More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_07000 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_07000  anti-sigma-factor antagonist spoIIAA  100 
 
 		 120 aa  239  7e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2252  anti-sigma-factor antagonist  44.34 
 
 		 116 aa  108  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0372  anti-sigma-factor antagonist  41.44 
 
 		 116 aa  106  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2773  anti-sigma-factor antagonist  42.45 
 
 		 116 aa  102  1e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.165938  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2064  anti-sigma-factor antagonist  44.44 
 
 		 112 aa  103  1e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0033219  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4144  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.131803  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3905  anti-sigma-factor antagonist  42.34 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3985  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.342658  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3815  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4207  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263049  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3831  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4296  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4096  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  100  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.64366e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1746  anti-sigma-factor antagonist  36.04 
 
 		 114 aa  100  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1054  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0273887 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4184  anti-sigma F factor antagonist  41.51 
 
 		 116 aa  99.8  1e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0744787  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1103  anti-sigma-factor antagonist  46.9 
 
 		 112 aa  94.7  3e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1226  anti-sigma-factor antagonist  43 
 
 		 111 aa  90.5  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0222926  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2307  anti-sigma F factor antagonist  40.4 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2022  anti-sigma F factor antagonist  40.4 
 
 		 111 aa  87.8  4e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1557  anti-sigma-factor antagonist  42 
 
 		 111 aa  86.7  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1498  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.52 
 
 		 113 aa  83.2  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3440  anti-sigma-factor antagonist  39.29 
 
 		 115 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0613  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)-like protein  37.04 
 
 		 110 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0861  anti-sigma-factor antagonist  33.64 
 
 		 116 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0118  anti-sigma-factor antagonist  35.35 
 
 		 111 aa  79  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2286  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 113 aa  77.8  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.964684  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1686  anti-sigma B factor antagonist  39.29 
 
 		 111 aa  77.4  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0476  anti-sigma-factor antagonist  35.58 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.244597  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1874  anti- anti-sigma regulatory factor  34.04 
 
 		 113 aa  75.1  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000307887  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1663  anti-sigma-factor antagonist  40.43 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.457146  normal  0.122734 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  30.56 
 
 		 113 aa  73.6  0.000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.09 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2163  anti-sigma-factor antagonist  32.99 
 
 		 111 aa  71.6  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0395828  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  28.18 
 
 		 113 aa  70.5  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0435  anti-sigma-factor antagonist  33 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  29.63 
 
 		 120 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2665  anti-sigma-factor antagonist  31.63 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0501  anti-sigma-factor antagonist  32 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.868486 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1585  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 113 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.760541 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  30.53 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  27.78 
 
 		 118 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  33.67 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  29 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0115  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 110 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0135  anti-sigma F factor antagonist  25.24 
 
 		 117 aa  64.7  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.666066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  29.41 
 
 		 117 aa  64.3  0.0000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  29.59 
 
 		 116 aa  64.3  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 		 111 aa  64.3  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  27 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2649  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 113 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.779168  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  28.43 
 
 		 115 aa  63.5  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  30.63 
 
 		 111 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 109 aa  63.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3722  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  31.91 
 
 		 129 aa  63.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.853614  normal  0.538424 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  25.69 
 
 		 110 aa  63.2  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2044  anti-sigma-factor antagonist  33.03 
 
 		 111 aa  63.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000100859  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  25.93 
 
 		 170 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  28.57 
 
 		 112 aa  63.5  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2976  anti-sigma factor antagonist  34.44 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.467221  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5547  anti-sigma-factor antagonist  27.93 
 
 		 123 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  29.36 
 
 		 250 aa  62  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1838  anti-sigma-factor antagonist  27.1 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.422336  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2459  anti-sigma-factor antagonist  24.47 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00017667  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0347  anti-sigma-factor antagonist  30.28 
 
 		 117 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  31.19 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  26.37 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3195  anti-sigma-factor antagonist  34.23 
 
 		 132 aa  60.5  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00808217 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1972  anti-sigma-factor antagonist  28.16 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000507939  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4580  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  29.09 
 
 		 122 aa  60.1  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.81884  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0035  anti-sigma-factor antagonist  24.35 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  29.17 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0407  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0416  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.133402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0395  anti-sigma-factor antagonist  24.77 
 
 		 113 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.126622  normal  0.178954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  23.3 
 
 		 183 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1352  anti-sigma-factor antagonist  31.58 
 
 		 110 aa  58.9  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0187779  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1017  anti-sigma-factor antagonist  28.7 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.128025  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2660  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.144992  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1873  anti-sigma-factor antagonist  27.43 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.108927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1843  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  27.72 
 
 		 108 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1869  anti-sigma-factor antagonist  38.71 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.735453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2762  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000433544 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2619  anti-sigma-factor antagonist  27.27 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.531415  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  30.3 
 
 		 110 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2898  anti-sigma-factor antagonist  32.94 
 
 		 104 aa  57.8  0.00000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.195933  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1122  anti-anti-sigma factor  27.43 
 
 		 112 aa  57.8  0.00000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3990  anti-sigma-factor antagonist  31.33 
 
 		 117 aa  57.8  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000129231  normal  0.121632 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  27.52 
 
 		 111 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2011  anti-sigma-factor antagonist  28.85 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.382584  normal  0.0232293 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0177  anti-sigma-factor antagonist  28.72 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4033  anti-sigma-factor antagonist  34.34 
 
 		 110 aa  57  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0820  anti-sigma-factor antagonist  31.68 
 
 		 121 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  28.44 
 
 		 111 aa  57  0.00000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6797  anti-sigma-factor antagonist  29.41 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0073  anti-sigma-factor antagonist  31.19 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0167054 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1501  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  32.11 
 
 		 115 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0151  anti-sigma-factor antagonist  32.11 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.458723 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  28.32 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>