More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01680 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01680  alanine racemase  100 
 
 
379 aa  771    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0964  alanine racemase  51.49 
 
 
388 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2926  alanine racemase  48.4 
 
 
389 aa  367  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.839244  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0758  alanine racemase  49.73 
 
 
373 aa  363  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1160  alanine racemase  48.66 
 
 
373 aa  358  6e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0171  alanine racemase  46.05 
 
 
371 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0307  alanine racemase  46.87 
 
 
390 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0063  alanine racemase  48.12 
 
 
373 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.131019  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2697  alanine racemase  47.34 
 
 
391 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2167  alanine racemase  49.19 
 
 
373 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000196511  decreased coverage  0.0000176162 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0861  alanine racemase  49.19 
 
 
386 aa  348  9e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0852  alanine racemase  48.65 
 
 
386 aa  347  1e-94  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0824  alanine racemase  46.84 
 
 
380 aa  347  2e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.664033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2170  alanine racemase  47.21 
 
 
398 aa  346  4e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.598884  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1484  alanine racemase  46.09 
 
 
390 aa  343  2e-93  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.770988  hitchhiker  0.000000845672 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3770  alanine racemase  47.7 
 
 
373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1563  alanine racemase  44.15 
 
 
392 aa  341  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.985538  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2865  alanine racemase  47.01 
 
 
370 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000333192  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0472  alanine racemase  48.77 
 
 
380 aa  333  3e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1758  alanine racemase  46.32 
 
 
369 aa  333  3e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0562  alanine racemase  44.59 
 
 
375 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.629716  normal  0.711821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2234  alanine racemase  45.68 
 
 
378 aa  329  6e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1342  alanine racemase  45.95 
 
 
370 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0650824  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1882  alanine racemase  44.24 
 
 
377 aa  327  2.0000000000000001e-88  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1903  alanine racemase  47.07 
 
 
390 aa  325  6e-88  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0696204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3236  alanine racemase  42.29 
 
 
391 aa  320  3e-86  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.560123  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1894  alanine racemase  41.49 
 
 
391 aa  319  3.9999999999999996e-86  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.695419  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0905  alanine racemase  44.12 
 
 
389 aa  319  3.9999999999999996e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00165979  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2178  alanine racemase  41.22 
 
 
391 aa  319  5e-86  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2163  alanine racemase  41.22 
 
 
391 aa  318  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1884  alanine racemase  41.22 
 
 
391 aa  318  1e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2070  alanine racemase  41.76 
 
 
391 aa  318  1e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.773595  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1932  alanine racemase  40.96 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2079  alanine racemase  40.96 
 
 
391 aa  316  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2110  alanine racemase  40.96 
 
 
391 aa  316  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3850  alanine racemase  44.5 
 
 
384 aa  311  1e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2908  alanine racemase  43.05 
 
 
379 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.184968  normal  0.271691 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0390  alanine racemase  42.08 
 
 
395 aa  309  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.185126  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0412  alanine racemase  42.97 
 
 
395 aa  309  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.650932  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1132  alanine racemase  42.78 
 
 
380 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2594  alanine racemase  44.35 
 
 
433 aa  306  3e-82  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.127753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1931  alanine racemase  40.96 
 
 
408 aa  303  3.0000000000000004e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0176201  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0923  alanine racemase  41.4 
 
 
403 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0365906  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4765  alanine racemase  42.9 
 
 
851 aa  298  9e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0897  alanine racemase  41.4 
 
 
403 aa  298  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2762  alanine racemase  43.43 
 
 
380 aa  297  2e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00587004  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1547  alanine racemase  44.53 
 
 
388 aa  296  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0014745  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0057  alanine racemase  41.38 
 
 
390 aa  296  4e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0862  alanine racemase  39.78 
 
 
403 aa  295  8e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0606  alanine racemase  41.71 
 
 
382 aa  291  9e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2201  alanine racemase  38.74 
 
 
406 aa  290  4e-77  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.419731 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4221  alanine racemase  41.11 
 
 
411 aa  288  1e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.53018  normal  0.063385 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1583  alanine racemase  40.32 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.545163 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0267  alanine racemase  44.05 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.386935  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5058  alanine racemase  43.78 
 
 
389 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0230  alanine racemase  43.78 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0224  alanine racemase  43.78 
 
 
389 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0264  alanine racemase  43.78 
 
 
389 aa  282  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0210  alanine racemase  41.88 
 
 
387 aa  281  9e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.584138  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0272  alanine racemase  43.78 
 
 
389 aa  281  1e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1025  alanine racemase  44.77 
 
 
364 aa  281  1e-74  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0226  alanine racemase  43.51 
 
 
389 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0286  alanine racemase  43.51 
 
 
389 aa  280  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0238  alanine racemase  42.47 
 
 
389 aa  280  4e-74  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0238  alanine racemase  43.51 
 
 
389 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0252  alanine racemase  43.51 
 
 
389 aa  280  4e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3427  alanine racemase  38.69 
 
 
395 aa  277  2e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.764084  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1337  alanine racemase  38.77 
 
 
369 aa  276  6e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000100581  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3508  alanine racemase  37.87 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3527  alanine racemase  41.6 
 
 
379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2520  alanine racemase  43.17 
 
 
811 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3576  alanine racemase  38.15 
 
 
395 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1095  alanine racemase  41.82 
 
 
379 aa  272  6e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.885061  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3461  alanine racemase  41.33 
 
 
379 aa  271  1e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3487  alanine racemase  39.24 
 
 
393 aa  269  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0326  alanine racemase  39.95 
 
 
369 aa  267  2.9999999999999995e-70  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.442092  normal  0.535526 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1091  alanine racemase  41.69 
 
 
384 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1646  alanine racemase  41.89 
 
 
374 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2785  alanine racemase  39.42 
 
 
441 aa  264  2e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0448051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07700  alanine racemase  38.24 
 
 
434 aa  263  4e-69  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.282075 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01510  alanine racemase  36.68 
 
 
421 aa  263  4e-69  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0441968 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2084  alanine racemase  39.84 
 
 
375 aa  262  8e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.261095 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1026  alanine racemase  42.59 
 
 
364 aa  261  2e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.43119  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1898  alanine racemase  43.6 
 
 
849 aa  260  3e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0368912 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17091  alanine racemase  36.68 
 
 
399 aa  256  4e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0681  alanine racemase  37.04 
 
 
387 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00412928  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17191  alanine racemase  36.31 
 
 
399 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17351  alanine racemase  36.59 
 
 
399 aa  255  9e-67  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0994  alanine racemase  38.52 
 
 
382 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2737  alanine racemase  37.7 
 
 
382 aa  254  2.0000000000000002e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.115785  hitchhiker  0.00850953 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1098  alanine racemase  36.49 
 
 
402 aa  252  1e-65  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0934  alanine racemase  38.5 
 
 
376 aa  251  1e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2180  alanine racemase  37.94 
 
 
371 aa  251  1e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2981  alanine racemase  42.08 
 
 
844 aa  249  6e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1245  alanine racemase  37.77 
 
 
384 aa  247  2e-64  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19731  alanine racemase  37.03 
 
 
402 aa  247  2e-64  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2554  alanine racemase  37.23 
 
 
365 aa  247  3e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2128  alanine racemase  37.98 
 
 
374 aa  246  4e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0255  alanine racemase  40.31 
 
 
375 aa  246  4e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000231066  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1620  alanine racemase  35.05 
 
 
399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>