More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11630 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11630  TrkA-C domain protein  100 
 
 
207 aa  419  1e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0254  TrkA-N domain protein  43.23 
 
 
221 aa  186  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.153232 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1261  TrkA domain-containing protein  42.29 
 
 
219 aa  171  6.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1728  TrkA domain-containing protein  42.61 
 
 
218 aa  149  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000194267  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1655  TrkA domain-containing protein  41.48 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000867889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0242  TrkA-N domain protein  35.23 
 
 
221 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0806  TrkA-N domain protein  33.16 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1348  hypothetical protein  35.64 
 
 
220 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0533287  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0025  TrkA domain-containing protein  33.87 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0026  potassium uptake protein, putative  35.75 
 
 
221 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.311155  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_25  cation transport protein, Trk system  33.33 
 
 
221 aa  124  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00178783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2082  TrkA-N domain protein  35.36 
 
 
218 aa  121  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.124657  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1686  TrkA domain-containing protein  33.68 
 
 
219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0415019  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1794  hypothetical protein  31.25 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0638  TrkA-N  36.42 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1924  TrkA-N domain protein  30.41 
 
 
231 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3126  potassium transporter peripheral membrane component  34.74 
 
 
458 aa  112  3e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.779559 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2407  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 
220 aa  112  3e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.163912  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2912  TrkA-N domain protein  32.96 
 
 
223 aa  112  6e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.031815  normal  0.106659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3071  TrkA domain-containing protein  32.43 
 
 
220 aa  111  9e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2661  TrkA domain-containing protein  30.54 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.202256  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3062  TrkA domain-containing protein  34.59 
 
 
227 aa  110  2.0000000000000002e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.793731  hitchhiker  0.00379917 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3757  TrkA-N domain protein  31.41 
 
 
217 aa  109  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000992935  normal  0.446525 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2907  potassium transporter peripheral membrane component  33.33 
 
 
450 aa  104  7e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000237268  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1520  TrkA-N domain protein  34.66 
 
 
218 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.498959  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2256  TrkA-N domain protein  34.78 
 
 
218 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.13318  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0542  TrkA-N domain protein  26.55 
 
 
215 aa  102  3e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.840001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1712  TrkA-N domain protein  30.73 
 
 
219 aa  102  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.887824  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1272  potassium transporter peripheral membrane component  29.29 
 
 
443 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0221885  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5192  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 
259 aa  98.2  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0506525  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2286  TrkA-N domain-containing protein  29.38 
 
 
219 aa  97.8  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.241613 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2196  TrkA-N  32.3 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2242  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.081798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2185  TrkA domain-containing protein  32.3 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314676  normal  0.0103731 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1322  TrkA-like  31.28 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.465813 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0251  TrkA-N domain protein  32.52 
 
 
225 aa  95.5  5e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00290  K+ transport system, NAD-binding component  31.82 
 
 
226 aa  95.1  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12707  trk system potassium uptake protein ceoC  29.47 
 
 
220 aa  94.7  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.44928  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1399  TrkA domain-containing protein  30.91 
 
 
233 aa  93.6  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2472  TrkA domain-containing protein  30.12 
 
 
221 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.293275  normal  0.959562 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6760  K+ transport systems NAD-binding component-like protein  28.49 
 
 
223 aa  92.8  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0522309 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1561  TrkA-N domain protein  30.21 
 
 
219 aa  92.8  3e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.534326  normal  0.490374 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3928  TrkA domain-containing protein  31.06 
 
 
221 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0399436  normal  0.479008 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01280  K+ transport system, NAD-binding component  30.77 
 
 
225 aa  92.4  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2904  TrkA domain-containing protein  29.78 
 
 
223 aa  92.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4396  potassium transporter peripheral membrane component  30.85 
 
 
458 aa  91.7  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0641614  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1707  TrkA-N domain protein  28.09 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.102172  normal  0.0591298 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1640  TrkA domain-containing protein  31.06 
 
 
253 aa  90.9  1e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0557692  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1876  TrkA-N domain protein  29.61 
 
 
220 aa  89.4  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.416785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1918  TrkA-N domain protein  29.21 
 
 
224 aa  89.4  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.388192  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1633  TrkA-N domain protein  29.65 
 
 
299 aa  89.4  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000189765 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0266  potassium transporter peripheral membrane component  30.17 
 
 
445 aa  89.4  4e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1641  TrkA-N domain protein  31.29 
 
 
233 aa  88.6  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  0.0943946 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1406  TrkA-N domain protein  26.8 
 
 
225 aa  88.2  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.699899  normal  0.545013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1941  TrkA-N domain protein  28.09 
 
 
241 aa  87.8  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0298197 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1450  TrkA domain-containing protein  28.65 
 
 
229 aa  87.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0807714  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1944  TrkA domain-containing protein  28.8 
 
 
222 aa  87  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.772638 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2267  TrkA-N domain protein  27.98 
 
 
459 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.634076  hitchhiker  0.00765776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1485  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 
229 aa  87  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0637531  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4528  TrkA-N domain-containing protein  29.1 
 
 
222 aa  85.9  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.468661  normal  0.813202 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1681  potassium transporter peripheral membrane component  28.33 
 
 
458 aa  86.3  3e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16160  K+ transport system, NAD-binding component  28.09 
 
 
249 aa  86.3  3e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.534565  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1489  hypothetical protein  29.06 
 
 
218 aa  86.7  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00984888  normal  0.0109156 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13080  K+ transport system, NAD-binding component  28.41 
 
 
227 aa  84.7  8e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0024035  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1469  TrkA-N domain protein  28.65 
 
 
454 aa  83.6  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1920  TrkA domain-containing protein  26.73 
 
 
224 aa  82.4  0.000000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2085  TrkA-N domain protein  28.09 
 
 
444 aa  82.4  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0505  TrkA domain-containing protein  26.06 
 
 
229 aa  82  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2218  potassium transporter peripheral membrane component  32.96 
 
 
446 aa  81.6  0.000000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000230921 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1213  TrkA-N domain protein  30.22 
 
 
228 aa  80.9  0.00000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4082  potassium transporter peripheral membrane component  27.66 
 
 
467 aa  80.9  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3072  TrkA domain-containing protein  28.81 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2406  TrkA domain-containing protein  27.68 
 
 
214 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.716891  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0914  potassium transporter peripheral membrane component  30.61 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2911  potassium transporter peripheral membrane component  29.21 
 
 
449 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000908908  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5999  potassium transporter peripheral membrane component  28.36 
 
 
485 aa  79  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0135992 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1809  TrkA domain-containing protein  28.34 
 
 
221 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1445  potassium transporter peripheral membrane component  30.86 
 
 
457 aa  78.2  0.00000000000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000607771 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1071  TrkA domain-containing protein  28.34 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.551527  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0846  TrkA domain-containing protein  27.96 
 
 
221 aa  77.4  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.391871  normal  0.188053 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0699  TrkA-N domain protein  28.25 
 
 
444 aa  77  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2479  TrkA-N domain protein  28.09 
 
 
445 aa  76.3  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0911  TrkA domain-containing protein  26.74 
 
 
221 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.347676  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3424  potassium transporter peripheral membrane component  26.9 
 
 
448 aa  75.5  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.361163 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12243  putative potassium uptake protein  28.49 
 
 
449 aa  75.1  0.0000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1209  potassium transporter peripheral membrane component  28.25 
 
 
448 aa  74.7  0.0000000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.356485  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1615  potassium transporter peripheral membrane component  29.61 
 
 
458 aa  75.1  0.0000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1216  TrkA-N domain protein  29.67 
 
 
229 aa  74.7  0.0000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1877  potassium transporter peripheral membrane component  28.65 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.113601 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2849  potassium transporter peripheral membrane component  25.54 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.336578  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2030  potassium transporter peripheral membrane component  23.65 
 
 
465 aa  73.9  0.000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0693486  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1186  potassium transporter peripheral membrane component  27.46 
 
 
445 aa  73.9  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.596494  decreased coverage  0.00000028569 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00394  potassium transporter peripheral membrane component  27.42 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1093  potassium transporter peripheral membrane component  30.38 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0734  TrkA-N domain protein  28.95 
 
 
450 aa  73.2  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002054  Trk system potassium uptake protein TrkA  26.88 
 
 
458 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1454  TrkA-N domain protein  27.62 
 
 
443 aa  72.4  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4514  potassium transporter peripheral membrane component  26.06 
 
 
458 aa  72.4  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00906883  hitchhiker  0.00000865676 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3885  potassium transporter peripheral membrane component  26.06 
 
 
458 aa  72  0.000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0054195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1072  potassium transporter peripheral membrane component  28.65 
 
 
458 aa  72  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>