More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_08990 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 385 aa  781    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  44.09 
 
 		 393 aa  318  1e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  43.54 
 
 		 399 aa  316  4e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1773  DNA-directed DNA polymerase  41.34 
 
 		 397 aa  315  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.49151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2890  DNA-directed DNA polymerase  43.98 
 
 		 386 aa  310  2e-83  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2317  DNA-directed DNA polymerase  43.15 
 
 		 426 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  42.93 
 
 		 425 aa  305  6e-82  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0229  DNA-directed DNA polymerase  42.41 
 
 		 384 aa  302  8.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  42.89 
 
 		 408 aa  298  8e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  43.42 
 
 		 409 aa  297  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  41.05 
 
 		 409 aa  297  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  41.05 
 
 		 409 aa  296  5e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  44.16 
 
 		 389 aa  295  6e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  42.02 
 
 		 410 aa  295  8e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  42.52 
 
 		 420 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  42.16 
 
 		 408 aa  291  9e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  44.01 
 
 		 371 aa  290  3e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0159  DNA-directed DNA polymerase  40.67 
 
 		 418 aa  290  4e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0148  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 		 418 aa  289  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3621  DNA-directed DNA polymerase  41.1 
 
 		 385 aa  288  9e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0141  DNA-directed DNA polymerase  40.41 
 
 		 418 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1815  DNA-directed DNA polymerase  40.63 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000272693  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  40.46 
 
 		 409 aa  286  2.9999999999999996e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0145  DNA-directed DNA polymerase  39.95 
 
 		 399 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0301883  normal  0.226149 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  42.93 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  42.93 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1559  DNA-directed DNA polymerase  40.31 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.195396  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 408 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4922  DNA-directed DNA polymerase  40.8 
 
 		 410 aa  279  5e-74  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0212665 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  42.61 
 
 		 355 aa  279  6e-74  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1096  DNA-directed DNA polymerase  39.15 
 
 		 424 aa  276  4e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  40 
 
 		 410 aa  276  4e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  40.58 
 
 		 390 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  37.98 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  41.51 
 
 		 422 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000325025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  40.26 
 
 		 410 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  42.25 
 
 		 466 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3995  DNA polymerase IV  39.69 
 
 		 417 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1270  DNA-directed DNA polymerase  39.58 
 
 		 430 aa  272  7e-72  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.725906  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  45.56 
 
 		 374 aa  272  7e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0127  DNA polymerase IV  39.18 
 
 		 423 aa  272  8.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.314932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  44.08 
 
 		 372 aa  272  8.000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3277  DNA-directed DNA polymerase  39.52 
 
 		 402 aa  272  8.000000000000001e-72  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  41.1 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  40.26 
 
 		 407 aa  271  1e-71  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  42.98 
 
 		 380 aa  271  1e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2808  DNA polymerase IV  39.64 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.186198 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2424  DNA-directed DNA polymerase  39.52 
 
 		 415 aa  270  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0565493 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1400  DNA polymerase IV  39.38 
 
 		 449 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.193285  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0068  DNA polymerase IV  39.18 
 
 		 417 aa  270  2.9999999999999997e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.91502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  38.9 
 
 		 453 aa  269  5.9999999999999995e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  39.53 
 
 		 400 aa  268  8.999999999999999e-71  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  39.01 
 
 		 445 aa  268  1e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0963  DNA polymerase IV  39.9 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  39.53 
 
 		 411 aa  268  1e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.16 
 
 		 409 aa  267  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  39.01 
 
 		 445 aa  267  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2313  DNA-directed DNA polymerase  42.77 
 
 		 481 aa  268  2e-70  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  38.99 
 
 		 430 aa  266  4e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  41.32 
 
 		 413 aa  266  5e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2809  DNA polymerase IV  38.96 
 
 		 423 aa  265  7e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.436092 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  42.33 
 
 		 356 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  42.33 
 
 		 356 aa  266  7e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22910  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  40.36 
 
 		 414 aa  265  1e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0450607 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0923  DNA polymerase IV  38.74 
 
 		 430 aa  265  1e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  42.01 
 
 		 356 aa  265  1e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1107  DNA-directed DNA polymerase  40.21 
 
 		 385 aa  264  2e-69  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.27085  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  38.34 
 
 		 406 aa  264  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1344  DNA polymerase IV  39.01 
 
 		 436 aa  264  2e-69  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.363596  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0385  DNA polymerase IV  41.09 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.434794  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0882  DNA-directed DNA polymerase  39.26 
 
 		 417 aa  263  3e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  43.34 
 
 		 363 aa  263  4e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_002936  DET0011  DNA polymerase IV, putative  39.53 
 
 		 390 aa  261  1e-68  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  37.89 
 
 		 402 aa  261  1e-68  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  38.81 
 
 		 358 aa  261  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  41.57 
 
 		 359 aa  260  2e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25070  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  36.41 
 
 		 415 aa  260  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.487274  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  41.76 
 
 		 356 aa  260  3e-68  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1377  DNA polymerase IV  38.48 
 
 		 431 aa  259  4e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  42.32 
 
 		 385 aa  259  7e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  39.38 
 
 		 359 aa  258  2e-67  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1646  DNA-directed DNA polymerase  39.57 
 
 		 834 aa  257  3e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.218783 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  37.44 
 
 		 419 aa  256  4e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  42.31 
 
 		 359 aa  256  5e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  43.11 
 
 		 359 aa  255  9e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13520  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  37.25 
 
 		 433 aa  254  1.0000000000000001e-66  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  40.74 
 
 		 378 aa  253  3e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  40.34 
 
 		 369 aa  253  4.0000000000000004e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3544  DNA polymerase IV  37.37 
 
 		 431 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  44.25 
 
 		 353 aa  253  5.000000000000001e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  36.58 
 
 		 432 aa  252  8.000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1285  DNA polymerase IV  37.43 
 
 		 431 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.25949  normal  0.0407739 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1274  DNA polymerase IV  37.24 
 
 		 436 aa  252  1e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0719979  normal  0.0370886 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  41.72 
 
 		 354 aa  252  1e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0687  DNA-directed DNA polymerase  38.15 
 
 		 444 aa  251  2e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.0000000344848  hitchhiker  0.00527115 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  40.53 
 
 		 360 aa  249  4e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  39.06 
 
 		 425 aa  250  4e-65  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1494  DNA polymerase IV  36.99 
 
 		 418 aa  249  7e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1555  DNA-directed DNA polymerase  38.75 
 
 		 422 aa  249  7e-65  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.558973  normal  0.0210398 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  42.94 
 
 		 363 aa  248  9e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>