276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07560 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07560  ATP-dependent protease peptidase subunit  100 
 
 
181 aa  363  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  3.22808e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1981  ATP-dependent protease peptidase subunit  72.73 
 
 
176 aa  254  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244115  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1226  ATP-dependent protease peptidase subunit  69.32 
 
 
176 aa  250  6e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0176208  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3713  ATP-dependent protease peptidase subunit  68.75 
 
 
176 aa  244  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1029  ATP-dependent protease peptidase subunit  70.29 
 
 
174 aa  243  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000258699  unclonable  0.0000000048858 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1313  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.61 
 
 
181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.262793  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1338  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.61 
 
 
181 aa  242  1.9999999999999999e-63  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00663055  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0819  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.48 
 
 
180 aa  240  7.999999999999999e-63  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1997  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.97 
 
 
180 aa  239  2e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2482  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 
180 aa  237  9e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000211786  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3653  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 
180 aa  236  2e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00119552  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1203  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
184 aa  235  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1210  ATP-dependent protease peptidase subunit  64 
 
 
178 aa  235  3e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0066  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.8 
 
 
183 aa  234  5.0000000000000005e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1105  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.89 
 
 
180 aa  233  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000745772  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1315  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.33 
 
 
180 aa  233  9e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  unclonable  7.14384e-26 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2411  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.48 
 
 
177 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0141789  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0056  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.92 
 
 
177 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0485  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.71 
 
 
185 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00182784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3681  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 
180 aa  232  3e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.19554  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3571  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 
180 aa  232  3e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000211087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3589  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 
180 aa  232  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000154758  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3842  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 
180 aa  232  3e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.01545e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3968  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 
180 aa  232  3e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000710132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3928  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 
180 aa  232  3e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00131744  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3872  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0375524  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3877  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.78 
 
 
180 aa  231  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000521125  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2720  20S proteasome A and B subunits  62.29 
 
 
179 aa  228  5e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0694  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 
182 aa  227  7e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0677  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
182 aa  226  1e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0818  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.95 
 
 
176 aa  226  1e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.136015  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2014  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
187 aa  226  2e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0930  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.71 
 
 
182 aa  225  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1099  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.58 
 
 
182 aa  224  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0416  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
176 aa  223  1e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00178551  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1587  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.38 
 
 
180 aa  223  1e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.48223 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0400  ATP-dependent protease peptidase subunit  64.57 
 
 
176 aa  223  1e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000263629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2000  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 
184 aa  223  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.299358  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2080  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 
184 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.431313  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0230  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.34 
 
 
176 aa  222  2e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000355363  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1449  ATP-dependent protease peptidase subunit  66.1 
 
 
177 aa  221  4e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2112  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.11 
 
 
204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0644  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 
186 aa  221  6e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal  0.182505 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0782  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 
182 aa  220  7e-57  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.639301  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5464  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
176 aa  220  7e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0989  20S proteasome A and B subunits  62.35 
 
 
176 aa  220  7e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0256  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.57 
 
 
176 aa  220  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1208  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
182 aa  219  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0410  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.86 
 
 
183 aa  219  9.999999999999999e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.312402  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4103  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
174 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0655  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.99 
 
 
186 aa  219  9.999999999999999e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.147587 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1699  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.43 
 
 
176 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000408331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
174 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0113  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
174 aa  219  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0908  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.44 
 
 
181 aa  219  9.999999999999999e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1323  20S proteasome A and B subunits  62.36 
 
 
179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4191  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
174 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3492  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.43 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0017  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
178 aa  219  1.9999999999999999e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0074  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.55 
 
 
181 aa  219  1.9999999999999999e-56  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3264  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.14 
 
 
185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0116  20S proteasome A and B subunits  58.86 
 
 
180 aa  218  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.940208  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0839  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.45 
 
 
184 aa  218  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4041  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.79 
 
 
176 aa  218  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1117  ATP-dependent protease peptidase subunit  60 
 
 
182 aa  218  3.9999999999999997e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03817  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4053  20S proteasome A and B subunits  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5389  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4164  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0623  ATP-dependent protease peptidase subunit  57.87 
 
 
206 aa  218  5e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.659505 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0214  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.29 
 
 
180 aa  218  5e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.248061  normal  0.496485 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03766  hypothetical protein  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4086  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4414  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0890704  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4374  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.712688 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4468  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  218  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3982  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
175 aa  217  6e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1384  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.5 
 
 
181 aa  217  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000068782  normal  0.819068 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1877  20S proteasome A and B subunits  62.86 
 
 
183 aa  217  7e-56  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.254644  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4369  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
172 aa  216  1e-55  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4492  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4338  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4308  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4422  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4424  ATP-dependent protease peptidase subunit  62.21 
 
 
176 aa  216  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1556  ATP-dependent protease peptidase subunit  65.14 
 
 
181 aa  216  1e-55  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.910696  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0166  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
176 aa  216  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2697  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.88 
 
 
179 aa  216  2e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0247123  decreased coverage  0.00024653 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3797  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
176 aa  216  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1541  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.12 
 
 
175 aa  216  2e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0441  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
174 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5624  ATP-dependent protease peptidase subunit  56 
 
 
180 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03517  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
174 aa  215  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.839153  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3599  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 
187 aa  215  4e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000487409  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0180  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.63 
 
 
176 aa  214  4e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1410  ATP-dependent protease peptidase subunit  58.62 
 
 
182 aa  214  4e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0114  ATP-dependent protease peptidase subunit  61.05 
 
 
176 aa  214  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0576  ATP-dependent protease peptidase subunit  63.07 
 
 
177 aa  214  5e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0413434  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4792  ATP-dependent protease peptidase subunit  60.47 
 
 
176 aa  214  5e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000178392 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0533  ATP-dependent protease peptidase subunit  59.3 
 
 
176 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>