More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11560 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  100 
 
 
389 aa  790    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0889  LL-diaminopimelate aminotransferase  60.57 
 
 
390 aa  494  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000010407  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  59.64 
 
 
392 aa  489  1e-137  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.45 
 
 
391 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  56.25 
 
 
384 aa  462  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  54.59 
 
 
388 aa  463  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1603  LL-diaminopimelate aminotransferase  58.27 
 
 
392 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0791506  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  55.53 
 
 
385 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  55.03 
 
 
382 aa  449  1e-125  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.23 
 
 
385 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  53 
 
 
388 aa  442  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  52.76 
 
 
382 aa  442  1e-123  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1080  aminotransferase class I and II  53.14 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.695177  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  53.28 
 
 
390 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  53.02 
 
 
388 aa  437  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.31 
 
 
387 aa  433  1e-120  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  51.99 
 
 
382 aa  431  1e-120  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  51.71 
 
 
388 aa  429  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.09 
 
 
388 aa  429  1e-119  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  54.45 
 
 
389 aa  426  1e-118  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  51.06 
 
 
382 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  47.67 
 
 
403 aa  421  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  50.51 
 
 
390 aa  418  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0801  aminotransferase, class I and II  52.08 
 
 
384 aa  418  9.999999999999999e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  48.19 
 
 
402 aa  416  9.999999999999999e-116  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  49.49 
 
 
391 aa  414  1e-114  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.727411 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  47.42 
 
 
400 aa  411  1e-113  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  47.56 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  47.3 
 
 
394 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  45.6 
 
 
392 aa  402  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  49.87 
 
 
389 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  44.59 
 
 
391 aa  392  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  46.72 
 
 
386 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3257  aminotransferase class I and II  49.48 
 
 
387 aa  384  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.938487  normal  0.10619 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  43.8 
 
 
388 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1035  aminotransferase class I and II  43.68 
 
 
391 aa  362  5.0000000000000005e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  44.44 
 
 
390 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4143  transaminase  44.27 
 
 
392 aa  355  6.999999999999999e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0314464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1251  aminotransferase class I and II  43.98 
 
 
392 aa  355  7.999999999999999e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4102  transaminase  44.27 
 
 
392 aa  354  2e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00097104  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  40.68 
 
 
397 aa  354  2e-96  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3945  transaminase  44 
 
 
392 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.171083  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3777  transaminase  44 
 
 
392 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.877823  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4254  transaminase  44 
 
 
392 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2313  aminotransferase class I and II  41.82 
 
 
393 aa  351  1e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4056  transaminase  44 
 
 
392 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0348  transaminase  44.33 
 
 
392 aa  351  1e-95  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3864  transaminase  43.2 
 
 
406 aa  350  4e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014398  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3791  transaminase  43.73 
 
 
392 aa  349  4e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000109781  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0381  aminotransferase class I and II  43.98 
 
 
389 aa  348  7e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1744  transaminase  43.39 
 
 
395 aa  348  8e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4164  transaminase  43.47 
 
 
392 aa  348  8e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000135509  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2734  transaminase  42.59 
 
 
396 aa  347  3e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000021809  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  40.41 
 
 
394 aa  346  3e-94  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  39.27 
 
 
395 aa  346  4e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1438  aminotransferase class I and II  42.11 
 
 
399 aa  346  5e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0371887  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0126  aminotransferase  41.73 
 
 
400 aa  345  6e-94  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  40.16 
 
 
394 aa  345  8e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1569  aminotransferase  42.53 
 
 
397 aa  344  2e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1415  aminotransferase  42.53 
 
 
397 aa  343  2.9999999999999997e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0598  aminotransferase  40.67 
 
 
394 aa  342  5e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1095  transaminase  42.4 
 
 
392 aa  342  7e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  41.88 
 
 
393 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  41.88 
 
 
393 aa  341  1e-92  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1755  aminotransferase  40.41 
 
 
421 aa  340  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000260534  normal  0.139744 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0018  transaminase  42.6 
 
 
394 aa  338  9e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 
409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  40.16 
 
 
393 aa  336  5e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1928  aminotransferase class I and II  37.4 
 
 
390 aa  336  5e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1447  aminotransferase class I and II  43 
 
 
398 aa  335  5.999999999999999e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000395976  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0499  transaminase  42.08 
 
 
393 aa  335  9e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000751793  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2945  aminotransferase class I and II  41.04 
 
 
425 aa  334  1e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0558031  hitchhiker  0.0087233 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1252  aminotransferase  40.68 
 
 
396 aa  332  9e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000164192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2278  aminotransferase  41.86 
 
 
405 aa  332  9e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0874685  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2411  aminotransferase  41.84 
 
 
413 aa  331  1e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.306249  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1923  aminotransferase  40.83 
 
 
405 aa  330  2e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.351936  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3016  aminotransferase  39.74 
 
 
406 aa  330  3e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562115  normal  0.892356 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  40.41 
 
 
394 aa  329  4e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0292  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 
402 aa  328  8e-89  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1394  aminotransferase class I and II  40.26 
 
 
408 aa  328  1.0000000000000001e-88  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0292  aminotransferase class I and II  40.53 
 
 
391 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  39.21 
 
 
412 aa  327  2.0000000000000001e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1299  aminotransferase  38.96 
 
 
403 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.202717  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  40.26 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1544  aminotransferase  41.19 
 
 
405 aa  326  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.553471  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1823  aminotransferase  39.9 
 
 
407 aa  325  6e-88  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  39.12 
 
 
388 aa  325  7e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0218  aspartate aminotransferase  41.39 
 
 
401 aa  325  8.000000000000001e-88  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1275  aminotransferase  40.67 
 
 
406 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.131096  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1238  aminotransferase  40.67 
 
 
406 aa  324  1e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0418526  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  38.85 
 
 
412 aa  324  1e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  38.68 
 
 
411 aa  325  1e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.116672 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  38.95 
 
 
412 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  38.95 
 
 
412 aa  324  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1738  aminotransferase  40.93 
 
 
405 aa  324  2e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.990718  normal  0.152146 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1454  aminotransferase  40.31 
 
 
405 aa  323  2e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  hitchhiker  0.000434542 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  38.95 
 
 
412 aa  324  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  38.95 
 
 
412 aa  324  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1267  aspartate aminotransferase  41.39 
 
 
404 aa  324  2e-87  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0259449 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  38.95 
 
 
412 aa  324  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>