More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09490 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 424 aa  872    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3350  extracellular solute-binding protein family 1  24.72 
 
 		 461 aa  124  3e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 427 aa  118  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3041  extracellular solute-binding protein  21.9 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.887996  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  27.63 
 
 		 423 aa  111  3e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  31.21 
 
 		 427 aa  110  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1115  extracellular solute-binding protein  23.98 
 
 		 439 aa  107  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000327347  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1113  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.87 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0203061  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  31.25 
 
 		 495 aa  99  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  22.43 
 
 		 429 aa  97.8  3e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0548  extracellular solute-binding protein family 1  23.44 
 
 		 426 aa  94.7  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0032157  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 429 aa  93.6  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7218  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 412 aa  92  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 422 aa  91.3  3e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 		 427 aa  90.9  4e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.15 
 
 		 458 aa  89.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.197851  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4936  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.105521 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3860  extracellular solute-binding protein family 1  21.28 
 
 		 463 aa  89  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.952749  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0434  extracellular solute-binding protein family 1  22.94 
 
 		 444 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.205913  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  24.92 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  23.48 
 
 		 439 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.71 
 
 		 428 aa  84.3  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24620  carbohydrate-binding protein  23.38 
 
 		 424 aa  84.7  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  32.95 
 
 		 427 aa  84.7  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  27.49 
 
 		 431 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 421 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  27.2 
 
 		 434 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3600  extracellular solute-binding protein family 1  23.19 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  29.91 
 
 		 412 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  29.55 
 
 		 441 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 441 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 412 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  26.14 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1091  extracellular solute-binding protein  27.03 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  24.79 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  22.82 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5027  extracellular solute-binding protein family 1  25.79 
 
 		 434 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0894368  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  24.59 
 
 		 408 aa  74.3  0.000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  37.01 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 434 aa  73.9  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  24.32 
 
 		 435 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0516  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.09 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.367443  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  27.76 
 
 		 413 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0449  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  28.09 
 
 		 419 aa  71.6  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  27.17 
 
 		 420 aa  70.5  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  23.05 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  30.26 
 
 		 419 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  23.04 
 
 		 452 aa  70.5  0.00000000006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 415 aa  70.1  0.00000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 		 424 aa  69.7  0.00000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2646  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 419 aa  70.1  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0628324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  23.95 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1759  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 436 aa  70.1  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.071409  normal  0.0857732 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0021  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.63 
 
 		 428 aa  69.7  0.00000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.41 
 
 		 434 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7939  ABC transporter (substrate-binding protein)  23.99 
 
 		 428 aa  69.7  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.50295  normal  0.560439 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 406 aa  68.9  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3613  extracellular solute-binding protein family 1  22.59 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.249837  normal  0.747368 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0687  extracellular solute-binding protein  21.73 
 
 		 407 aa  68.6  0.0000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.376534  normal  0.15795 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 432 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 419 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6933  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  29.22 
 
 		 412 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0038808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3546  extracellular solute-binding protein  27.66 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000421461  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  24.28 
 
 		 424 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  28.66 
 
 		 419 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 420 aa  67.8  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  23.17 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.53 
 
 		 451 aa  67.4  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  23.97 
 
 		 422 aa  67  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3775  extracellular solute-binding protein family 1  24.4 
 
 		 459 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.137854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  23.58 
 
 		 457 aa  66.6  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2657  extracellular solute-binding protein family 1  22.54 
 
 		 422 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0000100934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1478  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.65 
 
 		 439 aa  66.2  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000417686  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  22.87 
 
 		 411 aa  66.2  0.0000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.17 
 
 		 416 aa  66.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.17 
 
 		 416 aa  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 445 aa  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 431 aa  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  26.8 
 
 		 446 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4751  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.137656  normal  0.378465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.81 
 
 		 439 aa  65.1  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 399 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0616  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 432 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4662  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 417 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.917353 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  28.77 
 
 		 441 aa  65.5  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 435 aa  64.7  0.000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27350  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.66 
 
 		 444 aa  64.7  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.404715  normal  0.481515 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  29.61 
 
 		 417 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4547  extracellular solute-binding protein  27.21 
 
 		 423 aa  63.9  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.909678  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  21.94 
 
 		 430 aa  63.9  0.000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0996  extracellular solute-binding protein family 1  22.37 
 
 		 455 aa  63.9  0.000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  22.79 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2906  extracellular solute-binding protein family 1  25.53 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.194008  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>