More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01460 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01460  ribosomal protein L17  100 
 
 		 114 aa  231  3e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000310561  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1495  ribosomal protein L17  59.63 
 
 		 113 aa  144  4.0000000000000006e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.882002  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2684  50S ribosomal protein L17  63.3 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2369  50S ribosomal protein L17  63.3 
 
 		 113 aa  141  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0521735  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0896  50S ribosomal protein L17  60.71 
 
 		 112 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000178462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0244  50S ribosomal protein L17  58.04 
 
 		 112 aa  139  9e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4285  50S ribosomal protein L17  60.91 
 
 		 190 aa  138  3e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.106968  hitchhiker  0.00521298 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3300  ribosomal protein L17  60.91 
 
 		 168 aa  138  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0299881 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0654  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 178 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.686686  hitchhiker  0.0000313712 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2830  50S ribosomal protein L17  61.26 
 
 		 175 aa  135  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215711  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1374  50S ribosomal protein L17  58.56 
 
 		 124 aa  134  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00863011  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0484  50S ribosomal protein L17P  59.09 
 
 		 137 aa  133  7.000000000000001e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3894  50S ribosomal protein L17  59.09 
 
 		 190 aa  133  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1093  50S ribosomal protein L17  59.46 
 
 		 184 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0451  50S ribosomal protein L17  54.46 
 
 		 112 aa  132  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000198381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0707  50S ribosomal protein L17  59.46 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000000951753  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0315  ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 112 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.123635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2430  50S ribosomal protein L17  57.14 
 
 		 112 aa  130  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3668  ribosomal protein L17  56.36 
 
 		 203 aa  130  6.999999999999999e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1583  ribosomal protein L17  55.86 
 
 		 151 aa  129  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.296544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1119  50S ribosomal protein L17  55.08 
 
 		 176 aa  128  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.809899 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4478  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 229 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0807204  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0729  50S ribosomal protein L17  54.05 
 
 		 155 aa  128  3e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0278  ribosomal protein L17  56.36 
 
 		 144 aa  128  3e-29  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0594  50S ribosomal protein L17  57.27 
 
 		 190 aa  127  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.30992 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1546  ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 113 aa  127  6e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1154  ribosomal protein L17  53.98 
 
 		 117 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000378331  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0335  50S ribosomal protein L17P  55.96 
 
 		 222 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194907  decreased coverage  0.000408041 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1143  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 195 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.25464 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23520  LSU ribosomal protein L17P  55.45 
 
 		 164 aa  124  3e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1131  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 195 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1114  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 195 aa  124  3e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3874  50S ribosomal protein L17P  54.55 
 
 		 202 aa  124  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1921  50S ribosomal protein L17  54.87 
 
 		 146 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.195833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0254  ribosomal protein L17  55.36 
 
 		 112 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000174355  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4289  ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0961  ribosomal protein L17  61.22 
 
 		 144 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463077  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0224  LSU ribosomal protein L17P  54.87 
 
 		 113 aa  124  6e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.65294 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2682  ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 121 aa  123  8.000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0293066  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5153  ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 179 aa  123  8.000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.186095 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1009  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 116 aa  122  1e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000240801  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1734  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3112  50S ribosomal protein L17  59.09 
 
 		 197 aa  123  1e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.785173  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1804  50S ribosomal protein L17  53.28 
 
 		 122 aa  122  2e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0138  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000943635  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2878  ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 118 aa  121  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0151  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34385e-50 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0138  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0133  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000322802  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0131  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.124408  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1828  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.872331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0133  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000340653  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0138  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000121438  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5167  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000165629  hitchhiker  3.84135e-19 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0363  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 126 aa  122  2e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0159  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000799248  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0132  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000831433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0169  50S ribosomal protein L17  51.67 
 
 		 120 aa  122  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000157984  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0745  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 132 aa  121  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2992  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 132 aa  120  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2299  ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 126 aa  121  4e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.244707  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0451  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 119 aa  120  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.701542  normal  0.045023 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0139  50S ribosomal protein L17  50.83 
 
 		 120 aa  120  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000316871  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2991  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 141 aa  120  6e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0631685  normal  0.808566 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0716  50S ribosomal protein L17  53.21 
 
 		 116 aa  120  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000127542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1639  50S ribosomal protein L17  54.95 
 
 		 137 aa  120  6e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0620252  normal  0.0662611 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04495  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 127 aa  120  6e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3974  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108015  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4293  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 132 aa  120  6e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.285077  hitchhiker  0.0000000104065 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3796  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 130 aa  120  6e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.571329  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0346  50S ribosomal protein L17  54.55 
 
 		 133 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239558  hitchhiker  0.000393302 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0734  50S ribosomal protein L17  55.56 
 
 		 208 aa  120  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0607  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000739913  normal  0.71973 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0309  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.27148  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3889  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 129 aa  120  8e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000172073  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1716  50S ribosomal protein L17  55.05 
 
 		 113 aa  120  9e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574886  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2250  50S ribosomal protein L17  52.46 
 
 		 122 aa  119  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0379029  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2291  50S ribosomal protein L17  52.46 
 
 		 122 aa  119  9e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2617  50S ribosomal protein L17  55.96 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1437  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 202 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.831815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3153  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13493  50S ribosomal protein L17  53.64 
 
 		 180 aa  119  9.999999999999999e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00579097  normal  0.26683 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0184  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 130 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000125039  hitchhiker  0.00140604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4664  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 132 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0078942  unclonable  0.00000000898737 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3290  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 131 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20580  LSU ribosomal protein L17P  54.55 
 
 		 268 aa  119  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.69658 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0419  ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.341295  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3725  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 128 aa  119  1.9999999999999998e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.370234  hitchhiker  0.00549113 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0257  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3717  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.321728 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3733  50S ribosomal protein L17  54.13 
 
 		 131 aa  118  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00317992  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3609  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0774126  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0419  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.193866  hitchhiker  0.000000268324 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2663  50S ribosomal protein L17  53.1 
 
 		 140 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0402474  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0096  50S ribosomal protein L17  52.29 
 
 		 117 aa  118  1.9999999999999998e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000142816  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3682  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 127 aa  118  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3680  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.991397  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3488  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00929769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3589  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 127 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.181819  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0349  50S ribosomal protein L17  52.73 
 
 		 130 aa  119  1.9999999999999998e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.206274  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>