33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_11460 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_11460  Peptidoglycan-binding LysM  100 
 
 		 120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  4.10627e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1505  Peptidoglycan-binding LysM  33.85 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000000220754 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1568  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36.67 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00208816 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1692  Peptidoglycan-binding LysM  41.18 
 
 		 96 aa  55.1  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000329213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2119  cell division suppressor protein YneA  30.23 
 
 		 101 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1469  peptidoglycan-binding LysM  32.26 
 
 		 166 aa  52.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.14354  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2151  peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 180 aa  50.8  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.174224  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2432  Peptidoglycan-binding LysM  37.74 
 
 		 116 aa  48.9  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.15068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3815  peptidoglycan-binding LysM  40.38 
 
 		 118 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473827  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1478  peptidoglycan-binding LysM  32.76 
 
 		 104 aa  47.4  0.00007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00563925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2718  Peptidoglycan-binding LysM  31.87 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.12772e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3978  Peptidoglycan-binding LysM  34.55 
 
 		 237 aa  47  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.114453 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0772  peptidoglycan-binding LysM  31.4 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000768092  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0857  peptidoglycan-binding LysM  35.71 
 
 		 93 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.555346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7131  hypothetical protein  31.03 
 
 		 129 aa  46.2  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1233  peptidoglycan-binding LysM  29.76 
 
 		 166 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  hitchhiker  0.00561635 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1259  Peptidoglycan-binding LysM  34.48 
 
 		 149 aa  45.4  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.149605  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3901  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  36 
 
 		 213 aa  45.1  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1237  cell division suppressor protein YneA  31.33 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000253866  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0168  LysM-like protein  36 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.140713  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2542  peptidoglycan-binding LysM  36.9 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0261672  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  47.92 
 
 		 265 aa  42.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  47.92 
 
 		 265 aa  42.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1391  Peptidoglycan-binding LysM  28.12 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013388  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1471  Peptidoglycan-binding LysM  42.55 
 
 		 149 aa  42  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000597219 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3509  peptidoglycan-binding LysM  37.5 
 
 		 124 aa  42  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.137678 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0769  Peptidoglycan-binding LysM  32.93 
 
 		 148 aa  41.2  0.004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.352576  normal  0.180452 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.6 
 
 		 554 aa  41.2  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23030  LysM domain-containing protein  27.78 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.14716 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0484  cell wall hydrolase SleB  30.26 
 
 		 241 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000226048  normal  0.576315 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2964  NLP/P60 protein  39.58 
 
 		 208 aa  40.8  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10630  LysM domain-containing protein  32.2 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.993383  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0551  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  37.5 
 
 		 377 aa  40  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.161209 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>