More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09670 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09670  penicillin-binding protein 1C  100 
 
 
770 aa  1590    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3903  penicillin-binding protein 1C  40.53 
 
 
766 aa  572  1.0000000000000001e-162  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5076  penicillin-binding protein 1C  39.41 
 
 
816 aa  560  1e-158  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.634438  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1192  glycosyltransferase  38.52 
 
 
774 aa  549  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.224348  normal  0.131145 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2639  penicillin-binding protein 1C  39.89 
 
 
793 aa  541  9.999999999999999e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0543  membrane carboxypeptidase/penicillin-binding protein PbpC  38.53 
 
 
780 aa  502  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3054  penicillin-binding protein 1C  36.76 
 
 
787 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2980  penicillin-binding protein 1C  36.76 
 
 
787 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1881  penicillin-binding protein 1C  36.76 
 
 
787 aa  468  9.999999999999999e-131  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.983342  hitchhiker  0.000428352 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0072  penicillin-binding protein 1C  37.55 
 
 
760 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0067  penicillin-binding protein 1C  37.55 
 
 
762 aa  456  1e-127  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0067  penicillin-binding protein 1C, putative  37.06 
 
 
760 aa  451  1e-125  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4282  penicillin-binding protein 1C  37.41 
 
 
760 aa  449  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1629  hypothetical protein  35.09 
 
 
772 aa  439  1e-121  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1635  hypothetical protein  34.96 
 
 
775 aa  436  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4387  penicillin-binding protein 1C  33.8 
 
 
782 aa  434  1e-120  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2192  penicillin-binding protein 1C  35.67 
 
 
794 aa  434  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4847  penicillin-binding protein  34.46 
 
 
782 aa  432  1e-119  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0509  penicillin-binding protein 1C  34.38 
 
 
804 aa  430  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.583992  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3235  penicillin-binding protein 1C  33.64 
 
 
809 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5148  penicillin-binding protein 1C  33.51 
 
 
809 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5133  penicillin-binding protein 1C  33.64 
 
 
809 aa  429  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.391992  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0390  penicillin-binding protein 1C  36.95 
 
 
780 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.3876 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2824  penicillin-binding protein 1C  41.24 
 
 
680 aa  418  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3260  penicillin-binding protein 1C  42.27 
 
 
696 aa  417  9.999999999999999e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.247594  normal  0.375198 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1530  penicillin-binding protein 1C  35.16 
 
 
764 aa  419  9.999999999999999e-116  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0732  penicillin-binding protein 1C  35.06 
 
 
774 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3022  penicillin-binding protein 1C  33.98 
 
 
793 aa  416  1e-114  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.505998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0617  penicillin-binding protein 1C  34.26 
 
 
784 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.701974  normal  0.0771525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3013  penicillin-binding protein 1C  33.46 
 
 
774 aa  415  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.928991  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4592  penicillin-binding protein 1C  33.84 
 
 
784 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0233923 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0164  penicillin-binding protein 1C  33.64 
 
 
797 aa  412  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0309  penicillin-binding protein 1C  32.87 
 
 
792 aa  407  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1366  penicillin-binding protein 1C  35.61 
 
 
794 aa  409  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0369246  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1435  bifunctional penicillin-binding protein 1C precursor  35.56 
 
 
794 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.443847  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0611  penicillin-binding protein 1C  33.84 
 
 
784 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585704  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0572  penicillin-binding protein 1C  33.72 
 
 
784 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0603  bifunctional penicillin-binding protein 1C  33.72 
 
 
807 aa  403  1e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1293  penicillin-binding protein 1C  34.89 
 
 
772 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2894  penicillin-binding protein 1C  32.7 
 
 
770 aa  401  9.999999999999999e-111  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2552  penicillin-binding protein 1C  40.39 
 
 
750 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0465357  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3916  penicillin-binding protein 1C (PBP-1C)  41.99 
 
 
745 aa  400  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.787281 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02411  fused transglycosylase/transpeptidase  32.7 
 
 
770 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1149  penicillin-binding protein 1C  32.7 
 
 
770 aa  399  1e-109  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391736  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2670  penicillin-binding protein 1C  32.57 
 
 
770 aa  397  1e-109  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2803  penicillin-binding protein 1C  32.7 
 
 
770 aa  398  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1158  penicillin-binding protein 1C  32.7 
 
 
770 aa  399  1e-109  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.729598  normal  0.0485769 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2077  penicillin-binding protein 1C  41.39 
 
 
706 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.145944  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2671  penicillin-binding protein 1C  32.7 
 
 
770 aa  399  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.122147 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02373  hypothetical protein  32.7 
 
 
770 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3968  penicillin-binding protein  33.55 
 
 
790 aa  393  1e-108  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.337015  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2918  penicillin-binding protein 1C  40.96 
 
 
731 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2543  penicillin-binding protein 1C  41.67 
 
 
696 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.845119  normal  0.304866 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3748  penicillin-binding protein 1C  32.95 
 
 
770 aa  395  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2901  penicillin-binding protein 1C  34.53 
 
 
771 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1534  penicillin-binding protein 1C  41.58 
 
 
706 aa  392  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232379  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2770  penicillin-binding protein 1C  34.4 
 
 
771 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2683  penicillin-binding protein 1C  34.4 
 
 
771 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2789  penicillin-binding protein 1C  34.53 
 
 
771 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0400715  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2726  penicillin-binding protein 1C  34.7 
 
 
771 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2143  penicillin-binding protein  33.2 
 
 
765 aa  384  1e-105  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0107  penicillin-binding protein 1C  33.46 
 
 
762 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0269  penicillin-binding protein 1C  40.31 
 
 
734 aa  381  1e-104  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0263  penicillin-binding protein 1C  37.15 
 
 
679 aa  379  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.371203 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3614  penicillin-binding protein 1C  33.42 
 
 
774 aa  382  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.355013 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1078  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  36.78 
 
 
724 aa  379  1e-103  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00006738  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1355  glycosyl transferase family protein  40 
 
 
674 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.186022  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2472  penicillin-binding protein 1C  33.2 
 
 
799 aa  374  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000462783 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0013  penicillin-binding protein 1C  39.89 
 
 
674 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0471043 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0836  penicillin-binding protein 1C  37.17 
 
 
719 aa  375  1e-102  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0734378 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3922  penicillin-binding protein  40.19 
 
 
695 aa  372  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.731246  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0023  penicillin-binding protein 1C  40.3 
 
 
674 aa  372  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1254  flagellar P-ring protein (basal body P-ring protein)  36.66 
 
 
722 aa  365  2e-99  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0405  penicillin-binding protein 1C  41.28 
 
 
699 aa  363  6e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905597  normal  0.606283 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1225  penicillin-binding protein  31.42 
 
 
716 aa  363  6e-99  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.555971  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1391  penicillin-binding protein 1C  37.63 
 
 
704 aa  362  2e-98  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1160  penicillin-binding protein 1C  39.09 
 
 
686 aa  361  3e-98  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.215949  normal  0.138456 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1733  penicillin-binding protein 1C  39.89 
 
 
705 aa  360  6e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0777193  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0605  penicillin-binding protein 1C  39.36 
 
 
691 aa  358  1.9999999999999998e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0258  penicillin-binding protein 1C  39.51 
 
 
699 aa  358  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7154  penicillin-binding protein 1C  38.69 
 
 
692 aa  353  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.334526  normal  0.789669 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4628  penicillin-binding protein 1C  39.74 
 
 
684 aa  350  5e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.170087 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6006  penicillin-binding protein 1C  38.42 
 
 
693 aa  350  8e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.155172 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1396  penicillin-binding protein 1C  38.03 
 
 
767 aa  348  3e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00279545 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1671  penicillin-binding protein 1C  37.76 
 
 
733 aa  348  3e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.60886 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1500  penicillin-binding protein 1C  37.3 
 
 
734 aa  347  3e-94  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2772  penicillin-binding protein 1C  37.57 
 
 
690 aa  346  8e-94  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2605  1A family penicillin-binding protein  32.46 
 
 
853 aa  346  1e-93  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3446  penicillin-binding protein 1C  39.3 
 
 
695 aa  345  2e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2518  glycosyl transferase family 51  33.79 
 
 
857 aa  338  2.9999999999999997e-91  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011285  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0105  penicillin-binding protein 1C  37.91 
 
 
706 aa  338  2.9999999999999997e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0912  penicillin-binding protein 1C  39.07 
 
 
710 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.108824  normal  0.087359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2871  1A family penicillin-binding protein  33.59 
 
 
860 aa  337  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1901  glycosyl transferase family 51  35.38 
 
 
688 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2254  penicillin-binding protein 1C, putative  35.38 
 
 
688 aa  322  9.999999999999999e-87  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.531479  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0637  penicillin-binding protein 1C  37.76 
 
 
683 aa  317  7e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.405443  normal  0.682095 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0068  penicillin-binding protein 1C  37.26 
 
 
680 aa  308  3e-82  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3225  1A family penicillin-binding protein  33.58 
 
 
952 aa  307  4.0000000000000004e-82  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00720883  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1168  penicillin-binding protein 1C  32.53 
 
 
798 aa  306  1.0000000000000001e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.676311  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2356  penicillin-binding protein 1C  30.11 
 
 
762 aa  306  1.0000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>