105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_13000 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_13000  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 235 aa  459  9.999999999999999e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0982  ABC-2 type transporter  45.96 
 
 		 235 aa  216  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0296  ABC-2 type transporter  46.09 
 
 		 234 aa  189  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2367  hypothetical protein  35.92 
 
 		 287 aa  175  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00928576  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2204  ABC-type transport system involved in multi- copper enzyme maturation, permease component  34.2 
 
 		 235 aa  160  2e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000479866  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1754  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  33.07 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.513329  normal  0.144736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2707  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation, permease component  35.74 
 
 		 240 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000874491  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3077  ABC transporter, permease protein, putative  30.92 
 
 		 251 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.326034  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2412  ABC-2 type transporter  32.41 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.62011  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4390  ABC-2 type transporter  35.06 
 
 		 260 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0235971 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1769  ABC-2 type transporter  35.09 
 
 		 235 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.434129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3143  ABC-2 type transporter  34.85 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16880  putative permease of ABC transporter  33.07 
 
 		 244 aa  119  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2811  putative ABC transporter, permease protein  32.19 
 
 		 247 aa  119  3.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291382  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3072  hypothetical protein  33.87 
 
 		 243 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08366  ABC transporter, permease protein  31.09 
 
 		 242 aa  118  7e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  decreased coverage  0.00446835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2841  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility auxiliary component-like  32.2 
 
 		 977 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00280772  normal  0.38274 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39210  ABC-2 type transport system permease  32.28 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0705149  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4024  ABC-2 type transporter  34.22 
 
 		 267 aa  115  6e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166425 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2722  hypothetical protein  30.99 
 
 		 241 aa  114  8.999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.619181  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3237  ABC-2 type transporter  33.89 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0727284 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1398  cytochrome c-type biogenesis protein CcmB  34.78 
 
 		 244 aa  113  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1468  ABC transporter permease  31.5 
 
 		 244 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6080  ABC-2 type transporter  34.6 
 
 		 242 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1562  ABC transporter, permease protein  34.71 
 
 		 244 aa  112  6e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0917389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11610  ABC transporter permease  30.49 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0088  hypothetical protein  31.02 
 
 		 253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.754127  normal  0.283193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1067  hypothetical protein  31.38 
 
 		 244 aa  108  5e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2428  putative ABC-2 type transporter permease  33.08 
 
 		 270 aa  108  6e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5379  ABC-type uncharacterized transport system  32.47 
 
 		 998 aa  106  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5656  ABC-type uncharacterized transport system  33.53 
 
 		 770 aa  105  5e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.319473 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0004  hypothetical protein  28.3 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.750522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2645  ABC transporter, permease protein, putative  31.08 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.691836  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4184  ABC-2 type transporter  31.49 
 
 		 256 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1018  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1047  ABC-2 type transporter  29.64 
 
 		 261 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0215536  unclonable  0.00000000290694 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0375  ABC transporter, inner membrane protein  30.25 
 
 		 964 aa  100  1e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0792117  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0221  hypothetical protein  31.38 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.478655 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1546  ABC transporter permease; gliding motility-associated protein  29.75 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000287593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0780  putative membrane spanning protein  29.22 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6627  gliding motility-associated ABC transporter permease protein GldF  34.55 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.11106 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2141  ABC transporter, inner membrane protein  33.19 
 
 		 972 aa  99  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0919791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2203  ABC-type uncharacterized transport system involved in gliding motility, auxiliary component-like protein  32.39 
 
 		 891 aa  94.4  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.775873  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4231  putative ABC-2 type transport system permease protein  31.94 
 
 		 270 aa  90.1  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4470  ABC transporter permease; gliding motility- associated protein  31.82 
 
 		 242 aa  89.4  5e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.230203 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2908  putative ABC-2 type transport system permease protein  29.27 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2069  ABC-2 type transporter  35.78 
 
 		 234 aa  86.7  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1946  protein involved in gliding motility GldF  31.93 
 
 		 239 aa  85.5  7e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0067  ABC transporter permease  29.13 
 
 		 269 aa  84.3  0.000000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.421472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0231  ABC transporter, permease protein  27.57 
 
 		 244 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1356  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  30.52 
 
 		 748 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0584  putative ABC-2 type transport system permease protein  27.27 
 
 		 244 aa  81.3  0.00000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.757639  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2646  ABC transporter, permease protein, putative  27.98 
 
 		 250 aa  79.7  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3052  ABC-type transport system involved in multi-copper enzyme maturation permease component  29.44 
 
 		 767 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2113  hypothetical protein  31.15 
 
 		 248 aa  78.6  0.00000000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0683  ABC transporter, permease protein, putative  25.4 
 
 		 248 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.65169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2668  ABC-2 type transporter  28.98 
 
 		 768 aa  69.7  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.530325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2944  hypothetical protein  29.73 
 
 		 736 aa  69.3  0.00000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0990  ABC transporter, permease protein, putative  26.79 
 
 		 231 aa  60.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  30.84 
 
 		 916 aa  52.8  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1151  ABC transporter related  30.4 
 
 		 994 aa  50.8  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.64731  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2156  ABC transporter related  32.14 
 
 		 1106 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0261  ABC transporter, permease protein, putative  32.12 
 
 		 357 aa  48.5  0.00009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.822784  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1782  hypothetical protein  25 
 
 		 278 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000438191  normal  0.644022 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3689  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 384 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.093618  normal  0.708678 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69070  putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter  27.56 
 
 		 916 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4162  ABC-2 type transporter  30.43 
 
 		 384 aa  46.2  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.80712  normal  0.28462 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1746  ABC efflux pump, inner membrane subunit  29.57 
 
 		 384 aa  45.8  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0249268  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  28.42 
 
 		 1071 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  28.42 
 
 		 1082 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0348  multidrug ABC transporter permease component  29.51 
 
 		 384 aa  45.8  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  28.42 
 
 		 1071 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  28.42 
 
 		 1089 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  28.42 
 
 		 1066 aa  45.8  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  28.42 
 
 		 1079 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  26.4 
 
 		 911 aa  45.4  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4352  ABC-2 type transporter  29.93 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0221768  normal  0.727752 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  28.42 
 
 		 1017 aa  45.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1107  ABC-2 type transporter  29.41 
 
 		 368 aa  45.1  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.502812 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  27.59 
 
 		 919 aa  43.9  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5974  putative ABC transporter ATP-binding protein/permease  24.8 
 
 		 916 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  35.11 
 
 		 368 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1791  ABC-2 transporter component  30.7 
 
 		 376 aa  43.1  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.386865  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  26.72 
 
 		 930 aa  43.5  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  25.6 
 
 		 927 aa  43.5  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4695  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 		 370 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.595113 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 		 378 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0131  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 		 378 aa  43.1  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.110874  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  25.86 
 
 		 936 aa  42.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 		 368 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  36.17 
 
 		 368 aa  43.1  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  25.86 
 
 		 936 aa  42.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1738  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 		 372 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2945  ABC-2 type transporter  32.98 
 
 		 378 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.485374  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1722  hypothetical protein  35.29 
 
 		 309 aa  42.7  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  29.51 
 
 		 377 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0407  hypothetical protein  27.87 
 
 		 382 aa  42.4  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10374  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1327  ABC-2 type transporter  31.3 
 
 		 384 aa  42.4  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4327  ABC-2 type transporter  28.7 
 
 		 378 aa  42.4  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0054  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 		 388 aa  42.4  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>