More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_02540 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 
481 aa  934    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0838  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.29 
 
 
432 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  22.57 
 
 
400 aa  108  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  22.97 
 
 
449 aa  102  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.03 
 
 
509 aa  102  2e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00959096  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2858  secretion protein HlyD  24.25 
 
 
517 aa  97.1  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1675  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.71 
 
 
608 aa  96.3  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1398  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.97 
 
 
504 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.463842 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.43 
 
 
388 aa  94  5e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2973  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.64 
 
 
448 aa  94  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0468  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.64 
 
 
445 aa  94  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.16 
 
 
413 aa  93.6  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4850  RND family efflux transporter MFP subunit  31.46 
 
 
385 aa  92  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1469  secretion protein HlyD  24.23 
 
 
421 aa  89.4  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.910926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1203  RND family efflux transporter MFP subunit  22.16 
 
 
621 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0748  putative PAS/PAC sensor protein  26.19 
 
 
607 aa  89  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0919  AcrA/AcrE family efflux protein  23.24 
 
 
377 aa  88.6  2e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  29.51 
 
 
360 aa  87.8  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2316  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.94 
 
 
379 aa  87  6e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.144925 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1340  secretion protein HlyD  25.05 
 
 
424 aa  87  7e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1762  RND family efflux transporter MFP subunit  25.26 
 
 
421 aa  86.7  8e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0464275  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.05 
 
 
416 aa  86.7  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0308  secretion protein HlyD  23.68 
 
 
421 aa  86.7  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.742688 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0198  RND family efflux transporter MFP subunit  23.93 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.72 
 
 
407 aa  86.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.2 
 
 
379 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1204  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.39 
 
 
471 aa  85.5  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0270  putative MacA-like membrane transport protein  23.29 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2322  secretion protein HlyD  24.5 
 
 
399 aa  85.1  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000756014  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4150  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.2 
 
 
397 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00923789  hitchhiker  0.000000297953 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2977  RND family efflux transporter MFP subunit  29.94 
 
 
401 aa  84  0.000000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.540318  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1848  RND family efflux transporter MFP subunit  31.28 
 
 
538 aa  84  0.000000000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.485461  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0753  secretion protein HlyD  28.57 
 
 
370 aa  84  0.000000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1636  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.69 
 
 
383 aa  83.2  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.372421  normal  0.934491 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2072  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.51 
 
 
379 aa  83.2  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3566  efflux transporter, RND family, MFP subunit  32.39 
 
 
671 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.707704  normal  0.0791052 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1759  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.31 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1839  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.37 
 
 
420 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0659  secretion protein HlyD  21.46 
 
 
335 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0195539 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3883  secretion protein HlyD  23.61 
 
 
424 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.135938  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1088  RND family efflux transporter MFP subunit  30.37 
 
 
459 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1715  RND family efflux transporter MFP subunit  29.41 
 
 
456 aa  81.6  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.542005 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1719  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.38 
 
 
517 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0477  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.79 
 
 
435 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  29.37 
 
 
392 aa  81.3  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2818  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.78 
 
 
349 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1440  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.59 
 
 
374 aa  80.5  0.00000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.266014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2557  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.81 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000000027885  normal  0.211023 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0987  secretion protein HlyD  27.71 
 
 
419 aa  80.1  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1040  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.43 
 
 
500 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2825  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.9 
 
 
476 aa  79.3  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.292175  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3556  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.22 
 
 
433 aa  79.7  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0487  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.87 
 
 
360 aa  79.7  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  27.8 
 
 
379 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3170  RND family efflux transporter MFP subunit  28.26 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000721535  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3169  RND family efflux transporter MFP subunit  28.57 
 
 
369 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000222351  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  31.31 
 
 
391 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1815  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.96 
 
 
388 aa  79  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.100454  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0212  secretion protein HlyD family protein  21.9 
 
 
536 aa  78.2  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1256  membrane fusion protein (MFP) family auxiliary transport protein  21.67 
 
 
397 aa  78.2  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1943  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.84 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0558  secretion protein HlyD  28.34 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.177986  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.74 
 
 
409 aa  78.2  0.0000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2095  secretion protein HlyD  26.32 
 
 
354 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.2 
 
 
419 aa  78.2  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  25.13 
 
 
431 aa  78.2  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2179  RND family efflux transporter MFP subunit  31.6 
 
 
361 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000248395  normal  0.140593 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2663  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30 
 
 
352 aa  77.8  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.02 
 
 
414 aa  77.4  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1441  heavy metal resistance protein CzcB  33.33 
 
 
489 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.165558  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3313  RND family efflux transporter MFP subunit  28.45 
 
 
369 aa  77  0.0000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000984298  normal  0.15916 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  20.6 
 
 
377 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1201  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.14 
 
 
369 aa  77  0.0000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000118856  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2610  RND family efflux transporter MFP subunit  23.36 
 
 
493 aa  77  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.787622 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1526  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcB  32.77 
 
 
489 aa  76.6  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  30.05 
 
 
371 aa  77  0.0000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0032  heavy metal resistance protein CzcB  34.07 
 
 
516 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.751867  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2010  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.77 
 
 
412 aa  76.6  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.2279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  26.91 
 
 
371 aa  76.6  0.0000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  30.39 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  30.39 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0044  CzcB family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter membrane fusion protein  28.06 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.597635  hitchhiker  0.00000490268 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0012  heavy metal resistance protein CzcB  33.52 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1902  membrane-fusion protein  27.96 
 
 
419 aa  76.6  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0558652  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1030  heavy metal resistance protein CzcB  33.52 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0701844  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  30.39 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1182  heavy metal resistance protein CzcB  33.52 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.125569  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  30.39 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0400  heavy metal resistance protein CzcB  33.52 
 
 
489 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0829315  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  30.39 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0061  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204779 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  30.39 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1847  putative efflux transporter  22.03 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0058  RND family efflux transporter MFP subunit  28.06 
 
 
416 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.712877  hitchhiker  0.00429069 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  30.39 
 
 
371 aa  76.3  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1497  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.81 
 
 
407 aa  75.9  0.000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.30393  hitchhiker  0.00778895 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0161  RND family efflux transporter MFP subunit  27.43 
 
 
380 aa  76.3  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0635  macrolide-specific efflux protein macA  21.97 
 
 
390 aa  75.5  0.000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0167041  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1374  heavy metal resistance protein CzcB  29.41 
 
 
484 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3650  secretion protein HlyD  28.08 
 
 
397 aa  75.1  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.521212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>