294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01710 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01710  putative DNA helicase  100 
 
 
754 aa  1536    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0955  DNA helicase  49.4 
 
 
655 aa  603  1.0000000000000001e-171  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0940  DNA helicase  47.66 
 
 
650 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.686303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0918  putative DNA helicase  47.36 
 
 
650 aa  538  1e-151  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0901  putative DNA helicase  42.34 
 
 
643 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0828  putative DNA helicase  40.33 
 
 
633 aa  457  1e-127  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1089  putative DNA helicase  40.15 
 
 
633 aa  452  1e-125  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.837557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1828  putative DNA helicase  40 
 
 
633 aa  445  1e-123  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0893  putative DNA helicase  40.52 
 
 
633 aa  439  9.999999999999999e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4216  superfamily I DNA/RNA helicase  36.13 
 
 
619 aa  377  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.120406  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4371  superfamily I DNA and RNA helicase  37.36 
 
 
622 aa  370  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.438014  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4348  superfamily I DNA and RNA helicase  37.36 
 
 
622 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4366  superfamily I DNA/RNA helicase  34.66 
 
 
651 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.158459 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_1178  predicted protein  35.78 
 
 
609 aa  338  9.999999999999999e-92  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1556  DNA helicase  32.37 
 
 
611 aa  301  2e-80  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.274637  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2411  AAA ATPase  31.66 
 
 
635 aa  300  6e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000174617  normal  0.335241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3380  AAA ATPase  31.61 
 
 
632 aa  295  3e-78  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.134452  normal  0.835582 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3080  type III restriction protein res subunit  31.61 
 
 
636 aa  287  5.999999999999999e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3342  DEAD-like helicase  31.7 
 
 
636 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.182611 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41525  predicted protein  38.49 
 
 
466 aa  282  2e-74  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.0000217661  normal  0.0334974 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07652  DNA helicase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G01090)  35.26 
 
 
686 aa  264  4e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI01000  DNA helicase, putative  30.31 
 
 
748 aa  261  2e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.359255  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC02960  ATP dependent helicase, putative  34.04 
 
 
1090 aa  248  2e-64  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.275864  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_61353  predicted protein  30.29 
 
 
716 aa  246  1.9999999999999999e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_443  predicted protein  31.41 
 
 
797 aa  243  1e-62  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00278314 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00646  hypothetical protein similar to possible regulator of nonsense transcripts (Broad)  34.89 
 
 
1077 aa  241  5e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_2292  predicted protein  35.56 
 
 
464 aa  237  7e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL04770  DNA helicase, putative  33.15 
 
 
952 aa  232  2e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42380  predicted protein  37.87 
 
 
479 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_81113  DEAD-box type RNA helicase  31.09 
 
 
1999 aa  194  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01780  hypothetical protein  30.98 
 
 
2245 aa  193  1e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_51262  predicted protein  37.69 
 
 
388 aa  188  4e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.21292  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03653  essential tripartite DNA replication factor with single-stranded DNA-dependent ATPase (Eurofung)  33.33 
 
 
1048 aa  181  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03980  DNA replication helicase dna2, putative  35.98 
 
 
1097 aa  178  4e-43  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.450462  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0455  DNA replication factor Dna2  36.42 
 
 
902 aa  177  6e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2916  DNA replication factor Dna2  36.52 
 
 
902 aa  175  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2111  DNA replication factor Dna2  36.91 
 
 
934 aa  172  3e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1291  AAA ATPase  28.92 
 
 
1099 aa  172  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0205527  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0958  AAA ATPase  30.17 
 
 
629 aa  171  6e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16357  predicted protein  38.11 
 
 
268 aa  170  9e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_29705  predicted protein  31.93 
 
 
553 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0430706  hitchhiker  0.00367175 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27204  predicted protein  31.93 
 
 
553 aa  169  2e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.332143  normal  0.0288393 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1059  helicase  34.35 
 
 
986 aa  167  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3092  putative helicase  32.07 
 
 
941 aa  164  4.0000000000000004e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.209687  normal  0.0418433 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1698  DNA replication factor Dna2  35.36 
 
 
901 aa  160  9e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119646  predicted protein  27.61 
 
 
795 aa  158  3e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.44147  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4394  superfamily I DNA/RNA helicase  27.08 
 
 
585 aa  155  4e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.483682 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43802  predicted protein  36.04 
 
 
1189 aa  154  8e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.327125  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4335  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  37.5 
 
 
752 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29532  predicted protein  39.48 
 
 
237 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0486928  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37931  predicted protein  32.62 
 
 
486 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.310178  normal 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27246  predicted protein  37.26 
 
 
283 aa  142  1.9999999999999998e-32  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.777392  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0056  AAA ATPase  31.38 
 
 
606 aa  140  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.414788  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1489  hypothetical protein  29.28 
 
 
1018 aa  132  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132129  normal  0.443999 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2554  superfamily I DNA/RNA helicase  30.06 
 
 
1653 aa  127  6e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237962  normal 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_44917  predicted protein  31.23 
 
 
315 aa  127  9e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.394616  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_49458  predicted protein  26.55 
 
 
715 aa  121  3.9999999999999996e-26  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2126  ATPase  31.96 
 
 
1585 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.561278  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2278  NERD domain protein  31.96 
 
 
1585 aa  118  5e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.468792  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1883  AAA ATPase  28.68 
 
 
1284 aa  117  1.0000000000000001e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3926  superfamily I DNA/RNA helicase  26.53 
 
 
1190 aa  114  9e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_4992  predicted protein  32.25 
 
 
297 aa  112  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.687838  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5029  superfamily I DNA/RNA helicase  24.96 
 
 
1620 aa  112  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3588  DNA helicase  24.14 
 
 
1002 aa  111  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.430381  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2266  superfamily I DNA/RNA helicase  24.91 
 
 
1175 aa  110  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293154  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43905  predicted protein  28.92 
 
 
1038 aa  104  6e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.352902  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_37994  predicted protein  30 
 
 
521 aa  103  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.273766 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07246  conserved hypothetical protein  28.07 
 
 
2310 aa  101  6e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2909  DNA helicase  24.6 
 
 
759 aa  99  3e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2039  hypothetical protein  24.2 
 
 
759 aa  99  3e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3243  hypothetical protein  24.8 
 
 
759 aa  99  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.553329  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_259  predicted protein  24.25 
 
 
944 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.573781  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2072  DNA helicase  24.46 
 
 
769 aa  99  3e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2930  putative DNA helicase  24.57 
 
 
769 aa  98.6  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2982  hypothetical protein  24.4 
 
 
759 aa  97.8  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.207639  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3207  hypothetical protein  24.4 
 
 
759 aa  97.8  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3216  hypothetical protein  24.4 
 
 
759 aa  97.8  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2975  DNA helicase  24.6 
 
 
759 aa  97.4  8e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3199  hypothetical protein  24.6 
 
 
759 aa  94.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.699759  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3231  hypothetical protein  24.7 
 
 
759 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0885139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0675  DNA topoisomerase I  27.81 
 
 
1041 aa  90.1  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.135571  hitchhiker  0.00000063053 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_38450  predicted protein  26.09 
 
 
1427 aa  89.7  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.196712  normal  0.466679 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2717  hypothetical protein  27.22 
 
 
1126 aa  89.7  2e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375535 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4258  superfamily I DNA/RNA helicase  28.18 
 
 
1108 aa  89.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4606  superfamily I DNA/RNA helicase  27.14 
 
 
1284 aa  89.7  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_14090  predicted protein  36.77 
 
 
219 aa  89  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0238  DNA helicase  24.14 
 
 
922 aa  88.2  5e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3938  superfamily I DNA/RNA helicase  29.39 
 
 
1651 aa  84.3  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.98348 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0299  DNA helicase  27.03 
 
 
916 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.053033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2940  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.68 
 
 
1196 aa  83.2  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408455  hitchhiker  0.000165978 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00610  predicted nuclease (RecB family)  30.68 
 
 
1270 aa  82.4  0.00000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1790  superfamily I DNA/RNA helicase  26.67 
 
 
1427 aa  81.6  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.824667  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2408  Superfamily I DNA and RNA helicase and helicase subunits-like protein  23.55 
 
 
1428 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0570  superfamily I DNA/RNA helicase  24.58 
 
 
1457 aa  79.7  0.0000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.010636 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4194  AAA ATPase  25.21 
 
 
1126 aa  79.3  0.0000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0708139 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6959  DNA helicase related protein  25.15 
 
 
1157 aa  77  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181684  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0744  conserved hypothetical protein, putative DNA helicase  22.51 
 
 
932 aa  75.9  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0965735 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9531  helicase ATP-binding protein  25.56 
 
 
1137 aa  75.5  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1283  hypothetical protein  28.57 
 
 
1116 aa  75.1  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.112248 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1511  hypothetical protein  26.64 
 
 
1275 aa  74.3  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>