More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_09310 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_09310  threonine dehydratase  100 
 
 
403 aa  815    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000321864  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0097  threonine dehydratase  55.92 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0579  threonine dehydratase  56.17 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1852  threonine dehydratase  52.39 
 
 
402 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000042395  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0564  threonine dehydratase  56.17 
 
 
401 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1474  threonine dehydratase  49.75 
 
 
403 aa  406  1.0000000000000001e-112  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0103  threonine dehydratase  53.75 
 
 
401 aa  399  9.999999999999999e-111  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0145026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2432  threonine dehydratase  50.88 
 
 
402 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1181  threonine dehydratase  49.62 
 
 
402 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000071198  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1368  threonine dehydratase  48.85 
 
 
402 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0833542  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3597  threonine dehydratase  46.13 
 
 
403 aa  384  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.35441  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0944  threonine dehydratase  52.44 
 
 
395 aa  380  1e-104  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.463198  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0845  threonine dehydratase  48.23 
 
 
403 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0915  threonine dehydratase  48.23 
 
 
403 aa  373  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1187  threonine dehydratase  48.23 
 
 
403 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.296768  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0834  threonine dehydratase  49.25 
 
 
403 aa  374  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0349  threonine dehydratase  46.98 
 
 
403 aa  372  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.626504  normal  0.139043 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3034  threonine dehydratase  48.99 
 
 
403 aa  371  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1057  threonine dehydratase  46.68 
 
 
402 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0611  threonine dehydratase  50 
 
 
408 aa  370  1e-101  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0341122  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3448  L-threonine ammonia-lyase  46.88 
 
 
403 aa  365  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1062  threonine dehydratase  50.13 
 
 
402 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0280706  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1143  threonine dehydratase  48.99 
 
 
400 aa  363  3e-99  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3529  threonine dehydratase  46.13 
 
 
403 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.10963  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3556  threonine dehydratase  46.38 
 
 
403 aa  361  1e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.597428  normal  0.136455 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1079  threonine dehydratase  52.23 
 
 
404 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000539723  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3072  threonine dehydratase  51.53 
 
 
402 aa  359  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0067161  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0801  threonine dehydratase  49.12 
 
 
407 aa  359  5e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.103174  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0965  threonine dehydratase  46.55 
 
 
403 aa  358  9e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1014  threonine dehydratase  47.73 
 
 
403 aa  355  7.999999999999999e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0743  threonine dehydratase  46.1 
 
 
403 aa  354  1e-96  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00847234  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0848  threonine dehydratase  47.01 
 
 
402 aa  353  2e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.00000460563 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8547  threonine dehydratase  45.11 
 
 
402 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1494  threonine dehydratase  45.84 
 
 
404 aa  352  5e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1331  threonine dehydratase  47.47 
 
 
401 aa  351  1e-95  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2979  threonine dehydratase  44.25 
 
 
415 aa  350  4e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0688  L-threonine ammonia-lyase  45.89 
 
 
413 aa  348  1e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1526  threonine dehydratase  47.99 
 
 
403 aa  347  2e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.148383  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2441  threonine dehydratase  46.98 
 
 
406 aa  346  5e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000148333  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0865  threonine dehydratase  47.99 
 
 
406 aa  345  6e-94  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.708894  normal  0.0742081 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0011  threonine dehydratase  46.12 
 
 
402 aa  342  1e-92  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.059163  normal  0.133507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4035  threonine dehydratase  50.88 
 
 
402 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0486  threonine dehydratase  49.74 
 
 
402 aa  334  1e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.420831  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0069  threonine dehydratase  47.76 
 
 
410 aa  333  4e-90  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0945  threonine dehydratase  47.03 
 
 
418 aa  332  1e-89  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1165  threonine dehydratase  45.54 
 
 
412 aa  330  2e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.499375  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3689  threonine dehydratase  49.61 
 
 
402 aa  329  6e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.353069  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05060  threonine dehydratase  41.48 
 
 
443 aa  328  1.0000000000000001e-88  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.925134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3784  threonine dehydratase  49.1 
 
 
402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1237  threonine dehydratase  43.81 
 
 
412 aa  326  5e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000221207 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0736  threonine dehydratase  46.06 
 
 
416 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.51572  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3112  threonine dehydratase  46.23 
 
 
404 aa  323  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.467281  hitchhiker  0.00000283159 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1915  threonine dehydratase  42.04 
 
 
411 aa  322  6e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0922  threonine dehydratase  47.74 
 
 
403 aa  321  9.999999999999999e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.411143  normal  0.511297 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0952  threonine dehydratase  44.14 
 
 
415 aa  319  7e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000323756  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31840  threonine dehydratase  43.58 
 
 
401 aa  318  9e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.67382 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1373  threonine dehydratase  45.34 
 
 
537 aa  315  9.999999999999999e-85  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0125  threonine dehydratase  46.94 
 
 
408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2713  threonine dehydratase  45.48 
 
 
410 aa  312  5.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.420797 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0344  threonine dehydratase  43.88 
 
 
399 aa  312  7.999999999999999e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0935  threonine dehydratase  42.71 
 
 
412 aa  310  2e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.801427  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4935  threonine dehydratase  42.32 
 
 
403 aa  310  4e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0165  threonine dehydratase  43.52 
 
 
400 aa  310  4e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0979  threonine dehydratase  41.56 
 
 
404 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2636  threonine dehydratase  41.31 
 
 
402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0727  threonine dehydratase  45.84 
 
 
411 aa  307  2.0000000000000002e-82  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3770  threonine dehydratase  43.64 
 
 
412 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0248886 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1660  threonine dehydratase  47.12 
 
 
403 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0212485 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0111  threonine dehydratase  41.92 
 
 
400 aa  305  1.0000000000000001e-81  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.577091  normal  0.0541762 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1403  threonine dehydratase  45.02 
 
 
403 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0043  threonine dehydratase  45 
 
 
411 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4707  threonine dehydratase  43.35 
 
 
414 aa  303  4.0000000000000003e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.832283  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1422  threonine dehydratase  43.78 
 
 
403 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0149  threonine dehydratase  41.04 
 
 
409 aa  301  2e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.436735  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1498  threonine dehydratase  41.36 
 
 
421 aa  300  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4140  threonine dehydratase  40.74 
 
 
408 aa  300  4e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4419  threonine dehydratase  43.36 
 
 
403 aa  299  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1619  threonine dehydratase  41.56 
 
 
400 aa  298  1e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.458983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0480  threonine dehydratase  42.36 
 
 
406 aa  295  8e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08200  L-threonine ammonia-lyase  41.1 
 
 
408 aa  295  9e-79  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0196535 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0664  threonine dehydratase  46.72 
 
 
413 aa  295  9e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1075  threonine dehydratase  41.6 
 
 
405 aa  295  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.986828  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0116  threonine dehydratase  42.57 
 
 
415 aa  295  1e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1224  threonine dehydratase  48.08 
 
 
405 aa  292  9e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1842  threonine dehydratase  41.06 
 
 
416 aa  291  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.53937 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1467  threonine dehydratase  48.29 
 
 
403 aa  289  7e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.912465  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0142  threonine dehydratase  43.18 
 
 
402 aa  289  8e-77  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0336492 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3029  threonine dehydratase  40.9 
 
 
398 aa  288  1e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0116526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4230  threonine dehydratase  41.04 
 
 
412 aa  287  2e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0941557  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0080  threonine dehydratase  41.69 
 
 
399 aa  285  7e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0099  threonine dehydratase  41.69 
 
 
399 aa  285  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0057  threonine dehydratase  43.03 
 
 
410 aa  285  8e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.835911  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0066  threonine dehydratase  49.54 
 
 
358 aa  285  9e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1939  threonine dehydratase  43.22 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1894  threonine dehydratase  41.81 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.878805  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3319  threonine dehydratase  44.03 
 
 
410 aa  281  1e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.813213  normal  0.377065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2254  threonine dehydratase  42.03 
 
 
415 aa  279  7e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3984  threonine dehydratase  41.71 
 
 
412 aa  278  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0961  threonine dehydratase  40.05 
 
 
404 aa  277  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.569986 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1533  threonine dehydratase  44.42 
 
 
402 aa  277  3e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.331802  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>