More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01500 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_02450  pseudouridylate synthase I  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000086341  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01500  pseudouridylate synthase I  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  8.6087e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2939  tRNA pseudouridine synthase A  52.05 
 
 
244 aa  266  2.9999999999999995e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0900  tRNA pseudouridine synthase A  53.28 
 
 
244 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106944  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2680  tRNA pseudouridine synthase A  48.36 
 
 
244 aa  238  8e-62  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000443367  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2365  tRNA pseudouridine synthase A  48.36 
 
 
244 aa  237  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000187105  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0793  tRNA pseudouridine synthase A  48.57 
 
 
245 aa  236  2e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000229391  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0255  tRNA pseudouridine synthase A  51.22 
 
 
247 aa  235  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000000251416  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3634  tRNA pseudouridine synthase A  49.18 
 
 
245 aa  232  5e-60  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.13903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0255  tRNA pseudouridine synthase A  47.76 
 
 
250 aa  225  5.0000000000000005e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00104612  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5141  tRNA pseudouridine synthase A  46.34 
 
 
264 aa  223  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.11531  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1685  tRNA pseudouridine synthase A  46.72 
 
 
244 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3350  tRNA pseudouridine synthase A  46.12 
 
 
247 aa  218  6e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0985621 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0911  tRNA pseudouridine synthase A  46.53 
 
 
250 aa  217  1e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000123783  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1248  tRNA pseudouridine synthase A  42.91 
 
 
248 aa  215  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1060  tRNA pseudouridine synthase A  42.91 
 
 
248 aa  215  4e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1048  tRNA pseudouridine synthase A  47.13 
 
 
244 aa  215  5e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000774285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0605  tRNA pseudouridine synthase A  45.27 
 
 
256 aa  215  5e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709788  hitchhiker  0.00819756 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0421  tRNA pseudouridine synthase A  41.91 
 
 
260 aa  211  9e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000417493  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0228  tRNA pseudouridine synthase A  43.2 
 
 
255 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0319  tRNA pseudouridine synthase A  48.37 
 
 
250 aa  209  3e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000352927  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0626  tRNA pseudouridine synthase A  45.34 
 
 
252 aa  209  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.133889  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1452  tRNA pseudouridine synthase A  46.75 
 
 
256 aa  209  4e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000896278  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0143  tRNA pseudouridine synthase A  44.13 
 
 
248 aa  207  1e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000160558  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2877  tRNA pseudouridine synthase A  45.08 
 
 
244 aa  205  5e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00616108  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2726  tRNA pseudouridine synthase A  44.09 
 
 
259 aa  205  6e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0473  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 
245 aa  205  7e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0543  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 
245 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000330857  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0462  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 
245 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0401  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 
245 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0487  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 
245 aa  204  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0543  tRNA pseudouridine synthase A  40.08 
 
 
245 aa  203  2e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.432297  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0126  tRNA pseudouridine synthase A  45.85 
 
 
264 aa  203  2e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000150331  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0466  tRNA pseudouridine synthase A  42.74 
 
 
252 aa  202  4e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000184743  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0407  tRNA pseudouridine synthase A  40.66 
 
 
245 aa  202  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0405  tRNA pseudouridine synthase A  40.25 
 
 
245 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00300726  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0468  tRNA pseudouridine synthase A  45.78 
 
 
271 aa  201  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000442967  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2426  tRNA pseudouridine synthase A  42.8 
 
 
246 aa  201  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000220887  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0492  tRNA pseudouridine synthase A  39.67 
 
 
245 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.138657  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4830  tRNA pseudouridine synthase A  39.83 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0152439  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1901  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 
252 aa  198  5e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.48254e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1666  tRNA pseudouridine synthase A  45.31 
 
 
261 aa  198  6e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0056205  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0381  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 
264 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1494  tRNA pseudouridine synthase A  42.62 
 
 
259 aa  196  2.0000000000000003e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.643957  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0410  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 
245 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0409  tRNA pseudouridine synthase A  43.21 
 
 
245 aa  195  5.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.816199  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0228  tRNA pseudouridine synthase A  44.84 
 
 
253 aa  195  7e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000401865  normal  0.634585 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0879  tRNA pseudouridine synthase A  44.72 
 
 
248 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0139  tRNA pseudouridine synthase A  41.7 
 
 
258 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3382  tRNA pseudouridine synthase A  43.03 
 
 
244 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000753277  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2040  tRNA pseudouridine synthase A  39.02 
 
 
274 aa  188  5.999999999999999e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.545725  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0321  tRNA pseudouridine synthase A  44.8 
 
 
264 aa  187  1e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000566898  hitchhiker  1.98611e-17 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2299  pseudouridylate synthase  41.74 
 
 
249 aa  186  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000390138  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0346  tRNA pseudouridine synthase A  41.8 
 
 
262 aa  185  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000224311  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1604  tRNA pseudouridine synthase A  42.15 
 
 
263 aa  185  7e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4191  tRNA pseudouridine synthase A  40.33 
 
 
245 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1055  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 
261 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.859222  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2441  tRNA pseudouridine synthase A  38.84 
 
 
261 aa  182  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.238005  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0956  tRNA pseudouridine synthase A  41.74 
 
 
261 aa  182  3e-45  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0850507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0163  tRNA pseudouridine synthase A  42.91 
 
 
252 aa  181  1e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000189836  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1465  tRNA pseudouridine synthase A  39.51 
 
 
283 aa  181  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1806  tRNA pseudouridine synthase A  37.96 
 
 
266 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1426  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
261 aa  180  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0400831  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1161  tRNA pseudouridine synthase A  40.91 
 
 
271 aa  180  2e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0226119  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1491  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.125203  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2681  tRNA pseudouridine synthase A  40.16 
 
 
262 aa  179  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0556679  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2098  tRNA pseudouridine synthase A  37.7 
 
 
270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.831526 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1479  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
261 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0778674  normal  0.668888 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0137  tRNA pseudouridine synthase A  42.11 
 
 
252 aa  179  4e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000239358  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2273  tRNA pseudouridine synthase A  40.73 
 
 
263 aa  178  5.999999999999999e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000217948 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2306  tRNA pseudouridine synthase A  38.02 
 
 
261 aa  178  7e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0438465  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2759  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 
261 aa  177  9e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00729091  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1251  tRNA pseudouridine synthase A  41.56 
 
 
259 aa  177  1e-43  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.124214  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1617  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
261 aa  176  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0232986  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2742  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 
261 aa  176  2e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0368715  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0136  tRNA pseudouridine synthase A  42.51 
 
 
247 aa  177  2e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000296429  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1652  tRNA pseudouridine synthase A  37.6 
 
 
261 aa  177  2e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0120499  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2150  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
261 aa  177  2e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00702762  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1617  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 
261 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00313277  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5163  tRNA pseudouridine synthase A  41.7 
 
 
252 aa  176  3e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176686  hitchhiker  0.0000000000431811 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1321  tRNA pseudouridine synthase A  36.73 
 
 
247 aa  176  3e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2836  tRNA pseudouridine synthase A  37.19 
 
 
261 aa  176  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0418534  hitchhiker  0.00932261 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.3 
 
 
247 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000419417  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0137  tRNA pseudouridine synthase A  41.3 
 
 
247 aa  175  5e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000139661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0135  tRNA pseudouridine synthase A  41.3 
 
 
247 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000154872  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.3 
 
 
247 aa  175  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000771013  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2984  tRNA pseudouridine synthase A  38.02 
 
 
261 aa  175  5e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000426991  normal  0.427567 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0622  tRNA pseudouridine synthase A  38.02 
 
 
245 aa  175  5e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.939748  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1075  tRNA pseudouridine synthase A  41.06 
 
 
262 aa  175  5e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0173  tRNA pseudouridine synthase A  41.7 
 
 
252 aa  175  5e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000175513  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0155  tRNA pseudouridine synthase A  41.3 
 
 
252 aa  175  6e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.18067e-36 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0142  tRNA pseudouridine synthase A  41.7 
 
 
247 aa  175  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000629315  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2287  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 
267 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0252642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1444  tRNA pseudouridine synthase A  41.76 
 
 
257 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2246  tRNA pseudouridine synthase A  38.17 
 
 
267 aa  175  7e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000374145  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1486  tRNA pseudouridine synthase A  36.78 
 
 
261 aa  175  8e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0039876  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01204  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
264 aa  175  8e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0746  tRNA pseudouridine synthase A  40.41 
 
 
247 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.57289e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2497  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
271 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0419  tRNA pseudouridine synthase A  38.43 
 
 
245 aa  172  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.293905  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>