76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09450 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09450  major facilitator superfamily MFS_1  100 
 
 
422 aa  827    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00253075  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0551  hypothetical protein  25.4 
 
 
398 aa  139  1e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2271  hypothetical protein  24.69 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3954  hypothetical protein  23.37 
 
 
394 aa  126  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03215  hypothetical protein  24.75 
 
 
393 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03167  hypothetical protein  24.75 
 
 
393 aa  126  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0238  hypothetical protein  23.92 
 
 
394 aa  125  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3740  hypothetical protein  24.75 
 
 
393 aa  125  1e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3560  hypothetical protein  24.75 
 
 
393 aa  125  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0348  hypothetical protein  24.75 
 
 
393 aa  125  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0348  major facilitator superfamily MFS_1  24.5 
 
 
393 aa  124  3e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3833  hypothetical protein  24.5 
 
 
393 aa  124  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3646  hypothetical protein  24.75 
 
 
393 aa  123  7e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.865659  hitchhiker  0.000149858 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4675  hypothetical protein  24.5 
 
 
393 aa  122  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.398829 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3791  hypothetical protein  24.63 
 
 
394 aa  122  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3743  hypothetical protein  24.58 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0396479 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3670  hypothetical protein  24.58 
 
 
393 aa  119  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.279689  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3713  hypothetical protein  23.06 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3778  hypothetical protein  24.58 
 
 
393 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.974681 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3670  hypothetical protein  24.57 
 
 
393 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.263395  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3841  hypothetical protein  24.58 
 
 
393 aa  117  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.933183  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4593  hypothetical protein  23.37 
 
 
394 aa  116  6.9999999999999995e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0509  hypothetical protein  22.43 
 
 
397 aa  108  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3272  hypothetical protein  20.16 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.388567  normal  0.10012 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2502  hypothetical protein  21.85 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.156303  hitchhiker  0.000706101 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2681  hypothetical protein  21.34 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.433082  hitchhiker  0.00146512 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2718  hypothetical protein  21.89 
 
 
384 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1839  hypothetical protein  21.68 
 
 
391 aa  59.7  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.157174  normal  0.968592 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0419  major facilitator transporter  23.1 
 
 
394 aa  58.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.664236  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1658  hypothetical protein  20.7 
 
 
384 aa  56.6  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0600351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1651  major facilitator transporter  23.13 
 
 
422 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0839039  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0838  major facilitator family transporter  23.51 
 
 
397 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0694  transporter, major facilitator family protein  24.08 
 
 
393 aa  53.9  0.000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0439  major facilitator transporter  23.38 
 
 
394 aa  53.5  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.116076  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3798  major facilitator transporter  23.25 
 
 
412 aa  52.8  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3689  major facilitator transporter  24.85 
 
 
395 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.890108  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1480  major facilitator transporter  22.7 
 
 
395 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_11209  hypothetical protein  25.1 
 
 
440 aa  51.2  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1068  major facilitator transporter  26.1 
 
 
395 aa  51.2  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.355091 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_59900  predicted protein  22.22 
 
 
274 aa  51.6  0.00003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.787504  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0962  major facilitator transporter  21 
 
 
415 aa  50.4  0.00006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.419565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2649  glucose/galactose transporter family protein  24.36 
 
 
428 aa  50.4  0.00006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  unclonable  0.000985214  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3423  hypothetical protein  17.69 
 
 
392 aa  50.1  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1268  major facilitator superfamily transporter  24.85 
 
 
388 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.925266  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0326  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27 
 
 
490 aa  49.7  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3597  major facilitator transporter  23.38 
 
 
387 aa  49.7  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.851404 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0222  major facilitator superfamily MFS_1  22.71 
 
 
388 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.153836  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0161  EmrB/QacA family drug resistance transporter  25 
 
 
494 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3785  hypothetical protein  18.91 
 
 
390 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58946  predicted protein  24.07 
 
 
419 aa  47.8  0.0004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.314593 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2533  hypothetical protein  22.42 
 
 
398 aa  47  0.0006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0651893  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1647  major facilitator superfamily protein  24.86 
 
 
386 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.761188  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3705  glucose/galactose transporter family protein  20.82 
 
 
407 aa  47  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0773  major facilitator transporter  22.86 
 
 
518 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0534  major facilitator transporter  26.89 
 
 
391 aa  45.8  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04910  conserved hypothetical protein  20.19 
 
 
526 aa  46.6  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.413844  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2389  glucose/galactose transporter family protein  23.36 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.706169  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0592  major facilitator superfamily MFS_1  24 
 
 
383 aa  45.8  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179102 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0299  fucose permease  22.64 
 
 
408 aa  45.4  0.002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.482849  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0065  major facilitator family transporter  22.46 
 
 
388 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03795  glucose/galactose transporter family protein  21.9 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.268682  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  26.58 
 
 
425 aa  45.1  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2761  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.12 
 
 
545 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000648651  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0218  major facilitator transporter  25.6 
 
 
369 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.851402  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2115  major facilitator transporter  22.81 
 
 
386 aa  45.1  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0068  transporter, putative  21.74 
 
 
391 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1194  major facilitator transporter  24.78 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2112  metabolite transporter  27.59 
 
 
442 aa  44.3  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0151883  normal  0.38629 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3761  glucose/galactose transporter  24.5 
 
 
410 aa  43.9  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.807951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05760  fucose permease  22.03 
 
 
414 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0598938  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1734  transporter, putative  25.51 
 
 
400 aa  43.5  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.184297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0062  major facilitator transporter  21.53 
 
 
406 aa  43.1  0.01  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.7183  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3103  glucarate permease  25.09 
 
 
452 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3121  glucarate permease  25.09 
 
 
452 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.830611 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3168  glucarate permease  25.09 
 
 
452 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.101605 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3184  glucarate permease  25.09 
 
 
452 aa  43.1  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.513823 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>