More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01210 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01210  ribosomal protein S19  100 
 
 
94 aa  194  4.0000000000000005e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.441353  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2456  30S ribosomal protein S19  87.23 
 
 
94 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0781906 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0290  ribosomal protein S19  79.79 
 
 
94 aa  167  4e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00533936  normal  0.0406093 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2907  30S ribosomal protein S19  80.85 
 
 
94 aa  163  6.9999999999999995e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.761008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1520  30S ribosomal protein S19  80.85 
 
 
94 aa  162  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.914288  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1741  30S ribosomal protein S19  80.85 
 
 
94 aa  161  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000000745132  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0229  30S ribosomal protein S19  77.66 
 
 
94 aa  160  6e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0198  SSU ribosomal protein S19P  79.79 
 
 
94 aa  160  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0174859  normal  0.0509464 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0719  ribosomal protein S19  75.53 
 
 
94 aa  156  9e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0219  ribosomal protein S19  74.47 
 
 
94 aa  153  7e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00075195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0985  30S ribosomal protein S19  73.4 
 
 
94 aa  149  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1181  30S ribosomal protein S19  76.47 
 
 
95 aa  148  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.538373 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2329  ribosomal protein S19  73.63 
 
 
94 aa  149  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000239943  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0762  30S ribosomal protein S19  74.47 
 
 
93 aa  146  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000324039  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1180  ribosomal protein S19  76.92 
 
 
93 aa  145  1.0000000000000001e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000119264  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09960  SSU ribosomal protein S19P  78.57 
 
 
86 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.328032  hitchhiker  0.00000140006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0871  30S ribosomal protein S19  76.6 
 
 
93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000215821  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4022  30S ribosomal protein S19  75.29 
 
 
95 aa  144  3e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.717988  hitchhiker  0.00000485262 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0115  30S ribosomal protein S19  72.22 
 
 
92 aa  144  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000709655  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1157  ribosomal protein S19  78.31 
 
 
86 aa  144  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000321544  hitchhiker  0.000000515171 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2174  ribosomal protein S19  75.29 
 
 
91 aa  144  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.765738  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0426  30S ribosomal protein S19  67.02 
 
 
93 aa  142  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0022508  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0111  30S ribosomal protein S19  71.11 
 
 
92 aa  142  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3020  30S ribosomal protein S19  75.29 
 
 
95 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00609436  hitchhiker  0.00770845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2707  ribosomal protein S19  71.11 
 
 
93 aa  141  4e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00775426  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1390  30S ribosomal protein S19  76.19 
 
 
95 aa  141  4e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000262881  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1296  30S ribosomal protein S19  76.19 
 
 
95 aa  141  4e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0245  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.948054  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0248  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
92 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1570  ribosomal protein S19  73.81 
 
 
95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000162931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0108  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
92 aa  138  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000257453  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0114  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  137  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000000793752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0126  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  137  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9760100000000003e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0114  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  137  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000383993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0110  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  137  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.16547e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0108  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  137  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000559577  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0145  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  137  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000029175  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0786  30S ribosomal protein S19  75.9 
 
 
97 aa  138  3e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.314347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0114  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  137  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000118397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2710  30S ribosomal protein S19  74.7 
 
 
93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2395  30S ribosomal protein S19  74.7 
 
 
93 aa  137  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3663  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  137  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230775  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04020  SSU ribosomal protein S19P  77.11 
 
 
93 aa  136  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.904114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6610  ribosomal protein S19  75.9 
 
 
93 aa  135  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3707  30S ribosomal protein S19  71.43 
 
 
92 aa  134  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0402  ribosomal protein S19  72.62 
 
 
93 aa  134  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0109  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  134  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000185939  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23430  SSU ribosomal protein S19P  73.75 
 
 
85 aa  134  4e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000187491  hitchhiker  0.0000000975507 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0846  ribosomal protein S19  71.76 
 
 
94 aa  134  5e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0957  30S ribosomal protein S19  72.62 
 
 
95 aa  134  6.0000000000000005e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000875114  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2151  SSU ribosomal protein S19P  72.29 
 
 
93 aa  133  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.152821  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2228  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
91 aa  133  9e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.749299  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1827  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.476916  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1296  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  131  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00413729  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4503  ribosomal protein S19  68.89 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2642  SSU ribosomal protein S19P  68.89 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.570508  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0695  30S ribosomal protein S19  70.24 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00208226  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0135  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000777644  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0310  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
93 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00187056 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0062  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  131  3e-30  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.235454  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6045  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
93 aa  131  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.852276  normal  0.340402 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1344  ribosomal protein S19  67.47 
 
 
90 aa  131  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5783  ribosomal protein S19  66.29 
 
 
92 aa  131  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.15946 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2563  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.61073  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4317  ribosomal protein S19  70 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5128  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
92 aa  131  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76287 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1134  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
95 aa  130  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000000887938  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0566  30S ribosomal protein S19  68.89 
 
 
92 aa  130  5e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1863  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 
95 aa  130  5e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00494642  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0295  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
95 aa  130  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  1.07171e-28 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0586  30S ribosomal protein S19  70 
 
 
93 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1903  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  130  6e-30  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2273  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000681992  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1127  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
93 aa  130  7.999999999999999e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.831563  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2314  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  130  7.999999999999999e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000275126  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2398  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  130  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0423225  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2903  ribosomal protein S19  63.83 
 
 
94 aa  129  1.0000000000000001e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3008  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0207995  hitchhiker  0.00691739 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1619  ribosomal protein S19  70.24 
 
 
88 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1934  30S ribosomal protein S19  65.17 
 
 
89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2683  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1479  30S ribosomal protein S19  65.56 
 
 
92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100363  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3158  30S ribosomal protein S19  67.06 
 
 
89 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.558725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2971  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.241839  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3754  ribosomal protein S19  69.88 
 
 
93 aa  128  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.396407  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2615  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  127  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00302204  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17120  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0814884  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0599  SSU ribosomal protein S19P  63.04 
 
 
93 aa  127  4.0000000000000003e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000698901  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3919  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1125  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10719  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.560637  normal  0.221771 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19991  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.380662  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4311  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.410711  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1090  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
92 aa  127  6e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0844216 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1414  30S ribosomal protein S19  62.77 
 
 
94 aa  127  6e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20830  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
92 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0372  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.252396  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0606  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
88 aa  126  9.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4347  30S ribosomal protein S19  65.88 
 
 
92 aa  126  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000995176  normal  0.11261 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  68.24 
 
 
91 aa  126  9.000000000000001e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>