275 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07010 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_07010  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  100 
 
 
143 aa  291  2e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1497  anti-sigma F factor  57.14 
 
 
148 aa  150  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2065  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  53.73 
 
 
146 aa  144  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202652  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0862  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  50 
 
 
142 aa  129  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3441  anti-sigma F factor  47.37 
 
 
145 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1558  anti-sigma F factor  50.38 
 
 
143 aa  128  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2021  anti-sigma F factor  46.32 
 
 
140 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1745  anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.11 
 
 
153 aa  119  9.999999999999999e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0477  anti-sigma F factor  46.62 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.899963  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2306  anti-sigma F factor  45.59 
 
 
140 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1104  anti-sigma F factor  46.21 
 
 
148 aa  117  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.860331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0373  anti-sigma F factor  47.06 
 
 
146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1225  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  45.19 
 
 
148 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00856956  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0119  anti-sigma F factor  44.36 
 
 
149 aa  114  6e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2285  anti-sigma F factor  44.36 
 
 
141 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2251  anti-sigma F factor  44.85 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1662  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  44.36 
 
 
146 aa  109  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.503488  normal  0.167313 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0614  anti-sigma F factor  41.98 
 
 
148 aa  106  9.000000000000001e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2772  anti-sigma F factor  40.44 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0313076  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4143  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00316995  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3984  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.132565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3814  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3830  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0386677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4295  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.65439  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3904  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4206  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000134887  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1055  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92  2e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0411626 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4183  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0790038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4095  anti-sigma F factor  39.71 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.69426e-22 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1681  anti-sigma F factor  48.91 
 
 
154 aa  84.3  6e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1812  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.57 
 
 
151 aa  72  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  31.39 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  31.39 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  31.39 
 
 
160 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  31.39 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  31.39 
 
 
160 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  30.66 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  30.66 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  30.66 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4563  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 
286 aa  67.4  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  30.66 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  30.66 
 
 
160 aa  67  0.00000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
139 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3487  serine-protein kinase RsbW  29.2 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5777  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
155 aa  61.6  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2488  putative anti-sigma regulatory factor (Ser/Thr protein kinase)  30.77 
 
 
129 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2139  serine-protein kinase RsbW  31.16 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2102  serine-protein kinase RsbW  31.16 
 
 
159 aa  57  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.178488  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0476  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
134 aa  57  0.00000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1473  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  32.2 
 
 
135 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00187817  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3168  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.04 
 
 
144 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.482123  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1291  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.01 
 
 
139 aa  55.1  0.0000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  30.15 
 
 
159 aa  54.3  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4212  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.41 
 
 
144 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.797188  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2297  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.14 
 
 
143 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3289  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.76 
 
 
147 aa  53.5  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0615968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  32.65 
 
 
269 aa  53.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2399  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.69 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.477606 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0030  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.48 
 
 
144 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.786698 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2974  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.07 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1126  histidine kinase  44 
 
 
183 aa  51.2  0.000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000015615  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0197  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.33 
 
 
144 aa  51.6  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0569328  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2795  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
139 aa  51.2  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0217  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 
499 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0324  signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
398 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.732156  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3742  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.68 
 
 
137 aa  50.4  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.943736  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
249 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000008  putative anti-sigma F factor antagonist  28.57 
 
 
165 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.232541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3690  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.38 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.498919  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4409  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.95 
 
 
134 aa  49.7  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.765938  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0675  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
133 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.769358  normal  0.0108346 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3252  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 
139 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1164  histidine kinase  41.33 
 
 
183 aa  50.1  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00214296  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1623  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  27.13 
 
 
154 aa  50.1  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2904  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.18 
 
 
141 aa  49.7  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139712  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0162  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.16 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 
250 aa  49.7  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2414  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.03 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0731  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.57 
 
 
139 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.993652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2684  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.19 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0560  putative anti-sigma factor  30.38 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.01 
 
 
148 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4196  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.99 
 
 
680 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0175164 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0095  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  24.09 
 
 
174 aa  48.5  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4099  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.77 
 
 
147 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.256347  normal  0.1124 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0565  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.27 
 
 
138 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446694  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2748  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.82 
 
 
476 aa  48.5  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.662437  normal  0.393877 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4417  sensor protein ZraS  33.33 
 
 
465 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00746463  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  31.21 
 
 
250 aa  48.1  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4580  sensor protein ZraS  33.33 
 
 
465 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.910728 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4384  sensor protein ZraS  33.33 
 
 
465 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.528671 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0911  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  25 
 
 
290 aa  48.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1924  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  28.36 
 
 
492 aa  48.1  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3235  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
498 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4504  sensor protein ZraS  33.33 
 
 
465 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.79058  normal  0.150047 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
360 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
360 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
360 aa  47.8  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4506  sensor protein ZraS  33.33 
 
 
465 aa  47.8  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0449014 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  35.06 
 
 
450 aa  47.8  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>