97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_12000 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_12000  putative rRNA methylase  100 
 
 
196 aa  400  1e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000449414  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3423  putative rRNA methylase  49.46 
 
 
190 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5002  hypothetical protein  49.2 
 
 
190 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.687939  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4647  hypothetical protein  49.2 
 
 
190 aa  192  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4872  hypothetical protein  49.2 
 
 
190 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4482  SAM-dependent methyltransferase  49.2 
 
 
190 aa  192  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4886  hypothetical protein  49.2 
 
 
190 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4862  hypothetical protein  49.2 
 
 
190 aa  191  4e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0375  hypothetical protein  49.2 
 
 
190 aa  191  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4500  SAM-dependent methyltransferase  48.66 
 
 
190 aa  191  6e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4893  hypothetical protein  49.2 
 
 
190 aa  190  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4580  putative rRNA methylase  48.13 
 
 
190 aa  188  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0696  putative rRNA methylase  50.28 
 
 
188 aa  177  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2770  putative rRNA methylase  45.6 
 
 
191 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00973946  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0095  methyltransferase (putative)  43.17 
 
 
195 aa  167  7e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.105134  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1022  putative rRNA methylase  43.78 
 
 
200 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1082  putative rRNA methylase  45.05 
 
 
185 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000102664  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1741  putative rRNA methylase  46.07 
 
 
188 aa  164  9e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0690  hypothetical protein  43.41 
 
 
189 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.42595  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1203  putative rRNA methylase  40.66 
 
 
187 aa  161  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3358  putative rRNA methylase  40.88 
 
 
192 aa  160  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000432996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0662  putative rRNA methylase  40.43 
 
 
195 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0887  putative rRNA methylase  40.88 
 
 
195 aa  157  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.94545e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0153  putative rRNA methylase  42.47 
 
 
190 aa  156  2e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.854086  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0564  putative rRNA methylase  41.67 
 
 
196 aa  155  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.427822  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1851  hypothetical protein  48.35 
 
 
187 aa  155  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.002601  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1816  hypothetical protein  48.35 
 
 
187 aa  155  4e-37  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.185209  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  40.33 
 
 
1128 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2114  putative rRNA methylase  40.48 
 
 
243 aa  151  5.9999999999999996e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3179  putative rRNA methylase  45.25 
 
 
200 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2581  putative rRNA methylase  41.4 
 
 
209 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1400  hypothetical protein  42.31 
 
 
188 aa  149  2e-35  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1321  hypothetical protein  43.41 
 
 
187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.626127  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1610  rRNA methylase (SAM-dependent methyltransferase superfamily), putative  41.21 
 
 
182 aa  142  3e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3485  putative rRNA methylase  37.43 
 
 
193 aa  141  5e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.894221  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1515  putative rRNA methylase  43.45 
 
 
194 aa  138  3.9999999999999997e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.213957  normal  0.617269 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2602  hypothetical protein  37.38 
 
 
211 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0960  putative rRNA methylase  41.57 
 
 
235 aa  133  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1148  hypothetical protein  36.52 
 
 
183 aa  131  5e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00028525  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1337  hypothetical protein  36.52 
 
 
183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339513  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0217  hypothetical protein  35.08 
 
 
194 aa  119  3e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.624522  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2381  rRNA methylase domain-containing protein  33.68 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0213  putative rRNA methylase  37.42 
 
 
181 aa  114  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1670  putative rRNA methylase  39.26 
 
 
201 aa  108  3e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0543  putative rRNA methylase  38.18 
 
 
196 aa  106  2e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.313767  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0073  putative rRNA methylase  32.94 
 
 
225 aa  96.3  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42440  predicted protein  27.65 
 
 
475 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.727315  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1507  hypothetical protein  33.08 
 
 
184 aa  57.8  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2653  methyltransferase type 11  23.04 
 
 
210 aa  49.3  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.240915  normal  0.794534 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.89 
 
 
234 aa  48.9  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000360433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.48 
 
 
287 aa  47.8  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2231  tRNA (adenine-57, 58-N(1)-) methyltransferase  23.73 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000396256 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1668  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.77 
 
 
316 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1003  methyltransferase type 11  35.16 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00822165  normal  0.0267075 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_27308  predicted protein  24.44 
 
 
247 aa  46.6  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0633  SAM-dependent methyltransferase  27.82 
 
 
173 aa  46.6  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4103  methyltransferase type 12  26.97 
 
 
586 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.6 
 
 
241 aa  46.2  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1151  SAM-dependent methyltransferase for cell envelope biogenesis  36.63 
 
 
314 aa  46.2  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1228  arsenite S-adenosylmethyltransferase  34.88 
 
 
277 aa  45.4  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1509  Methyltransferase type 11  36.67 
 
 
186 aa  45.4  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0861  putative methyltransferase  36.36 
 
 
199 aa  45.1  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000766144  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3788  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.77 
 
 
314 aa  44.7  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20330  methyltransferase small  27.88 
 
 
246 aa  43.5  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.349478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0347  Fmu (Sun) domain protein  24.81 
 
 
434 aa  43.5  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0799  methyltransferase type 11  23.33 
 
 
195 aa  43.9  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1420  arsenite S-adenosylmethyltransferase  35.43 
 
 
280 aa  43.5  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1139  S-adenosyl-methyltransferase MraW  35.37 
 
 
315 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.148614  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0225  tRNA methyltransferase complex GCD14 subunit  26.21 
 
 
263 aa  43.9  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000107997  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1202  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  35.43 
 
 
277 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0298  Fmu (Sun) domain-containing protein  27.22 
 
 
437 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0159  S-adenosyl-methyltransferase MraW  30.77 
 
 
316 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.852546  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0285  S-adenosyl-methyltransferase MraW  28.97 
 
 
315 aa  42.7  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1572  S-adenosyl-methyltransferase MraW  25.84 
 
 
291 aa  43.1  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04221  Sun protein (Fmu protein)  25.53 
 
 
432 aa  43.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00198  methyltransferase  27.86 
 
 
280 aa  42.7  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.524751  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3638  S-adenosyl-methyltransferase MraW  26.97 
 
 
313 aa  42.4  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.412621 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1722  putative metallothionein SmtA  22.69 
 
 
261 aa  42.7  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0650  methyltransferase type 11  21.92 
 
 
424 aa  42.4  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.541697  normal  0.369974 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1114  NOL1/NOP2/Sun family protein  26.52 
 
 
419 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206178 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6795  protein-L-isoaspartate(D-aspartate)O- methyltransferase  29.58 
 
 
390 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.794475  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0271  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.6 
 
 
251 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  26 
 
 
451 aa  42.4  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3641  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.6 
 
 
251 aa  42  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  25.33 
 
 
258 aa  42.4  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3945  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.6 
 
 
251 aa  42  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3189  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
187 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1076  Acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II-like protein  28.92 
 
 
176 aa  42  0.006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3600  S-adenosyl-methyltransferase MraW  29.67 
 
 
314 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0577  Fmu (Sun) domain-containing protein  26.32 
 
 
419 aa  41.6  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.124221 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2118  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.02 
 
 
250 aa  41.2  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.660073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6087  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 
263 aa  41.2  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0287  methyltransferase type 11  25.83 
 
 
195 aa  41.2  0.01  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0248  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  24.6 
 
 
251 aa  41.2  0.01  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.205211 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubiE  23.02 
 
 
250 aa  41.2  0.01  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.46 
 
 
270 aa  41.2  0.01  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>