More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10390 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  100 
 
 
228 aa  461  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  51.16 
 
 
225 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  51.16 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  51.16 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  51.16 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  51.16 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  51.16 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  51.16 
 
 
225 aa  232  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  49.77 
 
 
223 aa  230  1e-59  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  51.16 
 
 
225 aa  230  1e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  51.36 
 
 
225 aa  230  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  50.7 
 
 
225 aa  230  2e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  50.7 
 
 
225 aa  229  4e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  50 
 
 
221 aa  224  6e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  51.6 
 
 
224 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  47.79 
 
 
232 aa  218  7e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  48.61 
 
 
231 aa  213  2.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  49.11 
 
 
229 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2100  cytidylate kinase  49.32 
 
 
229 aa  207  9e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.578851 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  50.23 
 
 
233 aa  207  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  49.77 
 
 
222 aa  206  2e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  46.76 
 
 
230 aa  205  6e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  49.77 
 
 
227 aa  203  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  48.34 
 
 
223 aa  204  1e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  44.91 
 
 
219 aa  204  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  47.44 
 
 
224 aa  203  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.93 
 
 
534 aa  201  5e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  46.05 
 
 
226 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.53 
 
 
527 aa  199  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.79 
 
 
526 aa  198  5e-50  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.58 
 
 
528 aa  198  7e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.36 
 
 
517 aa  197  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  45.41 
 
 
232 aa  196  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.66 
 
 
511 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.66 
 
 
511 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  49.52 
 
 
226 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  50 
 
 
218 aa  195  6e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  46.67 
 
 
240 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.71 
 
 
509 aa  194  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  46.3 
 
 
235 aa  194  1e-48  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  46.3 
 
 
539 aa  193  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  51.85 
 
 
224 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  46.76 
 
 
227 aa  192  3e-48  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.95 
 
 
229 aa  192  5e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  47.98 
 
 
228 aa  191  6e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1026  cytidylate kinase  45.54 
 
 
226 aa  191  7e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000434199  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  46.51 
 
 
232 aa  190  1e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  46.92 
 
 
217 aa  191  1e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  43.5 
 
 
229 aa  190  1e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0993  cytidylate kinase  47.64 
 
 
233 aa  191  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  46.08 
 
 
232 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  48.15 
 
 
217 aa  190  2e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  43.32 
 
 
219 aa  190  2e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.29 
 
 
516 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  44.29 
 
 
516 aa  188  5.999999999999999e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  46.54 
 
 
217 aa  187  9e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2397  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000169082  unclonable  0.00000986897 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2280  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000000793863  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  43.98 
 
 
229 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  43.98 
 
 
229 aa  187  1e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2069  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000019021  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2065  cytidylate kinase  42.86 
 
 
230 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000000105966  unclonable  0.00000000000213103 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.64 
 
 
480 aa  186  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1190  cytidylate kinase  45.45 
 
 
225 aa  186  2e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.988165  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  43.12 
 
 
244 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3257  cytidylate kinase  45.75 
 
 
233 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0255416  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.62 
 
 
252 aa  185  5e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  42.66 
 
 
230 aa  185  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1348  cytidylate kinase  42.86 
 
 
233 aa  184  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000802306  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.82 
 
 
488 aa  184  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1708  cytidylate kinase  43.93 
 
 
229 aa  184  1.0000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000112654  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1542  cytidylate kinase  43.26 
 
 
225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.624713  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1351  cytidylate kinase  45.62 
 
 
214 aa  183  2.0000000000000003e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00022877  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.73 
 
 
529 aa  183  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  43.06 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  42.2 
 
 
230 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  43.78 
 
 
231 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2043  cytidylate kinase  43.06 
 
 
230 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000246913  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  40.37 
 
 
227 aa  182  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  42.99 
 
 
483 aa  181  6e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2340  cytidylate kinase  41.94 
 
 
229 aa  181  8.000000000000001e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000158492  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  41.36 
 
 
225 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  41.36 
 
 
225 aa  181  1e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  43.72 
 
 
228 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  41.78 
 
 
227 aa  180  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  41.89 
 
 
229 aa  180  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  43.72 
 
 
225 aa  179  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0324  cytidylate kinase  43.18 
 
 
244 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.037594 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1923  cytidylate kinase  43.06 
 
 
230 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000722421  unclonable  0.0000000000403388 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2055  cytidylate kinase  43.06 
 
 
230 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000628627  unclonable  0.0000241467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1976  cytidylate kinase  43.06 
 
 
230 aa  179  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000166074  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  43.12 
 
 
230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  43.87 
 
 
228 aa  179  4e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2124  cytidylate kinase  41.67 
 
 
229 aa  179  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2309  cytidylate kinase  45.83 
 
 
237 aa  179  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.6369 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1506  cytidylate kinase  42.66 
 
 
229 aa  178  4.999999999999999e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000236579  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  41.82 
 
 
234 aa  178  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  43.72 
 
 
228 aa  178  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  43.19 
 
 
221 aa  178  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1645  cytidylate kinase  41.1 
 
 
225 aa  178  8e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.170178 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>