More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13370 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A0751  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
860 aa  792  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3380  leucyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 
944 aa  786  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  1.07605e-07 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0609  leucyl-tRNA synthetase  46.8 
 
 
860 aa  788  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.212281  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1654  leucyl-tRNA synthetase  44.76 
 
 
857 aa  714  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.119933 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0201  leucyl-tRNA synthetase  47.05 
 
 
835 aa  787  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2588  leucyl-tRNA synthetase  46.52 
 
 
864 aa  786  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.224639  hitchhiker  2.06331e-09 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0225  leucyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 
893 aa  730  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.153759  normal  0.0782283 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1309  leucyl-tRNA synthetase  45.07 
 
 
879 aa  783  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0575  leucyl-tRNA synthetase  45.83 
 
 
864 aa  752  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.932947 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0254  leucyl-tRNA synthetase  44.04 
 
 
890 aa  737  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0479  leucyl-tRNA synthetase  43 
 
 
887 aa  714  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1376  leucyl-tRNA synthetase  45.19 
 
 
879 aa  784  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.264613  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0621  leucyl-tRNA synthetase  46.17 
 
 
864 aa  759  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.914514  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3702  leucyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
859 aa  813  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.031134  hitchhiker  5.16313e-07 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4108  leucyl-tRNA synthetase  44.95 
 
 
861 aa  756  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.978301  normal  0.593628 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0627  leucyl-tRNA synthetase  46.24 
 
 
868 aa  818  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.339775  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0662  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
860 aa  788  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0168621  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2983  leucyl-tRNA synthetase  44.68 
 
 
877 aa  751  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.957955  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01874  leucyl-tRNA synthetase  44.1 
 
 
880 aa  764  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0537  leucyl-tRNA synthetase  61.64 
 
 
826 aa  1069  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.993969  normal  0.956377 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0691  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
860 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.229457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0751  leucyl-tRNA synthetase  57.06 
 
 
824 aa  1005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2819  leucyl-tRNA synthetase  49.7 
 
 
832 aa  847  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01672  leucyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
867 aa  842  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.126917  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1056  leucyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 
599 aa  707  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  3.73347e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0808  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
860 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0764  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
860 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.544549  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0705  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
860 aa  793  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2912  leucyl-tRNA synthetase  46.28 
 
 
880 aa  792  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0665  leucyl-tRNA synthetase  45.85 
 
 
807 aa  726  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0290  leucyl-tRNA synthetase  43.88 
 
 
876 aa  725  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.609184  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0551  leucyl-tRNA synthetase  45.61 
 
 
806 aa  734  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.629594 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2116  leucyl-tRNA synthetase  56.48 
 
 
825 aa  990  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0598  leucyl-tRNA synthetase  47.55 
 
 
805 aa  745  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0244  leucyl-tRNA synthetase  62.91 
 
 
607 aa  773  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1659  leucyl-tRNA synthetase  42.81 
 
 
875 aa  723  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.141591 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0780  leucyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 
824 aa  1028  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3003  leucyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
860 aa  789  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.27573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3015  leucyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
860 aa  803  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.652989  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0668  leucyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
860 aa  788  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00449058  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0694  leucyl-tRNA synthetase  46.68 
 
 
860 aa  788  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28668  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01222  leucyl-tRNA synthetase  46.58 
 
 
862 aa  786  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0077  leucyl-tRNA synthetase  48 
 
 
904 aa  828  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.622899  hitchhiker  8.64885e-05 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1506  leucyl-tRNA synthetase  48.68 
 
 
820 aa  828  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.105078  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1446  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
894 aa  742  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1280  leucyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 
870 aa  776  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1522  leucyl-tRNA synthetase  56.54 
 
 
819 aa  982  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0710  leucyl-tRNA synthetase  49.17 
 
 
821 aa  771  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.699276  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0473  leucyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 
813 aa  727  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2926  leucyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
860 aa  803  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.454668  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0632  leucyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 
809 aa  721  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2719  leucyl-tRNA synthetase  49.58 
 
 
838 aa  853  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3415  leucyl-tRNA synthetase  50.96 
 
 
802 aa  823  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1095  leucyl-tRNA synthetase  43.05 
 
 
877 aa  738  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.768167  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3311  leucyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 
874 aa  800  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.134968  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0074  leucyl-tRNA synthetase  49.94 
 
 
821 aa  769  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3479  leucyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 
863 aa  801  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.60913e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1207  leucyl-tRNA synthetase  46.64 
 
 
860 aa  813  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.338789  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1865  leucyl-tRNA synthetase  59.78 
 
 
826 aa  1047  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.107054  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5030  leucyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
861 aa  707  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.412829 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4847  leucyl-tRNA synthetase  46.36 
 
 
868 aa  820  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0255  leucyl-tRNA synthetase  53.45 
 
 
816 aa  881  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00083346  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4570  leucyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
802 aa  806  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1579  leucyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 
901 aa  728  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  0.048228 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1842  leucyl-tRNA synthetase  46.91 
 
 
860 aa  803  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0673  leucyl-tRNA synthetase  48.8 
 
 
820 aa  828  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.343272  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2732  leucyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 
864 aa  766  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0200142  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0344  leucyl-tRNA synthetase  57.25 
 
 
828 aa  1004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.361332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6003  leucyl-tRNA synthetase  42.8 
 
 
911 aa  724  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.24225 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3447  leucyl-tRNA synthetase  45.71 
 
 
874 aa  796  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00121594 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08751  leucyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
872 aa  830  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.115344  hitchhiker  0.00155899 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4419  leucyl-tRNA synthetase  49.76 
 
 
814 aa  853  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2438  leucyl-tRNA synthetase  51.57 
 
 
865 aa  932  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000200562  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3143  leucyl-tRNA synthetase  46.22 
 
 
868 aa  806  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0606298  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3443  leucyl-tRNA synthetase  46.34 
 
 
855 aa  749  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.175272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4197  leucyl-tRNA synthetase  51.33 
 
 
859 aa  887  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3144  leucyl-tRNA synthetase  46.57 
 
 
860 aa  799  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0666  leucyl-tRNA synthetase  52.05 
 
 
805 aa  847  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1804  leucyl-tRNA synthetase  59.69 
 
 
824 aa  1051  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1425  leucyl-tRNA synthetase  56.02 
 
 
831 aa  956  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.164097  normal  0.135581 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3306  leucyl-tRNA synthetase  61.22 
 
 
828 aa  1087  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.02477e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0425  leucyl-tRNA synthetase  50.54 
 
 
801 aa  861  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0433  leucyl-tRNA synthetase  50.58 
 
 
859 aa  863  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0323197 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0833  leucyl-tRNA synthetase  49.29 
 
 
857 aa  813  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  1.49617e-06  hitchhiker  1.03499e-06 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0682  leucyl-tRNA synthetase  47.04 
 
 
930 aa  718  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.63979  normal  0.105643 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0057  leucyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 
829 aa  964  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.300018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1197  leucyl-tRNA synthetase  47.59 
 
 
800 aa  755  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000558388  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01850  leucyl-tRNA synthetase  50.52 
 
 
861 aa  875  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0480687 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06780  leucyl-tRNA synthetase  50.29 
 
 
852 aa  838  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2882  leucyl-tRNA synthetase  52.14 
 
 
856 aa  910  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0606181  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1322  leucyl-tRNA synthetase  47.34 
 
 
815 aa  784  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0766  leucyl-tRNA synthetase  57.3 
 
 
824 aa  1012  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1744  leucyl-tRNA synthetase  47.89 
 
 
818 aa  823  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.123788  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6458  leucyl-tRNA synthetase  43.56 
 
 
854 aa  716  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004217  leucyl-tRNA synthetase  47.37 
 
 
857 aa  798  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  8.07673e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1033  leucyl-tRNA synthetase  50.17 
 
 
875 aa  860  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.229858 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3332  leucyl-tRNA synthetase  46.75 
 
 
831 aa  783  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2429  leucyl-tRNA synthetase  47.77 
 
 
820 aa  811  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.83241 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2055  leucyl-tRNA synthetase  50.64 
 
 
853 aa  868  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1074  leucyl-tRNA synthetase  51.24 
 
 
875 aa  854  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.902773 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>