33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01820 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01820  branched-chain amino acid transport  100 
 
 		 100 aa  191  2e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.300489  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0310  branched-chain amino acid transport  47.37 
 
 		 102 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1024  branched-chain amino acid transport  47.37 
 
 		 106 aa  96.3  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0636348  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1604  branched-chain amino acid transport  45.26 
 
 		 102 aa  92  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.461016  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1427  branched-chain amino acid transport  47.67 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0169671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2596  branched-chain amino acid transport  45.45 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1478  branched-chain amino acid transport  37 
 
 		 101 aa  68.6  0.00000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2544  branched-chain amino acid transport  40 
 
 		 101 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000678666  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0662  branched-chain amino acid transport  44.83 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00834286  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0649  branched-chain amino acid transport  44.21 
 
 		 105 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000140027  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0159  hypothetical protein  39.71 
 
 		 107 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.258263  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1469  branched-chain amino acid transport  41.94 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.656646  normal  0.0172198 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0522  branched-chain amino acid transport  31.52 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2173  branched-chain amino acid transport  36.07 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0093  branched-chain amino acid transport  34.07 
 
 		 103 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0195  branched-chain amino acid transport  38.71 
 
 		 106 aa  48.1  0.00004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.392711 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0943  branched-chain amino acid transport  41.05 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000713443  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3054  branched-chain amino acid transport  38.57 
 
 		 108 aa  47.4  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0257  branched-chain amino acid transport  35.48 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.751249  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0008  branched-chain amino acid transport  31.33 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4093  hypothetical protein  32.76 
 
 		 108 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2350  branched-chain amino acid transport  38.46 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2929  branched-chain amino acid transport  41.3 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.814408 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1242  branched chain amino acid ABC transporter  36.59 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2569  branched-chain amino acid transport  33.33 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3354  branched-chain amino acid transport  27.08 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0254593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3534  branched-chain amino acid transport  34.44 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.450335  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0850  hypothetical protein  35.48 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000591245  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0494  hypothetical protein  30.85 
 
 		 107 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.178268  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0512  hypothetical protein  31.4 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700284  normal  0.0494056 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0489  branched-chain amino acid transport  30.51 
 
 		 107 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0581449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0476  branched-chain amino acid transport  30.51 
 
 		 107 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1961  branched-chain amino acid transport  25.71 
 
 		 109 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>