More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01510 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
142 aa  289  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.18525e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
142 aa  289  7e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  77.14 
 
 
143 aa  223  7e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  3.56517e-13  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  72.54 
 
 
142 aa  222  1e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  1.31451e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  70.42 
 
 
144 aa  217  3e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  1.60952e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2425  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
144 aa  211  2e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.19018e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4284  ribosomal protein L13  66.2 
 
 
147 aa  208  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
147 aa  208  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  66.2 
 
 
149 aa  207  3e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
147 aa  206  9e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
147 aa  206  9e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0901  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
143 aa  206  9e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  1.18039e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0599  50S ribosomal protein L13  67.88 
 
 
147 aa  206  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.447745 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  67.61 
 
 
147 aa  205  1e-52  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 
147 aa  205  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  71.32 
 
 
148 aa  204  3e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  65.49 
 
 
147 aa  204  3e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0320  ribosomal protein L13  67.39 
 
 
148 aa  204  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.40761e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  67.88 
 
 
143 aa  203  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  7.58972e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 
149 aa  203  6e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2207  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 
142 aa  202  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.146726  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 
142 aa  201  3e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  3.33795e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1346  50S ribosomal protein L13  70 
 
 
149 aa  201  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000278561  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1340  50S ribosomal protein L13  70 
 
 
149 aa  201  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.00491e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6018  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
147 aa  201  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205125  normal  0.0856034 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  66.2 
 
 
150 aa  201  4e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  64.08 
 
 
145 aa  200  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  2.37961e-05  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  67.86 
 
 
145 aa  200  6e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  1.19852e-10  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  67.14 
 
 
145 aa  200  6e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  3.50375e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0726  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
144 aa  199  1e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.618323  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0614  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
147 aa  199  1e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.622758  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  198  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  2.71958e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1747  50S ribosomal protein L13  64.79 
 
 
142 aa  197  4e-50  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  6.79553e-07  normal  0.257999 
 
 
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  197  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2994  50S ribosomal protein L13  65.22 
 
 
143 aa  196  7e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.348957  hitchhiker  0.00829551 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2015  50S ribosomal protein L13  65.71 
 
 
150 aa  196  9e-50  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624053  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  66.67 
 
 
145 aa  195  1e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1232  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  195  1e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  2.29053e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01710  LSU ribosomal protein L13P  61.27 
 
 
148 aa  195  2e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  9.65518e-09  hitchhiker  9.92925e-11 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
147 aa  194  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  60.56 
 
 
147 aa  194  4e-49  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1881  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
144 aa  193  5e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.366723  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1155  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 
146 aa  194  5e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.291819  normal  0.013183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0969  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
144 aa  194  5e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.476944 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2607  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
144 aa  193  7e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0161967  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3996  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 
146 aa  193  8e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000540909 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  192  9e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  1.52627e-09  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0366  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  193  9e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  1.57584e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  67.86 
 
 
145 aa  192  9e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.18025e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0381  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  193  9e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00368247  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0726  50S ribosomal protein L13  65.94 
 
 
143 aa  192  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  5.78919e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  63.83 
 
 
145 aa  192  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.14694e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  64.79 
 
 
147 aa  192  1e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  59.86 
 
 
142 aa  192  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  59.15 
 
 
144 aa  192  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.57006e-06  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  61.27 
 
 
147 aa  192  1e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  2.05135e-07  hitchhiker  3.559e-05 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0798  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  191  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.05698e-09  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0490  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  191  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000324279  normal  0.194151 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  61.97 
 
 
149 aa  192  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0901  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
142 aa  192  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  5.5141e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0468  50S ribosomal protein L13  64.08 
 
 
142 aa  191  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  1.30449e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  64.54 
 
 
147 aa  191  2e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.58182e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  6.80495e-06  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2012  50S ribosomal protein L13  62.14 
 
 
149 aa  192  2e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00853801  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1565  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  191  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  2.67326e-11  normal  0.325038 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  61.27 
 
 
147 aa  191  3e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  62.77 
 
 
147 aa  191  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0606  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 
143 aa  191  3e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.43755e-16  hitchhiker  0.00414003 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0429  ribosomal protein L13  61.97 
 
 
154 aa  191  3e-48  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.669525  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0649  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  191  4e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.71181e-17  normal  0.0947726 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  191  4e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  62.41 
 
 
143 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  1.77368e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  191  4e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  1.11952e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  191  4e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  4.82809e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  5e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  5.18641e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  190  6e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  6e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  4.45483e-07  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1650  50S ribosomal protein L13  60.71 
 
 
151 aa  190  6e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  5.56575e-09  decreased coverage  1.94665e-06 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0453  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
148 aa  190  6e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0286772  normal  0.569665 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2762  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
144 aa  190  6e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  6e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.28707e-09  hitchhiker  9.18521e-06 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  190  6e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2564  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
161 aa  190  7e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  7.734e-10  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2635  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
144 aa  190  7e-48  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2355  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
149 aa  190  7e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.310176  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2070  50S ribosomal protein L13  65.49 
 
 
142 aa  190  7e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.21803e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0005  ribosomal protein L13  64.29 
 
 
147 aa  189  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.903919  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  63.38 
 
 
142 aa  189  9e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2681  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  189  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4694  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
142 aa  189  9e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00889549  normal  0.0218905 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3075  50S ribosomal protein L13  61.97 
 
 
142 aa  189  9e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3421  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  3.78048e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3378  50S ribosomal protein L13  62.68 
 
 
142 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.57129e-08  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>