More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05860 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05860  sporulation sigma factor SigK  100 
 
 
232 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165586  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0982  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  60.37 
 
 
256 aa  258  8e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2798  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  60.45 
 
 
234 aa  254  7e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1582  sporulation sigma factor SigK  59.43 
 
 
226 aa  253  2.0000000000000002e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000492275  normal  0.195753 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1501  sporulation sigma factor SigK  58.11 
 
 
231 aa  251  5.000000000000001e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1012  sporulation sigma factor SigK  59.91 
 
 
236 aa  251  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000934138  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2020  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigK  55.66 
 
 
239 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.851025  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2021  sporulation sigma factor SigK  52.84 
 
 
233 aa  242  3.9999999999999997e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.653409  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1738  sporulation sigma factor SigK  52.84 
 
 
233 aa  241  6e-63  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.475543  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0517  sporulation sigma factor SigK  57.14 
 
 
244 aa  241  6e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2471  sporulation sigma factor SigK  56.64 
 
 
236 aa  240  2e-62  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3546  sporulation sigma factor SigK  53.25 
 
 
249 aa  237  1e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3065  sporulation sigma factor SigK  55.76 
 
 
237 aa  236  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4236  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
237 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4074  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
237 aa  232  5e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4084  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
237 aa  232  5e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0778  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
237 aa  232  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.377161  hitchhiker  0.0088749 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4566  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
237 aa  232  5e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4459  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
237 aa  232  5e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.177817  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4190  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
237 aa  232  5e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4472  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
237 aa  232  5e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4421  sporulation sigma factor SigK  55.3 
 
 
265 aa  231  6e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0982  sporulation sigma factor SigK  53.98 
 
 
245 aa  231  9e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0736  sporulation sigma factor SigK  59.22 
 
 
219 aa  226  3e-58  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000259555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1030  sporulation sigma factor SigE  51.18 
 
 
239 aa  212  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000129886  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1290  sporulation sigma factor SigE  49.29 
 
 
249 aa  211  1e-53  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1900  sporulation sigma factor SigE  50.24 
 
 
239 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2015  sporulation sigma factor SigE  50.23 
 
 
235 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.785691  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1733  sporulation sigma factor SigE  50.23 
 
 
235 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0265453  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3957  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000112899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3949  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000781708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3755  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00369355  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3646  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000510031  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4005  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00100878  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3663  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000395259  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4043  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000123936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1236  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000024975  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3918  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  202  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000071882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0686  sporulation sigma factor SigE  49.29 
 
 
241 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.144622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2553  sporulation sigma factor SigE  48.82 
 
 
239 aa  201  6e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000344705  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3731  sporulation sigma factor SigE  48.34 
 
 
239 aa  200  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278458  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1066  sporulation sigma factor SigE  48.34 
 
 
241 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000178993  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0852  sporulation sigma factor SigE  48.54 
 
 
243 aa  199  3e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0114797  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2001  sporulation sigma factor SigE  50.97 
 
 
241 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000755771  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2290  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  53.37 
 
 
207 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.345877  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2062  sporulation sigma factor SigE  47.71 
 
 
243 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000360983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1426  sporulation sigma factor SigE  49.02 
 
 
241 aa  194  8.000000000000001e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1310  sporulation sigma factor SigE  45.45 
 
 
239 aa  194  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000184343  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09150  sporulation sigma factor SigE  48.31 
 
 
245 aa  193  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000261644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1553  sporulation sigma factor SigE  48.54 
 
 
242 aa  192  5e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0835  sporulation sigma factor SigE  47.6 
 
 
240 aa  191  6e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.935984  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0787  sporulation sigma factor SigE  49.28 
 
 
244 aa  191  1e-47  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.761292  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2469  sporulation sigma factor SigE  47.32 
 
 
246 aa  189  2e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130703  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0447  sporulation sigma factor SigE  48.79 
 
 
244 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000743913  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2655  sporulation sigma factor SigK  47.95 
 
 
232 aa  187  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4054  sporulation sigma factor SigE  48.1 
 
 
249 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000091924  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4418  RNA polymerase sigma-K factor  62.12 
 
 
149 aa  170  2e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0997  sigma-70 region 2 domain-containing protein  62.39 
 
 
118 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1770  RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  67.35 
 
 
114 aa  135  6.0000000000000005e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.692748  normal  0.378996 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0501  sigma 28 (flagella/sporulation)  60.91 
 
 
126 aa  134  8e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1737  putative RNA polymerase, sigma 28 subunit, FliA/WhiG family  50.89 
 
 
113 aa  110  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0277937 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0912  sigma-70 region 4 domain-containing protein  49.11 
 
 
118 aa  108  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0374  sporulation sigma factor SigF  31.47 
 
 
252 aa  99  6e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1726  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  31.71 
 
 
369 aa  97.8  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2250  sporulation sigma factor SigF  31.08 
 
 
250 aa  97.1  2e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0788  sporulation sigma factor SigG  34.02 
 
 
255 aa  96.7  3e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.667987  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2468  sporulation sigma factor SigG  30 
 
 
260 aa  95.1  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000740675  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0624  RNA polymerase sigma factor RpoD  32.39 
 
 
361 aa  94  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00076534  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09160  sporulation sigma factor SigG  32.22 
 
 
260 aa  92  8e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000197734  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0905  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.35 
 
 
361 aa  91.7  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000725553  hitchhiker  0.000024964 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4216  RNA polymerase sigma factor RpoD  32.38 
 
 
372 aa  89.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000301264  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2462  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.61 
 
 
367 aa  89.4  5e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0127291  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07020  sporulation sigma factor SigF  30.31 
 
 
257 aa  89  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1314  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.89 
 
 
357 aa  89  6e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000145678  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0120  RNA polymerase, sigma 28 subunit  31.36 
 
 
246 aa  88.6  8e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0492  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.36 
 
 
360 aa  88.6  9e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.187427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12400  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  30.49 
 
 
358 aa  88.2  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0607  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1559  FliA/WhiG family RNA polymerase sigma factor  31.58 
 
 
246 aa  88.2  1e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1215  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD family  31.3 
 
 
360 aa  87.8  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.00000000000256701  hitchhiker  0.00656648 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41331  predicted protein  29.11 
 
 
344 aa  87  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.060749  normal  0.0231462 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0713  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  31.45 
 
 
417 aa  87.4  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2414  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.89 
 
 
374 aa  87  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000700134  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1680  RNA polymerase, sigma 28 subunit, Sig B/F/G subfamily  31.38 
 
 
232 aa  87  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0577  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  33.06 
 
 
280 aa  87  2e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0157  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.65 
 
 
375 aa  86.3  4e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.96 
 
 
407 aa  86.3  4e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000061259  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1343  RpoD family RNA polymerase sigma factor  29.96 
 
 
407 aa  86.3  4e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000691641  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3521  RpoD family RNA polymerase sigma factor  30.65 
 
 
372 aa  85.9  5e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0582772  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2284  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  28.02 
 
 
249 aa  85.9  5e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3442  RNA polymerase, sigma 28 subunit, SigF  32.14 
 
 
261 aa  85.5  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0757  RNA polymerase, sigma 70 subunit, RpoD subfamily  29.03 
 
 
326 aa  85.1  8e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2061  sporulation sigma factor SigG  29.29 
 
 
257 aa  85.1  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147139  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4372  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.08 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000624256  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4194  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.08 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000145872  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4314  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.08 
 
 
373 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.2227e-62 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3903  sporulation sigma factor SigF  28.52 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.715722  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3157  RpoD family RNA polymerase sigma factor  28.95 
 
 
345 aa  84.7  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4144  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.08 
 
 
375 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000635558  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3019  RNA polymerase sigma factor RpoD  30.08 
 
 
373 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000207905  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0448  sporulation sigma factor SigG  29.71 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000243038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>