More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04830 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04830  MATE efflux family protein  100 
 
 
468 aa  925    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000202645  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0645  MATE efflux family protein  37.06 
 
 
462 aa  321  1.9999999999999998e-86  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000346552  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0381  MATE efflux family protein  38.93 
 
 
451 aa  318  1e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00954667  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1180  MATE efflux family protein  37.02 
 
 
455 aa  309  5.9999999999999995e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0147  MATE efflux family protein  36.34 
 
 
462 aa  298  2e-79  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000317216  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1067  MATE efflux family protein  35.27 
 
 
453 aa  294  2e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000154468  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1309  MATE efflux family protein  34.65 
 
 
538 aa  293  5e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1454  MATE efflux family protein  36.64 
 
 
477 aa  287  2.9999999999999996e-76  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1808  MATE efflux family protein  33.9 
 
 
499 aa  285  1.0000000000000001e-75  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.848054  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1529  MATE efflux family protein  32.6 
 
 
554 aa  280  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.130898  normal  0.344827 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05190  MATE efflux family protein  39.49 
 
 
454 aa  278  2e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.969197  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2492  MATE efflux family protein  32.54 
 
 
485 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.544481  normal  0.228664 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1895  MATE efflux family protein  32.11 
 
 
498 aa  266  4e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2439  MATE efflux family protein  32.34 
 
 
485 aa  265  1e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.739641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1936  MATE efflux family protein  33.86 
 
 
486 aa  264  2e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0485  hypothetical protein  33.11 
 
 
454 aa  263  4e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0273971  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2291  MATE efflux family protein  34.37 
 
 
460 aa  261  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1338  MATE efflux family protein  31.73 
 
 
481 aa  259  7e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0747  MATE efflux family protein  30.96 
 
 
490 aa  258  1e-67  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0707  MATE efflux family protein  30.18 
 
 
518 aa  258  2e-67  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.376903  normal  0.476505 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3677  MATE efflux family protein  32 
 
 
500 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.380257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2458  MATE efflux family protein  33.13 
 
 
500 aa  256  7e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.672094  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2591  MATE efflux family protein  32.52 
 
 
525 aa  253  4.0000000000000004e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.677976  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1461  MATE efflux family protein  32.69 
 
 
500 aa  249  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3337  MATE efflux family protein  34.45 
 
 
470 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0618  MATE efflux family protein  30.56 
 
 
505 aa  228  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.316241  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1925  MATE efflux family protein  31.15 
 
 
455 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.16171  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0906  MATE efflux family protein  27.87 
 
 
448 aa  209  1e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000766798  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1597  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
460 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.36267e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6251  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1579  MATE efflux family protein  29.25 
 
 
445 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2295  MATE efflux family protein  29.26 
 
 
475 aa  189  1e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00026572  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2636  integral membrane protein  30.3 
 
 
478 aa  188  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.117345 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0762  MATE efflux family protein  29.09 
 
 
458 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1160  MATE efflux family protein  30.85 
 
 
486 aa  184  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3120  MATE efflux family protein  26.37 
 
 
461 aa  184  3e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.369114  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2653  MATE efflux family protein  28.12 
 
 
484 aa  183  7e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2508  multi anti extrusion protein MatE  28.83 
 
 
463 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4033  MATE efflux family protein  28.67 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000078929 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1641  MATE efflux family protein  29.29 
 
 
469 aa  178  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.725642  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3948  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
458 aa  178  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3557  putative MATE efflux protein  29.16 
 
 
469 aa  178  2e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.43043  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1621  Na+ driven multidrug efflux pump  29.06 
 
 
469 aa  177  3e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1591  Na+ driven multidrug efflux pump  29.06 
 
 
469 aa  177  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.742873  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1823  putative MATE efflux protein  29.06 
 
 
469 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0931  MATE efflux family protein  27.75 
 
 
448 aa  176  6e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.102954  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1851  MATE efflux family protein  28.98 
 
 
475 aa  176  7e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00783953  normal  0.201536 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1353  MATE efflux family protein  28.6 
 
 
453 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1846  integral membrane protein, putative  29.06 
 
 
469 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.563684  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1899  putative MATE efflux protein  29.06 
 
 
469 aa  176  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00227155  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1787  putative MATE efflux protein  28.83 
 
 
469 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1166  ABC transporter releated protein  25.92 
 
 
463 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.403976 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3173  MATE efflux family protein  29.53 
 
 
448 aa  174  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000170892  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2343  MATE efflux family protein  26.16 
 
 
464 aa  173  5.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000238189  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1071  MATE efflux family protein  27.89 
 
 
475 aa  173  5.999999999999999e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0991  MATE efflux family protein  25.21 
 
 
475 aa  173  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.0000000000156724  normal  0.091152 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1419  MATE efflux family protein  28.25 
 
 
469 aa  172  9e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.703884  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0293  MATE efflux family protein  28.03 
 
 
467 aa  172  1e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3492  integral membrane protein  29 
 
 
485 aa  172  1e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0396785  normal  0.244149 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.44 
 
 
466 aa  170  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2358  MATE efflux family protein  27.94 
 
 
467 aa  170  5e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1133  MATE efflux family protein  32 
 
 
437 aa  169  9e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0545  MATE efflux family protein  26.48 
 
 
470 aa  169  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0014  MATE efflux family protein  27.41 
 
 
453 aa  169  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.0029857  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1053  MATE efflux family protein  27.29 
 
 
462 aa  167  4e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.2115099999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1607  MATE efflux family protein  28.2 
 
 
463 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000142965  unclonable  4.95515e-23 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0997  MATE efflux family protein  31.56 
 
 
437 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.207525  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3059  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
469 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.231532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3296  MATE efflux family protein  28.54 
 
 
469 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.660304  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1058  MATE efflux family protein  27.57 
 
 
453 aa  166  9e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1318  MATE efflux family protein  28.86 
 
 
443 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000101978  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0012  MATE efflux family protein  28.83 
 
 
477 aa  166  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00000348389  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3642  multi anti extrusion protein MatE  26.61 
 
 
496 aa  165  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.104533  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2315  MATE efflux family protein  25.49 
 
 
470 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.1458  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3175  MATE efflux family protein  26.07 
 
 
468 aa  165  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.386097  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0743  MATE efflux family protein  30.36 
 
 
454 aa  162  1e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000193663  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09280  MATE efflux family protein  28.28 
 
 
453 aa  162  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000476954  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1142  MATE efflux family protein  31.58 
 
 
458 aa  161  3e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0111  MATE efflux family protein  27.47 
 
 
464 aa  160  5e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1662  MATE efflux family protein  28.64 
 
 
453 aa  160  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.226136  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0113  MATE efflux family protein  27.08 
 
 
464 aa  160  6e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3962  multi antimicrobial extrusion protein  26.45 
 
 
492 aa  159  8e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.789789  normal  0.0338284 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0591  MATE efflux family protein  28.21 
 
 
438 aa  159  1e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1726  MATE efflux family protein  28.1 
 
 
447 aa  159  1e-37  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3762  MATE efflux family protein  31.03 
 
 
442 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000783437  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1387  MATE efflux family protein  29.33 
 
 
454 aa  158  2e-37  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00032817  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0185  MATE efflux family protein  27.45 
 
 
449 aa  158  2e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2306  MATE efflux family protein  25.5 
 
 
469 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.30452  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2544  MATE efflux family protein  27.39 
 
 
455 aa  157  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0404  MATE efflux family protein  29.07 
 
 
457 aa  157  4e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.294226 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3395  MATE efflux family protein  26.4 
 
 
461 aa  157  5.0000000000000005e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0883  MATE efflux family protein  27.05 
 
 
451 aa  156  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0784  MATE efflux family protein  28.79 
 
 
460 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2859  MATE efflux family protein  27.71 
 
 
455 aa  155  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02151  multi antimicrobial extrusion family protein  28.82 
 
 
503 aa  155  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0877  MATE efflux family protein  28.71 
 
 
447 aa  154  2e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.371074  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1652  MATE efflux family protein  27.21 
 
 
454 aa  154  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000000000778713  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1711  MATE efflux family protein  27.63 
 
 
463 aa  154  4e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0339316  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1274  Na+ driven multidrug efflux protein  27.1 
 
 
456 aa  153  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.605029  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1509  MATE efflux family protein  28.88 
 
 
460 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.712333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>