More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_05030 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_05030  outer membrane efflux protein  100 
 
 
471 aa  940    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.691581  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0961  Outer membrane protein-like  25.51 
 
 
491 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0234127  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3465  Outer membrane efflux protein  22.47 
 
 
441 aa  121  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4142  outer membrane efflux protein  24.94 
 
 
497 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.958426  hitchhiker  0.00365026 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5561  outer membrane efflux protein  24.37 
 
 
431 aa  113  9e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1749  outer membrane efflux protein  23.06 
 
 
458 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3801  outer membrane efflux protein  28.08 
 
 
449 aa  110  6e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.233057 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4182  outer membrane efflux protein  24.74 
 
 
431 aa  109  1e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.256436  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2441  outer membrane efflux protein  21.6 
 
 
453 aa  107  4e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0833  outer membrane efflux protein  21.28 
 
 
496 aa  105  2e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3298  outer membrane efflux protein  25.11 
 
 
418 aa  102  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000531453  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2799  outer membrane efflux protein  23.18 
 
 
435 aa  100  4e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.0000000194078  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0094  outer membrane efflux protein, putative  24.29 
 
 
501 aa  100  6e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0379352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1617  outer membrane efflux protein  21.76 
 
 
467 aa  99.8  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1217  outer membrane efflux protein  27.44 
 
 
438 aa  98.6  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.87899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0162  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 
433 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1027  outer membrane efflux protein  23.23 
 
 
452 aa  95.5  2e-18  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0566  outer membrane efflux protein  23.16 
 
 
473 aa  94  5e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.151183 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0610  outer membrane efflux protein  22.68 
 
 
453 aa  94  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0477  outer membrane efflux protein  23.52 
 
 
517 aa  93.6  7e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0917942 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3746  outer membrane efflux protein  22.85 
 
 
463 aa  92.8  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.622366  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1211  hypothetical protein  23.9 
 
 
476 aa  91.3  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000512131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0066  outer membrane efflux protein  21.37 
 
 
443 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0582  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
464 aa  91.3  4e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0283  outer membrane efflux protein  22.69 
 
 
439 aa  90.9  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2664  outer membrane efflux protein  21.57 
 
 
1496 aa  89.4  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4260  outer membrane efflux protein  21.69 
 
 
438 aa  88.6  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1384  outer membrane efflux protein  21.34 
 
 
435 aa  88.6  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.642492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2517  Outer membrane efflux protein  24.65 
 
 
455 aa  88.2  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0940003  normal  0.677218 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0837  outer membrane efflux protein  21.83 
 
 
462 aa  88.2  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3004  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.92 
 
 
464 aa  87.8  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.599739 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0071  outer membrane efflux protein  21 
 
 
441 aa  87  7e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0526  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00662182  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3464  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0487  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3640  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
489 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0505  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 
489 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0530  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 
473 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40399  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5578  outer membrane efflux protein  21.02 
 
 
451 aa  85.5  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.46516 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0954  outer membrane efflux protein  22.92 
 
 
463 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4090  outer membrane efflux protein  22.74 
 
 
473 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0574  outer membrane efflux protein  24.76 
 
 
427 aa  84.7  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000581742  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0427  outer membrane efflux protein  22.93 
 
 
455 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.410338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3814  outer membrane efflux protein  23.02 
 
 
493 aa  84.3  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000440013  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1177  outer membrane efflux protein  20.66 
 
 
427 aa  83.6  0.000000000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2365  outer membrane efflux protein  22.4 
 
 
482 aa  83.6  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.316372 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0063  outer membrane efflux protein  21.56 
 
 
408 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0180654  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1390  outer membrane efflux protein  21.64 
 
 
463 aa  82.8  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0182398  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0411  outer membrane efflux protein  23 
 
 
467 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0338477  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0364  outer membrane channel protein  22.78 
 
 
500 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3129  Outer membrane efflux protein  21.33 
 
 
446 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000215977  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2026  TolC family type I secretion outer membrane protein  21.58 
 
 
405 aa  82.4  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341805  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4447  outer membrane efflux protein  23.33 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1633  outer membrane efflux protein  22 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.159543  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0814  outer membrane efflux protein  20.47 
 
 
460 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0456  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0455  outer membrane efflux protein  21.86 
 
 
463 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1174  outer membrane efflux protein  21.55 
 
 
457 aa  81.6  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.89041 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0096  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 
441 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0836  outer membrane efflux protein  22.01 
 
 
446 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003318  outer membrane protein  22.65 
 
 
471 aa  79.7  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1376  Outer membrane efflux protein  21.06 
 
 
435 aa  79  0.0000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.109779  hitchhiker  0.00244241 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02434  hypothetical protein  22.35 
 
 
463 aa  78.6  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4394  outer membrane efflux protein  21.81 
 
 
465 aa  79  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000587559  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3730  outer membrane efflux protein  22.29 
 
 
477 aa  79  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1990  outer membrane efflux protein  18.89 
 
 
471 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.154832  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0831  outer membrane efflux protein  19.3 
 
 
419 aa  77.8  0.0000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1380  outer membrane efflux protein  21.97 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2818  TolC family type I secretion outer membrane protein  23.89 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.282777  normal  0.979363 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2368  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 
473 aa  77  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0254327  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0627  outer membrane efflux protein, putative  20.54 
 
 
470 aa  77  0.0000000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.173588  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2001  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 
473 aa  77  0.0000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.612283  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1835  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.58 
 
 
447 aa  77  0.0000000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.211257  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2704  outer membrane efflux protein  21.48 
 
 
423 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0881  outer membrane efflux protein  22.61 
 
 
535 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.705042  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0224  outer membrane efflux protein  20.58 
 
 
419 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000720591  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0938  outer membrane efflux family protein  22.77 
 
 
452 aa  76.3  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0391  Outer membrane efflux family protein  22.98 
 
 
437 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4284  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 
447 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3563  outer membrane channel protein  23.55 
 
 
434 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000135514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0945  outer membrane efflux family protein  22.48 
 
 
456 aa  74.7  0.000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.681331  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3627  outer membrane efflux protein  21.45 
 
 
461 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.433273  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1884  outer membrane efflux protein  20.54 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6495  type I secretion outer membrane protein, TolC family  21.18 
 
 
518 aa  74.7  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3853  outer membrane efflux protein  21.43 
 
 
447 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1297  RND efflux system outer membrane lipoprotein  20.96 
 
 
523 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3429  outer membrane efflux protein  20.57 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.437271  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0066  outer membrane efflux protein  21.08 
 
 
436 aa  73.6  0.000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3937  outer membrane efflux protein  22.41 
 
 
447 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00157367 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0943  TolC family type I secretion outer membrane protein  22.06 
 
 
481 aa  73.6  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.359214  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0057  outer membrane protein, putative  20.71 
 
 
470 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0722  TolC family type I secretion outer membrane protein  19.65 
 
 
449 aa  72.8  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.278359  normal  0.698539 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2724  outer membrane efflux protein  19.92 
 
 
440 aa  72  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.190068  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0498  type I secretion outer membrane protein, TolC family  22.74 
 
 
494 aa  72  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2583  Type I secretion outer membrane protein, TolC  21.99 
 
 
497 aa  72  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0849  outer membrane efflux protein  20.71 
 
 
417 aa  71.2  0.00000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000450472  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2001  LipD protein, putative  19.67 
 
 
445 aa  70.5  0.00000000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.538795  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2629  outer membrane efflux protein  20.44 
 
 
421 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111539  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4153  outer membrane efflux protein  20.95 
 
 
447 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3116  outer membrane efflux protein  23.05 
 
 
465 aa  70.5  0.00000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>