More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04570 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
335 aa  680  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.74 
 
 
336 aa  323  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  46.87 
 
 
342 aa  281  8e-75  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  44.88 
 
 
337 aa  275  8e-73  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  43.33 
 
 
337 aa  273  3e-72  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  40.66 
 
 
348 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  6.57853e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  43.43 
 
 
330 aa  271  1e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  43.54 
 
 
333 aa  268  1e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  1.8406e-05 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  42.6 
 
 
342 aa  267  2e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  9.20501e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  40.9 
 
 
348 aa  266  3e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0304  degradation activator  41.69 
 
 
332 aa  265  6e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  39.46 
 
 
347 aa  263  3e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  3.50604e-12  unclonable  1.18995e-08 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  44.09 
 
 
332 aa  261  8e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  41.32 
 
 
340 aa  260  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.07 
 
 
339 aa  259  5e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  42.07 
 
 
333 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.07 
 
 
333 aa  259  6e-68  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  40.66 
 
 
332 aa  258  1e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3333  transcriptional regulator, LacI family  42.77 
 
 
329 aa  258  1e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4811  catabolite control protein A  40.66 
 
 
332 aa  258  1e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3973  transcriptional repressor RbsR  38.67 
 
 
338 aa  257  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000131921  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0296  degradation activator  39.46 
 
 
331 aa  257  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4575  catabolite control protein A  40.36 
 
 
332 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  40.96 
 
 
332 aa  256  3e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4929  catabolite control protein A  40.36 
 
 
332 aa  256  3e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2281  transcriptional regulator, LacI family  41.03 
 
 
334 aa  255  6e-67  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  40.36 
 
 
332 aa  255  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  46.15 
 
 
355 aa  255  9e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  40.36 
 
 
332 aa  254  1e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4795  catabolite control protein A  40.06 
 
 
332 aa  254  1e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3342  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  40.06 
 
 
332 aa  254  1e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.52618e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4410  catabolite control protein A  40.06 
 
 
332 aa  254  1e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4427  catabolite control protein A  39.76 
 
 
332 aa  254  2e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0438  alanine racemase  40.84 
 
 
338 aa  254  2e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  8.64233e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4170  transcriptional repressor RbsR  37.98 
 
 
341 aa  252  5e-66  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  1.81496e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  41.52 
 
 
336 aa  252  6e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  38.72 
 
 
331 aa  252  7e-66  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  40.12 
 
 
333 aa  249  3e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.67 
 
 
336 aa  249  3e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.48221e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.3 
 
 
341 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.3 
 
 
341 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  38.3 
 
 
341 aa  249  5e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  38.3 
 
 
341 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.41 
 
 
343 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.41 
 
 
343 aa  249  5e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.3 
 
 
341 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  38.3 
 
 
341 aa  249  5e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  42.04 
 
 
336 aa  249  6e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  39.39 
 
 
335 aa  248  8e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  37.92 
 
 
328 aa  248  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  38.41 
 
 
334 aa  248  9e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  40.72 
 
 
343 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.23 
 
 
330 aa  247  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2457  ribose operon repressor  38.6 
 
 
340 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.683116  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0115  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.58 
 
 
342 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4101  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.58 
 
 
342 aa  247  2e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4310  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.41 
 
 
341 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4426  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.41 
 
 
341 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4340  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.41 
 
 
341 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.302828  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4424  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.41 
 
 
341 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4494  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.41 
 
 
341 aa  246  3e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  41.39 
 
 
332 aa  246  4e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  40 
 
 
343 aa  246  4e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00726  DNA-binding transcriptional regulator CytR  38.79 
 
 
335 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  37.46 
 
 
333 aa  245  6e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  7.82419e-07 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  39.38 
 
 
331 aa  246  6e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  38.74 
 
 
346 aa  245  7e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  38.69 
 
 
346 aa  245  7e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  42.69 
 
 
346 aa  245  7e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3233  alanine racemase  38.6 
 
 
340 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.16314  normal  0.588082 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  40.43 
 
 
343 aa  244  1e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  39.27 
 
 
330 aa  244  1e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.39 
 
 
353 aa  245  1e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4122  transcriptional repressor RbsR  38.6 
 
 
330 aa  244  1e-63  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.305602  normal  0.0911869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5190  transcriptional repressor RbsR  38.6 
 
 
330 aa  244  1e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00327915  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2370  ribose operon repressor  37.88 
 
 
338 aa  244  1e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  38.6 
 
 
330 aa  244  1e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  40 
 
 
343 aa  244  2e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 
343 aa  243  2e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4165  transcriptional repressor RbsR  38.3 
 
 
330 aa  243  2e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0172446  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  40.43 
 
 
343 aa  244  2e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1959  LacI family transcription regulator  38.6 
 
 
340 aa  243  2e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.108871  normal  0.0393336 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 
347 aa  244  2e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 
343 aa  243  2e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 
343 aa  243  2e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  37.65 
 
 
333 aa  244  2e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  40 
 
 
343 aa  244  2e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  40.43 
 
 
343 aa  244  2e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  40.43 
 
 
343 aa  244  2e-63  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4241  transcriptional repressor RbsR  38.6 
 
 
330 aa  243  3e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.327464  hitchhiker  0.00680444 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3489  LacI family transcription regulator  39.21 
 
 
340 aa  243  3e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.253603  normal  0.255541 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  39.7 
 
 
343 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1983  HTH-type transcriptional repressor PurR (purine nucleotide synthesis repressor)  38.67 
 
 
333 aa  243  4e-63  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.991617  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3623  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.88 
 
 
335 aa  243  4e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.487296  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4039  DNA-binding transcriptional regulator CytR  37.27 
 
 
341 aa  243  5e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2154  LacI transcriptional regulator  37.88 
 
 
338 aa  242  6e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0306626  normal  0.912687 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0006  ribose operon repressor  38.44 
 
 
334 aa  241  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.038565  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  37.8 
 
 
334 aa  241  1e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  40.54 
 
 
338 aa  241  1e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03639  DNA-binding transcriptional repressor of ribose metabolism  38.3 
 
 
330 aa  240  2e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00237415  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>