More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07680 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_07680  ribosome recycling factor  100 
 
 		 185 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0885  ribosome recycling factor  57.84 
 
 		 185 aa  221  4.9999999999999996e-57  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000127588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1144  ribosome recycling factor  57.3 
 
 		 185 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000279866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1035  ribosome recycling factor  56.76 
 
 		 185 aa  218  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000462528  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0581  ribosome recycling factor  58.19 
 
 		 184 aa  214  4e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1422  ribosome recycling factor  53.07 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0768793  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2036  ribosome recycling factor  54.59 
 
 		 186 aa  209  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3706  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  209  2e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0497206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3210  ribosome recycling factor  55.68 
 
 		 185 aa  208  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000238814  hitchhiker  0.0000000602253 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1944  ribosome recycling factor  55.06 
 
 		 184 aa  208  3e-53  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.757618 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2476  ribosome recycling factor  55.14 
 
 		 185 aa  207  5e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000697706  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2919  ribosome recycling factor  53.93 
 
 		 186 aa  207  9e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.174611 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3865  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00928808  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1658  ribosome recycling factor  55.87 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.375108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1975  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 184 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.552095  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3871  ribosome recycling factor  54.05 
 
 		 185 aa  205  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0168076  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1676  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  204  5e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3565  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.603259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3583  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1321  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.198825  hitchhiker  0.00000000000000123018 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3836  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  204  6e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.64109e-62 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1670  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  204  7e-52  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3922  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0969461  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1252  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  204  8e-52  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.538826  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3675  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.979275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3962  ribosome recycling factor  53.51 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.60954  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3647  ribosome recycling factor  52.97 
 
 		 185 aa  203  1e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0174734  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0519  ribosome recycling factor  54.49 
 
 		 186 aa  203  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3514  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  202  3e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.763665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0986  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  201  6e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00114143  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1128  ribosome recycling factor  52.57 
 
 		 184 aa  200  8e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.440044  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0570  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  200  9e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0496987  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1918  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  199  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.36169e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2112  ribosome recycling factor  51.69 
 
 		 186 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0010  ribosome recycling factor  50.56 
 
 		 192 aa  198  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0696052  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1813  ribosome recycling factor  53.67 
 
 		 184 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000182094  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0374  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1016  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000122168  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1069  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00702897  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3432  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  5e-50  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000874312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3787  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  198  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00158477 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1430  ribosome recycling factor  56.74 
 
 		 184 aa  197  5e-50  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00121871  normal  0.0745134 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0477  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  6e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0474478  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1162  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  7e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1848  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  197  7.999999999999999e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000201497  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1556  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  197  9e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.188026  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0077  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.010398  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_318  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.108452  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0216  ribosome recycling factor  52.87 
 
 		 185 aa  196  2.0000000000000003e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0507  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 182 aa  196  2.0000000000000003e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01376  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0186665  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3357  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.229017  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002749  ribosome recycling factor  50.81 
 
 		 185 aa  195  3e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000016264  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2978  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  194  4.0000000000000005e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4958  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 192 aa  195  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.759908  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2379  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 184 aa  194  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07611  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 173 aa  193  9e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0633499 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0710  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  193  1e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0332878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2632  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000751677  normal  0.363086 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2882  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000396733  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03234  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1494  ribosome recycling factor  49.72 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23610  ribosome recycling factor  48.91 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.093506 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0944  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  192  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00317572  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1142  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  193  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000869669  normal  0.111417 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3162  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  192  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0860569  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3278  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000213543  hitchhiker  0.000283754 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2812  ribosome recycling factor  49.19 
 
 		 185 aa  191  4e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000100926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0629  ribosome recycling factor  50.85 
 
 		 187 aa  191  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1281  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  191  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.208847 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2560  ribosome recycling factor  51.89 
 
 		 181 aa  190  8e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1632  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38960  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2638  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000456907  normal  0.10147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2705  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00000841959  hitchhiker  0.00246061 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0611  ribosome recycling factor  52.43 
 
 		 185 aa  190  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.106434  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1345  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  190  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0459515  normal  0.505766 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2345  ribosome recycling factor  50 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.082368  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3546  ribosome recycling factor  51.35 
 
 		 181 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3158  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000691666  normal  0.144971 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0997  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.168842  normal  0.480698 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1878  ribosome recycling factor  48.37 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.556612  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1463  ribosome recycling factor  46.49 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.318607  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1335  ribosome recycling factor  47.28 
 
 		 186 aa  189  2e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.43872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0356  ribosome recycling factor  49.13 
 
 		 173 aa  189  2e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0472189  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1275  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00110727  normal  0.535196 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1351  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000717676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1451  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  189  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166496  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2545  ribosome recycling factor  52.07 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1438  ribosome recycling factor  46.74 
 
 		 186 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.389466  hitchhiker  0.000418835 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2698  ribosome recycling factor  51.45 
 
 		 182 aa  188  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09920  ribosome recycling factor  48.65 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1486  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0107069  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1860  ribosome recycling factor  49.73 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.747676  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2424  ribosome recycling factor  50.27 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00108894  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0566  ribosome recycling factor  47.03 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.395524  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17100  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1453  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000049819  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0679  ribosome recycling factor  47.57 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.445733  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2899  ribosome recycling factor  48.11 
 
 		 185 aa  187  7e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000932331  normal  0.103531 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>