More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05690 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  100 
 
 
806 aa  1665    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  42.76 
 
 
905 aa  533  1e-150  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  40.95 
 
 
765 aa  488  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  41.17 
 
 
761 aa  475  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2389  penicillin-binding protein, 1A family  41.63 
 
 
727 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.390791  normal  0.221681 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1646  1A family penicillin-binding protein  39.85 
 
 
828 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.651104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2648  penicillin-binding protein, 1A family  37.64 
 
 
814 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.213317  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  40.5 
 
 
618 aa  444  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  40.97 
 
 
648 aa  442  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  40.99 
 
 
727 aa  440  9.999999999999999e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1109  peptidoglycan glycosyltransferase  36.25 
 
 
795 aa  436  1e-121  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000046818  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  41.12 
 
 
761 aa  426  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  39.35 
 
 
661 aa  427  1e-118  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1300  penicillin-binding protein, 1A family  39.4 
 
 
648 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.396458  hitchhiker  0.0031785 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0395  penicillin-binding protein, 1A family  43.36 
 
 
709 aa  421  1e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.14301  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  40.54 
 
 
643 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  40.54 
 
 
643 aa  420  1e-116  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  38.59 
 
 
643 aa  421  1e-116  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2066  1A family penicillin-binding protein  38.59 
 
 
640 aa  414  1e-114  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0926  penicillin-binding protein 1A  38.09 
 
 
640 aa  413  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1812  penicillin-binding protein, 1A family  37.11 
 
 
941 aa  414  1e-114  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.022556  normal  0.0842954 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0242  1A family penicillin-binding protein  37.01 
 
 
829 aa  410  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0080  1A family penicillin-binding protein  38.3 
 
 
704 aa  409  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  39.12 
 
 
654 aa  407  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3571  penicillin-binding protein, 1A family  38.4 
 
 
744 aa  402  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0950  penicillin-binding protein 1A  38.85 
 
 
776 aa  403  1e-111  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0135  1A family penicillin-binding protein  37.88 
 
 
646 aa  404  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000146416  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0785  penicillin-binding protein 1A  40.3 
 
 
712 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.649225 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3502  penicillin-binding protein, 1A family  37.39 
 
 
701 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.114695  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20671  putative penicillin binding protein  38.12 
 
 
658 aa  396  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.427619 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  38.47 
 
 
649 aa  397  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0235  penicillin-binding protein, 1A family  36.62 
 
 
880 aa  394  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2430  1A family penicillin-binding protein  37.44 
 
 
667 aa  391  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000145418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1803  1A family penicillin-binding protein  38.37 
 
 
708 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1561  1A family penicillin-binding protein  34.57 
 
 
662 aa  389  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1671  penicillin-binding protein 1A  36.26 
 
 
693 aa  389  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.0000000000343648  normal  0.536303 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2904  penicillin-binding protein, 1A family  38.82 
 
 
811 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2069  penicillin-binding protein, 1A family  35.72 
 
 
843 aa  382  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.23157 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4703  1A family penicillin-binding protein  40.1 
 
 
755 aa  379  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1342  penicillin-binding protein, 1A family  39.1 
 
 
824 aa  379  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1371  penicillin-binding protein, 1A family  39.1 
 
 
824 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  35.26 
 
 
668 aa  379  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3462  penicillin-binding protein, 1A family  36.67 
 
 
681 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2571  penicillin-binding protein 1A  37.52 
 
 
625 aa  373  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.558946  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1760  1A family penicillin-binding protein  35.6 
 
 
824 aa  374  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.590244  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3888  1A family penicillin-binding protein  34.8 
 
 
683 aa  370  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.318045  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3673  penicillin-binding protein 1A  37.52 
 
 
679 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  37.73 
 
 
751 aa  372  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2011  penicillin-binding protein, 1A family  36.63 
 
 
676 aa  372  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3992  bifunctional peptidoglycan glycosyl transferase/transpeptidase  39.56 
 
 
687 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.155009  normal  0.126986 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5504  penicillin-binding protein  36.93 
 
 
683 aa  368  1e-100  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0389  penicillin-binding protein, 1A family  36.89 
 
 
656 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5467  penicillin-binding protein  36.77 
 
 
683 aa  366  1e-100  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2885  penicillin-binding protein, 1A family  35.56 
 
 
705 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.060613  normal  0.0841224 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5553  penicillin-binding protein  36.77 
 
 
683 aa  368  1e-100  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0878  1A family penicillin-binding protein  38.08 
 
 
626 aa  366  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209414  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5055  penicillin-binding protein  36.77 
 
 
683 aa  366  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  35.19 
 
 
750 aa  365  1e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5223  penicillin-binding protein  36.61 
 
 
683 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5623  penicillin-binding protein  36.61 
 
 
683 aa  364  3e-99  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5071  penicillin-binding protein  36.61 
 
 
683 aa  363  9e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0343  penicillin-binding protein, 1A family  34.26 
 
 
774 aa  363  9e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.314658  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1773  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 
713 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0432  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 
713 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0339  1A family penicillin-binding protein  37.19 
 
 
713 aa  362  2e-98  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04231  putative penicillin binding protein  39.07 
 
 
602 aa  361  3e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5453  penicillin-binding protein  36.45 
 
 
683 aa  361  3e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1510  penicillin-binding protein  38.02 
 
 
680 aa  361  3e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00148274  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3835  penicillin-binding protein 1F (PBP-1F)  38.39 
 
 
680 aa  360  4e-98  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.288255  hitchhiker  0.000000000138665 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5497  penicillin-binding protein  36.29 
 
 
683 aa  360  4e-98  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0214  penicillin-binding protein 1A  37.02 
 
 
707 aa  360  5e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.560264 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0378  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 
706 aa  360  7e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1421  penicillin-binding protein, 1A family  34.4 
 
 
801 aa  360  7e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3175  1A family penicillin-binding protein  38.1 
 
 
728 aa  360  7e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0805  penicillin-binding protein 1A  36.54 
 
 
680 aa  360  8e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0444532  normal  0.0112407 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1574  penicillin-binding protein 1A  37.58 
 
 
692 aa  360  9e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.53157  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2145  1A family penicillin-binding protein  35.96 
 
 
710 aa  359  9.999999999999999e-98  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1662  penicillin-binding protein, 1A family  35.44 
 
 
641 aa  358  1.9999999999999998e-97  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0230807  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0832  1A family penicillin-binding protein  35.66 
 
 
713 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.313161  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1832  1A family penicillin-binding protein  35.66 
 
 
713 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.421648  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1123  1A family penicillin-binding protein  35.66 
 
 
713 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.438177  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1945  penicillin-binding protein 1A  34.69 
 
 
752 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.419198  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5168  1A family penicillin-binding protein  34.88 
 
 
683 aa  357  2.9999999999999997e-97  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1948  1A family penicillin-binding protein  34.3 
 
 
855 aa  357  3.9999999999999996e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0242  penicillin-binding protein, 1A family  34.61 
 
 
730 aa  357  5.999999999999999e-97  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  decreased coverage  0.00000113999  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0683  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a)  34.73 
 
 
642 aa  357  6.999999999999999e-97  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0048  succinate dehydrogenase, iron-sulfur protein subunit  34.69 
 
 
642 aa  356  7.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  37.46 
 
 
710 aa  356  7.999999999999999e-97  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0290  1A family penicillin-binding protein  37.34 
 
 
757 aa  356  7.999999999999999e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0163  1A family penicillin-binding protein  33.06 
 
 
713 aa  356  1e-96  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1892  penicillin-binding protein 1A  37.09 
 
 
655 aa  356  1e-96  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.477214  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0983  penicillin-binding protein 1A (PBP-1a) (PBP1a) (penicillin-bindingprotein A)  35.03 
 
 
638 aa  355  2e-96  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1378  1A family penicillin-binding protein  36.62 
 
 
679 aa  354  4e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000265206  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5424  penicillin-binding protein 1A  36.2 
 
 
709 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.122893  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4831  1A family penicillin-binding protein  36.2 
 
 
709 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.982435 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0305  penicillin-binding protein  38.69 
 
 
833 aa  353  5e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5438  1A family penicillin-binding protein  36.2 
 
 
709 aa  353  5e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.899041 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1616  penicillin-binding protein  37.32 
 
 
680 aa  352  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866869  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3352  penicillin-binding protein, 1A family  35.93 
 
 
683 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00461101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1336  penicillin-binding protein 2A  37.14 
 
 
680 aa  352  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000691863  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>