More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12030 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  100 
 
 
450 aa  919    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  63.02 
 
 
437 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  57.66 
 
 
447 aa  531  1e-150  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  56.12 
 
 
438 aa  519  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  57.91 
 
 
441 aa  515  1.0000000000000001e-145  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  57.79 
 
 
435 aa  510  1e-143  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2590  recombination factor protein RarA  60.48 
 
 
422 aa  501  1e-140  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000937072  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  56.91 
 
 
458 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  58.82 
 
 
432 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.78 
 
 
739 aa  491  1e-137  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  55.16 
 
 
731 aa  481  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0016  recombination factor protein RarA  55.32 
 
 
441 aa  481  1e-134  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.901386  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2304  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  54.17 
 
 
721 aa  479  1e-134  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.320416 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  56.75 
 
 
444 aa  479  1e-134  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0792  AAA ATPase central domain protein  52.9 
 
 
431 aa  475  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  54.82 
 
 
459 aa  478  1e-133  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  52.51 
 
 
435 aa  469  1.0000000000000001e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02651  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.86 
 
 
735 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1061  recombination factor protein RarA  54.25 
 
 
441 aa  468  9.999999999999999e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.327503  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  55.12 
 
 
432 aa  464  1e-129  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0388  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.38 
 
 
733 aa  463  1e-129  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.211044  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  53.21 
 
 
435 aa  463  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  52.79 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  51.16 
 
 
432 aa  460  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0463  recombination factor protein RarA  52.39 
 
 
440 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000023762  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  52.07 
 
 
457 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  51.84 
 
 
457 aa  457  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.61 
 
 
726 aa  457  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  51.35 
 
 
441 aa  456  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  52.53 
 
 
448 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00871  recombination factor protein RarA  50.23 
 
 
455 aa  447  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0752794  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2031  AAA ATPase central domain protein  52.46 
 
 
447 aa  447  1.0000000000000001e-124  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.039319  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3766  recombination factor protein RarA  50.35 
 
 
446 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.369587 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  52.06 
 
 
434 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 
432 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  50.94 
 
 
443 aa  442  1e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  51.15 
 
 
457 aa  443  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2132  AAA ATPase central domain protein  52.57 
 
 
463 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000588224  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  51.37 
 
 
434 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  49.77 
 
 
439 aa  438  1e-121  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0141  ATPase central domain-containing protein  51.77 
 
 
416 aa  434  1e-120  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16380  Recombination protein MgsA  49.32 
 
 
461 aa  432  1e-120  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.8867  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01421  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  48.96 
 
 
734 aa  429  1e-119  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.869861  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  49.31 
 
 
447 aa  431  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2081  recombination factor protein RarA  52.85 
 
 
441 aa  430  1e-119  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2635  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 
429 aa  429  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3217  recombination factor protein RarA  48.35 
 
 
519 aa  426  1e-118  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0809903  normal  0.976548 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  47.51 
 
 
447 aa  426  1e-118  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2050  AAA ATPase central domain-containing protein  51.81 
 
 
436 aa  423  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1441  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  49.18 
 
 
734 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.641024  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1824  recombination factor protein RarA  51.54 
 
 
477 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00142888  normal  0.964955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1815  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 
502 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.233507  hitchhiker  0.0000173761 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  46.7 
 
 
463 aa  422  1e-117  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  48.19 
 
 
445 aa  422  1e-117  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  46.91 
 
 
451 aa  422  1e-117  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2558  AAA ATPase central domain protein  50.22 
 
 
446 aa  421  1e-116  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  52.04 
 
 
423 aa  419  1e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1691  recombination factor protein RarA  48.76 
 
 
465 aa  421  1e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2325  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 
445 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.90539  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2364  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 
445 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.602751  normal  0.774501 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07770  Recombination protein MgsA  51.15 
 
 
446 aa  420  1e-116  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.138045 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2372  recombination factor protein RarA  49.65 
 
 
445 aa  420  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1974  AAA ATPase central domain protein  49.88 
 
 
456 aa  417  9.999999999999999e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.381905  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  49.16 
 
 
453 aa  412  1e-114  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6097  recombination factor protein RarA  50.68 
 
 
436 aa  413  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.159169  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3088  AAA ATPase central domain protein  50.8 
 
 
456 aa  414  1e-114  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3309  AAA ATPase central domain protein  49.54 
 
 
494 aa  412  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000347883  normal  0.0560035 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3161  AAA ATPase central domain protein  48.64 
 
 
445 aa  412  1e-114  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1333  recombination factor protein RarA  48.73 
 
 
500 aa  413  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.272452  normal  0.489107 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  48.94 
 
 
445 aa  411  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3882  AAA ATPase central domain-containing protein  49.19 
 
 
448 aa  411  1e-113  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.781323 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5272  recombination factor protein RarA  47.84 
 
 
448 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  47.55 
 
 
446 aa  410  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05070  Recombination protein MgsA  51.41 
 
 
435 aa  407  1.0000000000000001e-112  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.395442  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2010  AAA ATPase central domain protein  48.45 
 
 
484 aa  408  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.105628  normal  0.523628 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12580  recombination factor protein RarA  50.59 
 
 
452 aa  403  1e-111  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.214264 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0832  recombination factor protein RarA  47.21 
 
 
454 aa  402  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 
437 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1199  AAA ATPase central domain protein  50.34 
 
 
428 aa  403  1e-111  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  50.82 
 
 
429 aa  403  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 
459 aa  402  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0452  AAA ATPase central domain protein  49.52 
 
 
443 aa  404  1e-111  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  47.36 
 
 
447 aa  402  1e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2404  recombination factor protein RarA  49.19 
 
 
456 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.150461  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  48.51 
 
 
437 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  48.12 
 
 
485 aa  402  1e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0627  recombination factor protein RarA  47.31 
 
 
449 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0620237  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003877  ATPase AAA family  46.73 
 
 
449 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000221838  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4246  recombination factor protein RarA  47.8 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0255424  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  47.02 
 
 
447 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3111  recombination factor protein RarA  46.93 
 
 
428 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.016045  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  47.13 
 
 
457 aa  400  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12760  recombination factor protein RarA  50 
 
 
465 aa  399  9.999999999999999e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.294411  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  48.28 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0488  recombination factor protein RarA  49.15 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000395701  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4519  recombination factor protein RarA  48.05 
 
 
428 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.002942  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  48.53 
 
 
505 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3035  recombination factor protein RarA  50.94 
 
 
456 aa  399  9.999999999999999e-111  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25425  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  47.14 
 
 
434 aa  397  1e-109  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2022  recombination factor protein RarA  45.83 
 
 
443 aa  397  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000134258  hitchhiker  0.0000234257 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>