More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_06470 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_06470  glutamate synthase (NADPH) small subunit  100 
 
 
476 aa  964    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000571005  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0651  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  63.92 
 
 
466 aa  590  1e-167  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.990694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1517  putative oxidoreductase  63.77 
 
 
463 aa  590  1e-167  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0372  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  63.25 
 
 
464 aa  590  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.63559  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2545  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  60 
 
 
464 aa  567  1e-160  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000029955  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1304  putative oxidoreductase  61.18 
 
 
468 aa  558  1e-158  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1151  putative oxidoreductase  60.97 
 
 
468 aa  561  1e-158  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0227  putative oxidoreductase  63.46 
 
 
469 aa  548  1e-155  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.967797 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1071  putative oxidoreductase  58.82 
 
 
468 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.188657  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0550  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.32 
 
 
463 aa  551  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1328  putative oxidoreductase  60.56 
 
 
455 aa  546  1e-154  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.100001  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0551  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.87 
 
 
479 aa  545  1e-154  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1163  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.19 
 
 
457 aa  542  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0752  putative oxidoreductase  59.49 
 
 
470 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000025302  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_36  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  57.08 
 
 
465 aa  537  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.800256  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0035  putative oxidoreductase  57.3 
 
 
465 aa  536  1e-151  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0177614  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0038  putative oxidoreductase  57.08 
 
 
465 aa  532  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.237423  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2596  putative oxidoreductase  59.57 
 
 
469 aa  534  1e-150  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.712045  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2830  putative oxidoreductase  57.94 
 
 
469 aa  533  1e-150  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00165731  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3501  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  60.26 
 
 
463 aa  525  1e-148  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.860483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3635  putative oxidoreductase  57.05 
 
 
476 aa  527  1e-148  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000713283  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0317  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.98 
 
 
469 aa  526  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000287651  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1263  putative oxidoreductase  56.84 
 
 
468 aa  523  1e-147  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00449905  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0644  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  58.85 
 
 
474 aa  518  1e-146  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000739676  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2781  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.49 
 
 
497 aa  520  1e-146  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.662826  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3057  putative oxidoreductase  56.9 
 
 
470 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1463  putative oxidoreductase  56.42 
 
 
468 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.201307  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1068  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  59.53 
 
 
461 aa  520  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000664223  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1900  putative bifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta  59.87 
 
 
747 aa  516  1.0000000000000001e-145  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.22072  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0436  putative oxidoreductase  56.66 
 
 
482 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.259877  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2411  putative oxidoreductase  56.53 
 
 
471 aa  513  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000146466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0489  putative oxidoreductase  54.76 
 
 
482 aa  514  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0493  putative oxidoreductase  55.96 
 
 
477 aa  511  1e-143  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0661627  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2002  putative oxidoreductase  56.2 
 
 
480 aa  510  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.14117  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1693  putative oxidoreductase  56.08 
 
 
483 aa  509  1e-143  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.195871  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0283  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.89 
 
 
464 aa  510  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0793  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.03 
 
 
761 aa  507  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.272826  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0020  putative oxidoreductase  55.79 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1250  putative oxidoreductase  55.37 
 
 
476 aa  507  9.999999999999999e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0021  putative oxidoreductase  56.22 
 
 
469 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1607  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.08 
 
 
467 aa  502  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0407  putative oxidoreductase  54.28 
 
 
503 aa  500  1e-140  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0863164  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0537  putative oxidoreductase  54.91 
 
 
480 aa  499  1e-140  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2150  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.05 
 
 
480 aa  500  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.60175  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0766  putative oxidoreductase  55.53 
 
 
476 aa  501  1e-140  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0956688 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0617  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.89 
 
 
466 aa  498  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.268237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2934  putative oxidoreductase  57.23 
 
 
459 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.912851  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0938  putative oxidoreductase  55.53 
 
 
481 aa  494  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1282  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  56.37 
 
 
447 aa  484  1e-135  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1138  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.33 
 
 
458 aa  484  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1111  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.52 
 
 
469 aa  478  1e-134  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0084  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.62 
 
 
476 aa  481  1e-134  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0337  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.37 
 
 
467 aa  477  1e-133  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1828  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.95 
 
 
448 aa  478  1e-133  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.756124 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0313  putative oxidoreductase  55.94 
 
 
473 aa  475  1e-133  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2748  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.98 
 
 
1005 aa  476  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.036886  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0167  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  53.9 
 
 
465 aa  472  1e-132  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.609581  normal  0.315729 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0820  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  55.05 
 
 
466 aa  472  1e-132  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2033  glutamate synthase, small subunit  52.12 
 
 
462 aa  465  9.999999999999999e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000276272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1006  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  52.1 
 
 
994 aa  466  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1984  putative oxidoreductase  54.06 
 
 
473 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.292785  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2791  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.52 
 
 
1008 aa  461  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2977  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.52 
 
 
1011 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.118712  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2885  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  50.52 
 
 
1011 aa  460  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1117  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  52.47 
 
 
447 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1112  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  53.73 
 
 
446 aa  448  1e-125  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0745  putative trifunctional 2-polyprenylphenol hydroxylase/glutamate synthase subunit beta/ferritin domain-containing protein  51.06 
 
 
994 aa  441  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.375637  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2796  sulfide dehydrogenase (flavoprotein) subunit SudA  47.41 
 
 
477 aa  424  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144083  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4566  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.34 
 
 
438 aa  358  9e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000191225  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0958  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  44.06 
 
 
944 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0850  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.85 
 
 
942 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0703  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  44.26 
 
 
944 aa  354  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3208  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.47 
 
 
947 aa  352  8e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.950859  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5203  putative bifunctional glutamate synthase subunit beta/2-polyprenylphenol hydroxylase  43.65 
 
 
944 aa  352  8e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1069  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  43.59 
 
 
465 aa  343  2.9999999999999997e-93  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000858078  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0539  glutamate synthase (NADPH), homotetrameric  42.89 
 
 
483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000497626  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2212  putative oxidoreductase  44.2 
 
 
465 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2503  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.39 
 
 
663 aa  323  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2825  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  43.06 
 
 
699 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2969  putative oxidoreductase  41.19 
 
 
411 aa  319  6e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.765819  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2873  glutamate synthase subunit beta  36.52 
 
 
468 aa  318  1e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0110656 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0262  putative oxidoreductase  42.11 
 
 
462 aa  318  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1012  glutamate synthase subunit beta  37.69 
 
 
469 aa  317  2e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3051  glutamate synthase subunit beta  36.52 
 
 
468 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2955  glutamate synthase subunit beta  36.31 
 
 
468 aa  315  8e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0982485 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1324  glutamate synthase subunit beta  36.09 
 
 
468 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2037  hydrogenase, Fe-only  41.75 
 
 
1150 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.163812  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1933  glutamate synthase, small subunit  38.71 
 
 
469 aa  315  9.999999999999999e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.889564  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1031  glutamate synthase subunit beta  37.74 
 
 
469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.473013  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1254  glutamate synthase subunit beta  37.08 
 
 
468 aa  313  3.9999999999999997e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.55842 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1177  glutamate synthase subunit beta  37.08 
 
 
468 aa  313  4.999999999999999e-84  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.407199  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1135  glutamate synthase subunit beta  36.86 
 
 
468 aa  312  6.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1958  glutamate synthase subunit beta  38.08 
 
 
470 aa  312  7.999999999999999e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1221  glutamate synthase subunit beta  36.86 
 
 
468 aa  312  9e-84  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2614  putative oxidoreductase Fe-S binding subunit  37.45 
 
 
659 aa  311  1e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0856  glutamate synthase subunit beta  37.76 
 
 
472 aa  311  1e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.428629 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1202  glutamate synthase, small subunit  37.45 
 
 
659 aa  311  2e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0824  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  42.52 
 
 
1126 aa  310  2e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.633226 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3136  glutamate synthase subunit beta  37.25 
 
 
468 aa  311  2e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.632002 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02321  hypothetical protein  37.45 
 
 
659 aa  311  2e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>