43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03990 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_03990  Flavodoxin  100 
 
 
159 aa  321  2e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000376234  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0077  flavodoxin-like protein  38.46 
 
 
160 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1035  protoporphyrinogen oxidase  29.58 
 
 
188 aa  61.2  0.000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.395736  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2492  flavodoxin-like protein  27.27 
 
 
215 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3400  protoporphyrinogen oxidase  29.58 
 
 
173 aa  57.8  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0962  Protoporphyrinogen oxidase  25.29 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0939  protoporphyrinogen oxidase  28.87 
 
 
173 aa  55.1  0.0000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.031625  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4324  protoporphyrinogen oxidase  26.04 
 
 
190 aa  54.3  0.0000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4171  flavodoxin-like protein  24.48 
 
 
216 aa  53.9  0.0000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0973  protoporphyrinogen oxidase  28.87 
 
 
173 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.705197  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001985  protoporphyrinogen IX oxidase oxygen-independent HemG  36.46 
 
 
175 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000384734  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4255  flavodoxin/nitric oxide synthase  28.17 
 
 
197 aa  52.4  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00463  protoporphyrinogen oxidase  27.46 
 
 
175 aa  50.8  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3245  flavodoxin-like protein  31.68 
 
 
176 aa  50.4  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0871  protoporphyrinogen oxidase  23.7 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0562  hypothetical protein  25.78 
 
 
205 aa  48.9  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.916789  normal  0.708771 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0185  hypothetical protein  33.33 
 
 
335 aa  47.4  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.533354  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3743  protoporphyrinogen oxidase  25.35 
 
 
179 aa  47.4  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000514113  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3038  protoporphyrinogen oxidase  26.24 
 
 
173 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1569  protoporphyrinogen oxidase  23.7 
 
 
170 aa  46.6  0.0001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000000838772  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2882  protoporphyrinogen oxidase  31.11 
 
 
178 aa  47  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0999  hypothetical protein  30.07 
 
 
175 aa  46.6  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000710305  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0793  protoporphyrinogen oxidase  31.82 
 
 
173 aa  47  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2554  Flavodoxin-like protein  24.68 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3897  protoporphyrinogen oxidase  31.52 
 
 
179 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0092686  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1284  hypothetical protein  23.33 
 
 
188 aa  45.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.016048  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0530  flavodoxin/nitric oxide synthase  25.61 
 
 
185 aa  45.4  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0610  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  27.16 
 
 
323 aa  45.4  0.0003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.828743  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0906  protoporphyrinogen oxidase  25.53 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3066  protoporphyrinogen oxidase  26.24 
 
 
173 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0377442 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0198  protoporphyrinogen oxidase  23.24 
 
 
173 aa  44.7  0.0005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0589  flavodoxin family protein  32.94 
 
 
166 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3023  flavodoxin  32.14 
 
 
170 aa  44.3  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3790  protoporphyrinogen oxidase  29.55 
 
 
175 aa  43.1  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0678  protoporphyrinogen oxidase  20.27 
 
 
173 aa  43.5  0.001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.103464 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3601  protoporphyrinogen oxidase  26.22 
 
 
174 aa  43.5  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.934061  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0573  protoporphyrinogen oxidase  30.11 
 
 
167 aa  42.7  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00307777 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3336  protoporphyrinogen oxidase  22.92 
 
 
178 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0495  hypothetical protein  31.11 
 
 
193 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2438  Flavodoxin-like protein  34.33 
 
 
174 aa  41.2  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000794828  normal  0.0165675 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4072  protoporphyrinogen oxidase  22.14 
 
 
176 aa  41.2  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0855  hypothetical protein  25.3 
 
 
237 aa  41.2  0.006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.110269  normal  0.850819 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1487  protoporphyrinogen oxidase  22.86 
 
 
175 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.040472  hitchhiker  0.00766519 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>