More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07610 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07610  putative CheW protein  100 
 
 
159 aa  311  2.9999999999999996e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0087055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03137  hypothetical protein  43.92 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002839  positive regulator of CheA protein activity (CheW)  43.92 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.856149  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  43.97 
 
 
164 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2813  CheW protein  47.48 
 
 
168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0297  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.6 
 
 
164 aa  128  3e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1647  purine-binding chemotaxis protein CheW  44.93 
 
 
174 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2283  chemotaxis protein CheW  44.2 
 
 
164 aa  127  7.000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4419  putative CheW protein  45.39 
 
 
165 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3265  CheW protein  43.17 
 
 
164 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000123984 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  45.45 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  43.26 
 
 
162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3023  CheW protein  42.75 
 
 
164 aa  124  5e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1386  CheW protein  42.07 
 
 
163 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  43.54 
 
 
170 aa  124  6e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3419  putative CheW protein  43.36 
 
 
163 aa  124  6e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  43.62 
 
 
189 aa  124  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1351  CheW-like protein  41.38 
 
 
164 aa  123  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2693  putative CheW protein  45.19 
 
 
163 aa  123  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0876  CheW protein  47.18 
 
 
164 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000145541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07620  putative CheW protein  42.22 
 
 
165 aa  122  2e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000372381  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3941  CheW protein  45.32 
 
 
165 aa  122  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000148989  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02863  chemotaxis protein CheW  41.96 
 
 
163 aa  122  2e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4025  CheW protein  45.32 
 
 
165 aa  122  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000034863 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3202  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.69 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2155  flagellar FliF M-ring protein  38.22 
 
 
161 aa  122  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1307  CheW protein  40.69 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.897711 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1374  CheW protein  40.69 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1367  CheW protein  40.69 
 
 
164 aa  122  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367325 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1462  CheW protein  40.69 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  41.26 
 
 
163 aa  121  4e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3043  putative CheW protein  40.69 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.605856 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2901  putative CheW protein  40.69 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.3057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2911  putative CheW protein  40.69 
 
 
164 aa  121  4e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.810949  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  39.86 
 
 
175 aa  121  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2272  purine-binding chemotaxis protein CheW  40.69 
 
 
164 aa  120  5e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.124095  normal  0.11667 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  40.56 
 
 
164 aa  120  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2551  putative CheW protein  41.13 
 
 
164 aa  120  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  44.29 
 
 
167 aa  120  7e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  40.88 
 
 
175 aa  120  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2888  CheW protein  44.44 
 
 
167 aa  120  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  42.45 
 
 
165 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1022  CheW protein  44.53 
 
 
158 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  40 
 
 
174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0491  CheW protein  42.28 
 
 
154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  39.86 
 
 
161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  42.11 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  40 
 
 
171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4154  CheW protein  43.8 
 
 
147 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1966  putative CheW protein  39.72 
 
 
162 aa  119  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1831  CheW protein  41.55 
 
 
168 aa  118  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00253115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  42.86 
 
 
163 aa  118  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  40.15 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  40.15 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  40.15 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  40.15 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  40.15 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  40.15 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  40.15 
 
 
175 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  39.26 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  39.26 
 
 
177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  52.1 
 
 
165 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  39.26 
 
 
171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  38.36 
 
 
171 aa  117  4.9999999999999996e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  41.84 
 
 
218 aa  117  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1419  CheW protein  41.01 
 
 
159 aa  117  6e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0639922  normal  0.266915 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  39.26 
 
 
171 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0299  CheW protein  36.94 
 
 
155 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00727578  normal  0.225748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1528  chemotaxis protein CheW  40.58 
 
 
164 aa  117  7.999999999999999e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.908591  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2441  putative CheW protein  45 
 
 
163 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00205848  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1572  CheW protein  39.13 
 
 
161 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.650684  normal  0.674901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  39.26 
 
 
178 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2796  putative CheW protein  40.3 
 
 
159 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.153028  normal  0.193406 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5600  CheW-like protein  40.88 
 
 
158 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.944828  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2234  CheW protein  37.86 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  39.26 
 
 
178 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1993  CheW protein  37.86 
 
 
165 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000146725 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  41.48 
 
 
165 aa  115  3e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4332  purine-binding chemotaxis protein CheW  38.41 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.300318  normal  0.430196 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3428  CheW-like protein  37.68 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.661205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0331  CheW protein  36.84 
 
 
155 aa  115  3.9999999999999997e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386619  normal  0.248753 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3658  CheW protein  38.41 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3862  putative purine-binding chemotaxis protein  38.41 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.71104  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1535  putative CheW protein  38.41 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107211  normal  0.640168 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1773  CheW protein  46.27 
 
 
161 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3901  CheW protein  38.41 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45500  putative purine-binding chemotaxis protein  38.41 
 
 
159 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1259  putative CheW protein  45.38 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.543562  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  42.22 
 
 
165 aa  114  5e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  36.42 
 
 
164 aa  114  6e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4049  CheW protein  39.71 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0807909  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4161  CheW protein  39.71 
 
 
163 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.267882  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  41.48 
 
 
165 aa  113  7.999999999999999e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0284  CheW protein  44.54 
 
 
158 aa  114  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.628672 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  41.48 
 
 
165 aa  113  8.999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  39.71 
 
 
163 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  38.19 
 
 
174 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1988  chemotaxis protein CheW  38.06 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.381098  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1347  CheW protein  37.06 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.161172  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  40 
 
 
165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>