More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01130 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01130  ribosomal protein S7  100 
 
 
155 aa  313  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  6.61057e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  68.18 
 
 
156 aa  221  2e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  65.81 
 
 
157 aa  221  3e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  65.58 
 
 
156 aa  219  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0190  30S ribosomal protein S7  66.23 
 
 
156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000054268  hitchhiker  0.00360958 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2596  30S ribosomal protein S7  63.87 
 
 
155 aa  218  3e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000119958  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  64.94 
 
 
156 aa  215  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0418  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  214  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000139374  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  63.23 
 
 
155 aa  214  5e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  63.23 
 
 
155 aa  214  5e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1487  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 
156 aa  213  8e-55  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000188797  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  212  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1763  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 
156 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0139777  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  211  1.9999999999999998e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2214  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  211  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.269456  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  211  3.9999999999999995e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0316  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  210  4.9999999999999996e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000534832  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  210  7e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  210  7e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1770  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  209  7.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000571074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2728  30S ribosomal protein S7  62.99 
 
 
156 aa  209  7.999999999999999e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000610678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0794  30S ribosomal protein S7  61.29 
 
 
155 aa  209  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.150623  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl623  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 
155 aa  209  1e-53  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0949  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  209  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000145029  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  62.34 
 
 
156 aa  209  2e-53  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2119  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.369187 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3188  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.863233 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  61.69 
 
 
156 aa  208  3e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1904  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  207  4e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0532387  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  207  4e-53  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  207  4e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1769  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  207  4e-53  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0798978  normal  0.63189 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  207  5e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3671  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  207  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2436  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  206  6e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.421557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2158  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  206  6e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  206  8e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1949  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 
158 aa  206  8e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3452  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  206  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.964453  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  57.42 
 
 
155 aa  205  2e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  204  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  204  3e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1350  30S ribosomal protein S7  59.74 
 
 
156 aa  204  4e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.3065  hitchhiker  0.00975645 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  204  5e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0188  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  203  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000472522  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  60.39 
 
 
156 aa  203  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0613  30S ribosomal protein S7  58.71 
 
 
155 aa  203  7e-52  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  decreased coverage  0.000989224  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2262  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  202  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0594679  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0152  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 
155 aa  202  1e-51  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0694  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  202  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000170955  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0662  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  202  2e-51  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000445482  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0711  ribosomal protein S7  59.74 
 
 
157 aa  201  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  63.64 
 
 
156 aa  201  4e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  201  4e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  200  5e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  200  5e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0584  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0356  30S ribosomal protein S7  58.06 
 
 
155 aa  198  1.9999999999999998e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0211  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  60.65 
 
 
157 aa  199  1.9999999999999998e-50  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2070  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  198  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2732  30S ribosomal protein S7  61.04 
 
 
156 aa  197  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.213964 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  58.06 
 
 
155 aa  197  3e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2963  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
158 aa  198  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.255564  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  59.46 
 
 
156 aa  198  3e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0977  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  197  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000522075  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  57.79 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0843  30S ribosomal protein S7  59.09 
 
 
156 aa  197  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00121052  hitchhiker  0.000363521 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0076  30S ribosomal protein S7  57.14 
 
 
156 aa  197  5e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  197  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  197  5e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  59.35 
 
 
157 aa  196  7e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 
156 aa  196  7e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2861  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0179023  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  55.84 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2337  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000011851  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 
156 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1048  30S ribosomal protein S7  59.62 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000242991  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2069  ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000023208  normal  0.630428 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  56.49 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0144  30S ribosomal protein S7  60.81 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000170326  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  58.44 
 
 
156 aa  195  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  60.81 
 
 
156 aa  194  3e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  55.19 
 
 
156 aa  194  3e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  61.49 
 
 
156 aa  194  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>