More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05040 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 509 aa  1013    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  26.82 
 
 		 621 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  32.88 
 
 		 379 aa  152  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.66 
 
 		 377 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.58 
 
 		 450 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  30.31 
 
 		 376 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1164  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.25 
 
 		 467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.748472 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2370  secretion protein HlyD  28.76 
 
 		 405 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000467489 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0926  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.05 
 
 		 490 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  29.19 
 
 		 421 aa  125  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.23 
 
 		 397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  28.91 
 
 		 399 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  23.97 
 
 		 517 aa  117  6.9999999999999995e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3253  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.79 
 
 		 496 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.38 
 
 		 496 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0267  RND family efflux transporter MFP subunit  26.95 
 
 		 586 aa  111  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117926 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.83 
 
 		 504 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2377  RND family efflux transporter MFP subunit  24.04 
 
 		 609 aa  111  3e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.40782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3638  secretion protein HlyD family protein  25.67 
 
 		 503 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.266214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  34.01 
 
 		 356 aa  109  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3522  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 		 421 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2584  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0644  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0200148  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0355  secretion protein HlyD family protein  24.58 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000356343  hitchhiker  0.000000558214 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0500  secretion protein HlyD family protein  25.28 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0870  acriflavin resistance periplasmic protein  25.2 
 
 		 351 aa  104  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1421  HlyD family secretion protein  27.91 
 
 		 354 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0100677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2634  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal  0.987528 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2192  secretion protein HlyD  28.97 
 
 		 352 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1441  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 		 634 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1938  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.41 
 
 		 462 aa  103  6e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000755017  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  29.55 
 
 		 350 aa  103  7e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2514  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 354 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000208657  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1146  RND family efflux transporter MFP subunit  25.2 
 
 		 351 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1830  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.57 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000238284  normal  0.23398 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2020  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.58 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.152554 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2521  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.199325  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  27.98 
 
 		 354 aa  102  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2229  RND family efflux transporter MFP subunit  26.79 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.17 
 
 		 379 aa  100  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.42 
 
 		 380 aa  100  6e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0268  RND family efflux transporter MFP subunit  25.88 
 
 		 587 aa  100  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0795166 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01077  HlyD family secretion protein  28.23 
 
 		 376 aa  100  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4736  secretion protein HlyD  23.14 
 
 		 510 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.325985  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1879  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1629  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 358 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.185382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1704  RND family efflux transporter MFP subunit  28.38 
 
 		 358 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.271919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1649  RND family efflux transporter MFP subunit  27.85 
 
 		 354 aa  99.4  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.499517  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1554  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.19 
 
 		 363 aa  99.4  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0484603  hitchhiker  0.00000015248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0962  secretion protein HlyD  29.19 
 
 		 405 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.255558  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2237  secretion protein HlyD  27.48 
 
 		 377 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1781  RND family efflux transporter MFP subunit  26.48 
 
 		 368 aa  99  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.253325  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2275  RND family efflux transporter MFP subunit  27.04 
 
 		 354 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0060878  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1925  HlyD family secretion protein  27.98 
 
 		 354 aa  97.8  4e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2046  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.35 
 
 		 442 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0775  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.54 
 
 		 479 aa  97.1  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2820  RND family efflux transporter MFP subunit  27.03 
 
 		 363 aa  97.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal  0.368522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3760  secretion protein HlyD  26.13 
 
 		 362 aa  95.9  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.196565 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  28.91 
 
 		 373 aa  96.3  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0059  RND family efflux transporter MFP subunit  31.21 
 
 		 411 aa  96.7  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1830  RND family efflux transporter MFP subunit  26.94 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.495597  normal  0.102007 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.3 
 
 		 407 aa  95.5  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.32 
 
 		 608 aa  95.9  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0901  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.77 
 
 		 351 aa  95.1  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.470272  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2381  RND family efflux transporter MFP subunit  25.83 
 
 		 357 aa  95.9  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0175  hypothetical protein  26.94 
 
 		 380 aa  95.1  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.109936  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0930  RND family efflux transporter MFP subunit  26.98 
 
 		 366 aa  95.5  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1783  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.51 
 
 		 354 aa  94.7  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3803  RND family efflux transporter MFP subunit  26.8 
 
 		 376 aa  94.7  3e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1439  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.57 
 
 		 380 aa  94.7  3e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0465471  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2514  acriflavin resistance protein B  27.03 
 
 		 371 aa  94.7  4e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.825279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0098  efflux transporter, RND family, MFP subunit  29.07 
 
 		 432 aa  94.7  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2036  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.92 
 
 		 346 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0261077  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1999  RND family efflux transporter MFP subunit  28.12 
 
 		 390 aa  94  5e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00132105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1700  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.92 
 
 		 346 aa  94  5e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.116912  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1036  RND family efflux transporter MFP subunit  25.41 
 
 		 354 aa  94.4  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1216  RND family efflux transporter MFP subunit  28.63 
 
 		 379 aa  94  6e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.62 
 
 		 387 aa  93.6  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0364  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.44 
 
 		 362 aa  93.6  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.405995  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1047  RND family efflux transporter subunit MFP  25.89 
 
 		 461 aa  93.6  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0423833  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3151  secretion protein HlyD family protein  25.1 
 
 		 533 aa  93.2  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0856  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.72 
 
 		 370 aa  93.2  1e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2132  HlyD family secretion protein  25.93 
 
 		 360 aa  93.2  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.732379  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3832  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 		 374 aa  92.8  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1593  RND family efflux transporter MFP subunit  23.02 
 
 		 631 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.351482  normal  0.814117 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3467  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.83 
 
 		 376 aa  92.8  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00013135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1476  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.8 
 
 		 366 aa  92.8  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142053  normal  0.195363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2347  RND family efflux transporter MFP subunit  26.64 
 
 		 374 aa  92.8  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.161325  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0176  RND family efflux transporter MFP subunit  27.01 
 
 		 353 aa  92.4  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.371241 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1145  hypothetical protein  29.39 
 
 		 371 aa  92.4  2e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01736  HlyD family secretion protein  26.09 
 
 		 349 aa  92.4  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1602  RND family efflux transporter MFP subunit  22.83 
 
 		 641 aa  91.7  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5959  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.49 
 
 		 383 aa  91.3  4e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.42426  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2074  chemiosmotic efflux system protein B-like protein  27.27 
 
 		 322 aa  91.3  4e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1993  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.31 
 
 		 487 aa  90.9  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.702751  normal  0.0246521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0527  RND family efflux transporter MFP subunit  26.75 
 
 		 376 aa  91.3  4e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3456  RND family efflux transporter MFP subunit  25.62 
 
 		 391 aa  91.3  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.2 
 
 		 388 aa  90.5  7e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1866  RND family efflux transporter MFP subunit  27 
 
 		 385 aa  90.5  7e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000232808  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2559  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.54 
 
 		 349 aa  90.1  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.99545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>