More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01440 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  428  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  63.94 
 
 		 208 aa  292  3e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  66.35 
 
 		 208 aa  291  5e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1718  ribosomal protein S4  66.35 
 
 		 208 aa  288  5.0000000000000004e-77  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000245759  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  63.46 
 
 		 208 aa  278  3e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0786  ribosomal protein S4  62.02 
 
 		 208 aa  276  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0220407  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  62.02 
 
 		 208 aa  275  4e-73  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  62.98 
 
 		 208 aa  274  6e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  62.5 
 
 		 208 aa  273  1.0000000000000001e-72  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2305  ribosomal protein S4  62.68 
 
 		 209 aa  273  1.0000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00950883  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0449  30S ribosomal protein S4  64.11 
 
 		 208 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0010581  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1497  ribosomal protein S4  66.35 
 
 		 208 aa  271  5.000000000000001e-72  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0242  30S ribosomal protein S4  64.9 
 
 		 208 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  61.06 
 
 		 206 aa  269  2e-71  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2686  30S ribosomal protein S4  63.46 
 
 		 206 aa  265  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2371  30S ribosomal protein S4  62.98 
 
 		 206 aa  265  5e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.210121  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2040  ribosomal protein S4  60.1 
 
 		 208 aa  263  2e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00652573  hitchhiker  0.00144976 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1156  ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  262  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000923588  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  62.2 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2805  ribosomal protein S4  60.1 
 
 		 208 aa  259  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000815748  decreased coverage  0.00000000563481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1091  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  259  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.510995  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0652  30S ribosomal protein S4  59.62 
 
 		 208 aa  259  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000063481 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  257  1e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0252  RNA-binding S4 domain-containing protein  61.54 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000365501  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1581  ribosomal protein S4  56.73 
 
 		 208 aa  256  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.075327  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  254  5e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2750  ribosomal protein S4  55.29 
 
 		 208 aa  254  9e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.462639  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  57.89 
 
 		 209 aa  253  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0104  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  249  2e-65  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166577 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0727  30S ribosomal protein S4  56.46 
 
 		 209 aa  248  5e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  247  8e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1007  ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 206 aa  247  1e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000469854  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1740  30S ribosomal protein S4  58.17 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0408943  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0871  SSU ribosomal protein S4P  55.77 
 
 		 208 aa  244  6e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000406188  hitchhiker  0.0058792 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0685  30S ribosomal protein S4  58.65 
 
 		 208 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2232  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  242  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0017217  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  57.42 
 
 		 209 aa  241  3.9999999999999997e-63  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  55.5 
 
 		 209 aa  239  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0592  30S ribosomal protein S4  57.69 
 
 		 208 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  54.33 
 
 		 208 aa  236  1e-61  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  55.02 
 
 		 209 aa  236  2e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0333  30S ribosomal protein S4  57.21 
 
 		 208 aa  236  2e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0897396  decreased coverage  0.000428085 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0791  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 208 aa  231  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.068053  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0353  ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.152733  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0523  ribosomal protein S4  53.85 
 
 		 208 aa  231  7.000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.645379  unclonable  0.0000000000198285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1117  30S ribosomal protein S4  55.77 
 
 		 208 aa  230  1e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.614224  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0344  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.423009  unclonable  0.0000000464518 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4939  ribosomal protein S4  54.93 
 
 		 211 aa  226  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00864494  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4291  ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 209 aa  223  1e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4480  ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 208 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131718  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3313  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 209 aa  222  3e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 208 aa  222  3e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0429  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 209 aa  222  4e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.857828  normal  0.0845292 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  221  8e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 207 aa  220  9e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_443  ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000105703  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4252  ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  218  7e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000019621  unclonable  0.00000000000276102 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1861  ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 208 aa  217  7.999999999999999e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1216  30S ribosomal protein S4  53.37 
 
 		 208 aa  217  8.999999999999998e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0261994 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  216  1e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  217  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0501  30S ribosomal protein S4  48.56 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000100385  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  50.95 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  214  5e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  214  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  50.71 
 
 		 211 aa  214  9e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2150  30S ribosomal protein S4  50.72 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000017924  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0083  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000323728  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0963  30S ribosomal protein S4  52.88 
 
 		 208 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.877521  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2814  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 207 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0136866  normal  0.264944 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4520  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  211  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000540597  decreased coverage  0.000000609653 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3292  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 207 aa  212  3.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03147  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.224373  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0417  ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000174636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3682  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00624205  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3779  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0105305  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  50 
 
 		 207 aa  211  4.9999999999999996e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3490  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000164824  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03098  hypothetical protein  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4618  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000445858  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3591  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0175638  normal  0.0749349 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0417  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.045567  hitchhiker  0.000000319693 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2300  30S ribosomal protein S4  48.33 
 
 		 206 aa  211  4.9999999999999996e-54  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.50143  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3684  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00775419  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3611  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00202112  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3719  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0332489  normal  0.162839 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3612  30S ribosomal protein S4  50.24 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0916894  normal  0.743877 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>