More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01340 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01340  ribosomal protein S5  100 
 
 
166 aa  320  6e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.162816  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2920  30S ribosomal protein S5  78.31 
 
 
166 aa  253  7e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000379873  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0121  30S ribosomal protein S5  75.9 
 
 
166 aa  253  8e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000313294  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0124  30S ribosomal protein S5  74.7 
 
 
166 aa  249  1e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0128  30S ribosomal protein S5  74.7 
 
 
166 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2443  30S ribosomal protein S5  77.11 
 
 
166 aa  247  5e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.995236 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0232  30S ribosomal protein S5  76.51 
 
 
166 aa  247  6e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010623  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0122  30S ribosomal protein S5  74.7 
 
 
166 aa  246  8e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  8.348e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0148  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000129671  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0158  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  8.26666e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0127  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0304335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5178  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  5.95354e-09  unclonable  1.58877e-25 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0139  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.93712e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0121  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  8.28927e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0123  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.20585e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0127  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00181316  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0127  30S ribosomal protein S5  75.3 
 
 
166 aa  246  9e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  3.3601e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2694  ribosomal protein S5  74.85 
 
 
164 aa  243  1e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0303  30S ribosomal protein S5  72.12 
 
 
166 aa  241  4e-63  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  1.49284e-05  normal  0.159424 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0242  ribosomal protein S5  73.78 
 
 
168 aa  239  1e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.529563  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0775  30S ribosomal protein S5  74.85 
 
 
167 aa  239  2e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  4.09593e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0211  SSU ribosomal protein S5P  75.15 
 
 
168 aa  234  3e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.102513  normal  0.321891 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0439  30S ribosomal protein S5  71.08 
 
 
166 aa  234  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1507  ribosomal protein S5  70.99 
 
 
173 aa  230  8e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.360692  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1728  30S ribosomal protein S5  70.3 
 
 
168 aa  227  5e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  1.23427e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1950  30S ribosomal protein S5  69.33 
 
 
169 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2035  30S ribosomal protein S5  69.33 
 
 
169 aa  226  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.34488  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1929  30S ribosomal protein S5  68.1 
 
 
169 aa  224  4e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2697  30S ribosomal protein S5  68.71 
 
 
165 aa  223  7e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2382  30S ribosomal protein S5  68.71 
 
 
165 aa  223  7e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0884  30S ribosomal protein S5  69.88 
 
 
167 aa  222  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.560186  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0718  30S ribosomal protein S5  67.48 
 
 
163 aa  221  4e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.160468  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1928  30S ribosomal protein S5  68.1 
 
 
168 aa  218  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.69161 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1168  30S ribosomal protein S5  67.48 
 
 
180 aa  216  1e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0459782  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4009  30S ribosomal protein S5  66.87 
 
 
180 aa  215  3e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  8.76107e-05  hitchhiker  7.86108e-05 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1572  ribosomal protein S5  64.02 
 
 
166 aa  213  8e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0532593  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3007  30S ribosomal protein S5  64.42 
 
 
179 aa  213  9e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.137174  hitchhiker  0.00889655 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2212  30S ribosomal protein S5  63.41 
 
 
172 aa  213  1e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  1.5537e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2047  30S ribosomal protein S5  64.02 
 
 
172 aa  213  1e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0164309  normal  0.432227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0306  30S ribosomal protein S5  64.02 
 
 
172 aa  212  2e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0963107  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1363  30S ribosomal protein S5  67.92 
 
 
162 aa  212  2e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00227785  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1357  ribosomal protein S5  67.27 
 
 
197 aa  211  3e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3311  30S ribosomal protein S5  70.44 
 
 
162 aa  211  5e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.04124e-09 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2840  30S ribosomal protein S5  67.92 
 
 
162 aa  211  5e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.122031  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0950  30S ribosomal protein S5  70.44 
 
 
162 aa  211  5e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00386761  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2406  30S ribosomal protein S5  62.2 
 
 
172 aa  210  6e-54  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0326698  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23300  SSU ribosomal protein S5P  65.64 
 
 
179 aa  210  8e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0615843  hitchhiker  6.6757e-06 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1814  30S ribosomal protein S5  71.52 
 
 
166 aa  210  9e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2279  30S ribosomal protein S5  63.19 
 
 
172 aa  210  9e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  1.67346e-08  hitchhiker  0.00339787 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3988  ribosomal protein S5  66.24 
 
 
166 aa  210  9e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0501123  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1557  ribosomal protein S5  67.09 
 
 
169 aa  208  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000355903  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0697  30S ribosomal protein S5  67.3 
 
 
162 aa  208  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1083  30S ribosomal protein S5  69.81 
 
 
162 aa  208  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.237908  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0732  ribosomal protein S5  66.24 
 
 
190 aa  208  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2260  30S ribosomal protein S5  71.52 
 
 
166 aa  208  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00378829  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0643  30S ribosomal protein S5  66.67 
 
 
162 aa  208  3e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.75279e-06  hitchhiker  1.14757e-07 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2301  30S ribosomal protein S5  71.52 
 
 
166 aa  208  3e-53  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.186174  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2316  ribosomal protein S5  68.79 
 
 
167 aa  208  3e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00562795  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0198  30S ribosomal protein S5  62.2 
 
 
171 aa  207  4e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.136971  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4931  ribosomal protein S5  67.32 
 
 
182 aa  207  5e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.023543  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1834  30S ribosomal protein S5  62.2 
 
 
172 aa  206  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.459272  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl140  30S ribosomal protein S5  65.56 
 
 
206 aa  206  1e-52  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2629  30S ribosomal protein S5  69.28 
 
 
200 aa  203  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.192925  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1466  30S ribosomal protein S5  62.73 
 
 
169 aa  202  1e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  1.30874e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0579  30S ribosomal protein S5  68.42 
 
 
210 aa  202  2e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.898965  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4304  ribosomal protein S5  67.97 
 
 
205 aa  201  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2240  30S ribosomal protein S5  59.12 
 
 
163 aa  200  7e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.109311  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3888  SSU ribosomal protein S5P  67.72 
 
 
205 aa  200  8e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.361  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1748  30S ribosomal protein S5  60.38 
 
 
163 aa  200  8e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.749725  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6032  30S ribosomal protein S5  65.82 
 
 
202 aa  200  9e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2161  ribosomal protein S5  62.66 
 
 
175 aa  199  1e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0929942  normal  0.978944 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0323  SSU ribosomal protein S5P  63.8 
 
 
199 aa  199  1e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00179129 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0599  30S ribosomal protein S5  67.76 
 
 
202 aa  198  2e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1853  ribosomal protein S5  56.1 
 
 
172 aa  199  2e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.52788e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5141  ribosomal protein S5  67.11 
 
 
200 aa  197  4e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.675999 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09830  SSU ribosomal protein S5P  62.11 
 
 
173 aa  197  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0111363  hitchhiker  1.46915e-05 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1103  Ribosomal protein S5-like protein  66.45 
 
 
210 aa  196  1e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2048  30S ribosomal protein S5  58.49 
 
 
163 aa  195  2e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00145313  normal  0.0102029 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0096  30S ribosomal protein S5  57.23 
 
 
163 aa  195  3e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0990487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0725  ribosomal protein S5  59.76 
 
 
165 aa  195  3e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.104359  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0611  SSU ribosomal protein S5P  64.6 
 
 
165 aa  193  8e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0764806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2959  30S ribosomal protein S5  62.5 
 
 
236 aa  193  9e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0103501  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1202  30S ribosomal protein S5  65.19 
 
 
208 aa  191  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.672112  normal  0.0445875 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2671  30S ribosomal protein S5  63.92 
 
 
238 aa  191  4e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2757  30S ribosomal protein S5  57.59 
 
 
163 aa  191  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0511806  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3650  ribosomal protein S5  61.73 
 
 
168 aa  190  6e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  8.74802e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1049  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 
223 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.00405345  normal  0.132345 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1032  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 
223 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  hitchhiker  6.81641e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1061  30S ribosomal protein S5  61.78 
 
 
223 aa  189  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  hitchhiker  0.000257421  normal  0.422171 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10735  30S ribosomal protein S5  61.25 
 
 
220 aa  189  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.27793e-05  normal  0.43056 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0415  ribosomal protein S5  58.71 
 
 
183 aa  189  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0930  ribosomal protein S5  63.46 
 
 
161 aa  188  3e-47  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000594663  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2138  SSU ribosomal protein S5P  63.09 
 
 
200 aa  188  3e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0665154  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3689  ribosomal protein S5  63.16 
 
 
215 aa  188  3e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  5.41133e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5030  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
222 aa  188  3e-47  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  hitchhiker  3.82419e-06  normal  0.598493 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1339  30S ribosomal protein S5  60.13 
 
 
225 aa  187  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  6.96393e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0619  30S ribosomal protein S5  56.97 
 
 
172 aa  187  7e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.797529 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3400  ribosomal protein S5  59.38 
 
 
215 aa  186  9e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.608039  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1243  30S ribosomal protein S5  57.93 
 
 
169 aa  186  9e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00969773  hitchhiker  0.0030984 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0212  30S ribosomal protein S5  62.35 
 
 
168 aa  185  2e-46  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  3.16e-05  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>