98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_03470 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  100 
 
 
815 aa  1651    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  32.78 
 
 
718 aa  333  1e-89  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0963  hypothetical protein  30.24 
 
 
515 aa  224  4e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1924  hypothetical protein  32.6 
 
 
616 aa  224  4.9999999999999996e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348588  hitchhiker  0.00176923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0974  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  33.18 
 
 
621 aa  216  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0349  DnaB domain-containing protein helicase domain-containing protein  30.8 
 
 
666 aa  211  4e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.526398  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2984  hypothetical protein  31.64 
 
 
542 aa  193  8e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  38.06 
 
 
867 aa  177  7e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0253  DNA primase domain-containing protein  38.29 
 
 
868 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0886  DNA primase domain-containing protein  38.29 
 
 
868 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0276  DNA primase domain-containing protein  38.29 
 
 
868 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1087  AAA ATPase  43.43 
 
 
590 aa  166  1.0000000000000001e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1287  hypothetical protein  37.6 
 
 
701 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1298  hypothetical protein  35.83 
 
 
732 aa  154  8e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0264  hypothetical protein  39.16 
 
 
880 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.25272  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6272  P4 family phage/plasmid primase  40.25 
 
 
725 aa  144  7e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.613455  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0087  TOPRIM domain-containing protein  29.06 
 
 
782 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.417262  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1493  TOPRIM  35.39 
 
 
437 aa  133  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.268011  normal  0.0585011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1535  hypothetical protein  36.7 
 
 
756 aa  115  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.175883  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0879  hypothetical protein  38.89 
 
 
738 aa  114  8.000000000000001e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0744  hypothetical protein  26.33 
 
 
466 aa  100  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  25.3 
 
 
895 aa  100  1e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  29.63 
 
 
278 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1121  zinc finger, CHC2-family protein  32.68 
 
 
277 aa  94.7  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.196086  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0083  hypothetical protein  23.97 
 
 
502 aa  92.8  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4606  hypothetical protein  25.27 
 
 
465 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0180041 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3404  hypothetical protein  25.98 
 
 
496 aa  92  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0396  hypothetical protein  23.35 
 
 
501 aa  91.3  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.123682  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0923  CP4-57 prophage; hypothetical protein  25 
 
 
470 aa  89.7  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0295436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0989  P4 alpha zinc-binding domain protein  23.47 
 
 
866 aa  87.4  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3411  hypothetical protein  25 
 
 
1776 aa  87  0.000000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1302  hypothetical protein  25.14 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.414207 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0680  hypothetical protein  24.71 
 
 
505 aa  83.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0243  hypothetical protein  22.14 
 
 
509 aa  81.6  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.674727  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2652  hypothetical protein  23.01 
 
 
813 aa  81.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.442336  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1766  hypothetical protein  24 
 
 
488 aa  81.6  0.00000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.862527  normal  0.520782 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1794  hypothetical protein  26.15 
 
 
489 aa  80.5  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.455218 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1050  conserved hypothetical protein  23.66 
 
 
469 aa  79.7  0.0000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0233  hypothetical protein  23.82 
 
 
507 aa  79  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0871  hypothetical protein  21.36 
 
 
458 aa  73.9  0.00000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0242601 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1442  hypothetical protein  24.56 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1624  hypothetical protein  23.62 
 
 
458 aa  69.3  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.897821  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  26.79 
 
 
684 aa  68.2  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3701  P4 family phage/plasmid primase  28.93 
 
 
798 aa  67.8  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1690  hypothetical protein  24.5 
 
 
499 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.406104  normal  0.0155376 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1046  hypothetical protein  38.2 
 
 
147 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.0037959  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0582  regulatory protein RepA, putative  32.89 
 
 
682 aa  63.5  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.401609  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4350  virulence-associated protein E  37.21 
 
 
136 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00174142 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2474  TOPRIM domain protein  30.13 
 
 
834 aa  62.8  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0200102  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2301  hypothetical protein  23.39 
 
 
457 aa  62.4  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0609  regulatory protein RepA, putative  34.13 
 
 
731 aa  61.6  0.00000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010374  M446_7054  hypothetical protein  28.33 
 
 
739 aa  61.2  0.00000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.601581  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1780  hypothetical protein  20.89 
 
 
477 aa  61.2  0.00000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0303159  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0060  hypothetical protein  39.44 
 
 
141 aa  58.9  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2245  hypothetical protein  29.41 
 
 
631 aa  59.3  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.67793  normal  0.307121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1224  ATPase-like protein  29.71 
 
 
719 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0363  virulence-associated protein E  38.1 
 
 
127 aa  58.2  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0639  hypothetical protein  21.93 
 
 
848 aa  57.8  0.0000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0775939 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2504  hypothetical protein  22.35 
 
 
447 aa  57.8  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0875481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5027  hypothetical protein  22.29 
 
 
375 aa  57.8  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0475457  normal  0.219528 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4690  hypothetical protein  22.69 
 
 
534 aa  56.2  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7731  protein of unknown function DUF927  32.4 
 
 
841 aa  56.2  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00297  hypothetical protein  21.85 
 
 
701 aa  54.3  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  34.48 
 
 
309 aa  53.1  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  48.72 
 
 
280 aa  53.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2834  hypothetical protein  22.81 
 
 
520 aa  52.4  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.127283  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  25.34 
 
 
741 aa  52.4  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2070  TOPRIM domain-containing protein  32.1 
 
 
716 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0458393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1359  hypothetical protein  23.25 
 
 
542 aa  52.4  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  25.38 
 
 
696 aa  52.4  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2458  DNA primase  28.22 
 
 
567 aa  51.2  0.00007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00693823  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  50 
 
 
296 aa  51.2  0.00008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1709  zinc finger, CHC2-family protein  30.77 
 
 
350 aa  51.2  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2601  TOPRIM domain-containing protein  31.36 
 
 
712 aa  51.2  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  43.75 
 
 
312 aa  50.4  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3582  hypothetical protein  29.73 
 
 
494 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000410159  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2276  hypothetical protein  22.03 
 
 
521 aa  48.9  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00656399  normal  0.253648 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2546  hypothetical protein  29.94 
 
 
838 aa  48.1  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.990216 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2766  TOPRIM domain-containing protein  31.17 
 
 
720 aa  47.8  0.0008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.172125 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  55 
 
 
293 aa  47  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2058  hypothetical protein  27.21 
 
 
257 aa  47.4  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000253256 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2005  hypothetical protein  34.29 
 
 
100 aa  46.6  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.598822  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0495  DNA primase  28.8 
 
 
599 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000117226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0810  hypothetical protein  35.63 
 
 
930 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  48.72 
 
 
283 aa  46.6  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  33.33 
 
 
759 aa  46.6  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3229  hypothetical protein  37.25 
 
 
759 aa  46.2  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000988084 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1502  DNA primase  30.37 
 
 
583 aa  46.2  0.003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00809258  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2841  TOPRIM domain-containing protein  26.9 
 
 
712 aa  46.2  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.44654 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0839  hypothetical protein  39.6 
 
 
765 aa  45.4  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.469557  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1538  hypothetical protein  32.33 
 
 
272 aa  45.4  0.005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1895  DNA primase  28.57 
 
 
573 aa  44.7  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.158344  normal  0.0137969 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1304  TOPRIM domain-containing protein  33.05 
 
 
712 aa  44.3  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.973795  normal  0.159231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1239  TOPRIM domain-containing protein  33.05 
 
 
712 aa  44.3  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0951779 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1369  DNA primase  29.73 
 
 
572 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0240791  normal  0.628544 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0154  hypothetical protein  25 
 
 
335 aa  44.3  0.01  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00000684092  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02077  hypothetical protein  32.03 
 
 
979 aa  44.3  0.01  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.777801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2053  DNA primase  26.4 
 
 
576 aa  44.3  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.399908  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>