aa  179  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0101  alpha-amylase family protein  27.87 
 
 
714 aa  179  2e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3315  glycogen debranching enzyme GlgX  27.36 
 
 
711 aa  179  2e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1750  glycogen debranching enzyme GlgX  30.23 
 
 
718 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0647  glycogen debranching enzyme GlgX  27.85 
 
 
694 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0667  glycogen debranching enzyme GlgX  27.85 
 
 
694 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.432948  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0419  glycogen debranching enzyme GlgX  26.33 
 
 
696 aa  177  4e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2806  glycogen debranching enzyme GlgX  29.32 
 
 
718 aa  176  9.999999999999999e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.200191  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17491  putative isoamylase  27.97 
 
 
686 aa  176  1.9999999999999998e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>