25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04230 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_04230  Cna B domain protein  100 
 
 
609 aa  1184    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  33.15 
 
 
1918 aa  85.9  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1147  hypothetical protein  37.37 
 
 
333 aa  83.2  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0555  carbohydrate-binding CenC domain-containing protein  29.63 
 
 
1426 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0265  hypothetical protein  29.9 
 
 
411 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0104715 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0559  hypothetical protein  24.73 
 
 
697 aa  56.2  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.141285  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2496  copper amine oxidase domain protein  35.56 
 
 
1176 aa  55.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000018364  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1258  Subtilisin-like serine protease  42.47 
 
 
1937 aa  54.3  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.596545  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0068  hypothetical protein  34.07 
 
 
394 aa  52.8  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000118188 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1269  hypothetical protein  37.89 
 
 
1141 aa  52  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0270668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2451  peptidase C1A, papain  33.73 
 
 
1202 aa  52  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.692064  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3292  Cna B domain protein  41.1 
 
 
320 aa  51.2  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4417  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.13 
 
 
2182 aa  50.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1807  hypothetical protein  35.85 
 
 
416 aa  50.1  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3311  PDZ/DHR/GLGF domain protein  34.38 
 
 
742 aa  47.8  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185586  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  33.08 
 
 
747 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0149  S-layer-like domain-containing protein  31.07 
 
 
1113 aa  47.4  0.0009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00285183  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4546  Cna B domain-containing protein  31.47 
 
 
690 aa  45.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0739  Cna B domain-containing protein  33.99 
 
 
536 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000604676  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0552  hypothetical protein  23.71 
 
 
464 aa  45.4  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.092492  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0760  redoxin domain-containing protein  28.57 
 
 
874 aa  45.1  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.64 
 
 
1290 aa  44.7  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0627  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.93 
 
 
1501 aa  44.7  0.005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0005  PEGA domain protein  28.24 
 
 
684 aa  43.9  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0742  hypothetical protein  37.66 
 
 
1711 aa  43.9  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>