More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00950 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00950  glutamyl-tRNA synthetase  100 
 
 
490 aa  996    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000392193  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0844  glutamyl-tRNA synthetase  53.47 
 
 
485 aa  536  1e-151  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000194011  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0168  glutamate--tRNA(Gln) ligase, glutamyl-tRNA synthetase  52.77 
 
 
488 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.360879  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2255  glutamyl-tRNA synthetase  49.69 
 
 
485 aa  495  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000249346  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0191  glutamyl-tRNA synthetase  48.25 
 
 
482 aa  485  1e-136  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0263  glutamyl-tRNA synthetase  49.39 
 
 
485 aa  485  1e-135  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000430888  normal  0.0100734 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0526  glutamyl-tRNA synthetase  48.16 
 
 
494 aa  467  9.999999999999999e-131  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0088  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
486 aa  462  1e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000507745  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0396  glutamyl-tRNA synthetase  45.62 
 
 
488 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000204549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1531  glutamyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
501 aa  461  9.999999999999999e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.177187  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1132  glutamyl-tRNA synthetase  45.77 
 
 
490 aa  458  1e-127  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0084  glutamyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 
491 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18780  glutamyl-tRNA synthetase  48.24 
 
 
491 aa  449  1e-125  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000257278  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1325  glutamyl-tRNA synthetase  48.55 
 
 
478 aa  442  1e-123  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2102  glutamyl-tRNA synthetase  44.29 
 
 
479 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00226932  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0564  glutamyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
484 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0550  glutamyl-tRNA synthetase  45.95 
 
 
484 aa  435  1e-121  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0082  glutamyl-tRNA synthetase  45.57 
 
 
485 aa  435  1e-120  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000052897  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0168  glutamyl-tRNA synthetase  46.14 
 
 
484 aa  434  1e-120  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0098  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
491 aa  434  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.11563e-60 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0087  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
485 aa  427  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000536948  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0087  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
485 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.0000000457939  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0084  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
485 aa  427  1e-118  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000172568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0083  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
485 aa  427  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000937191  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0118  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
485 aa  427  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768632  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0086  glutamyl-tRNA synthetase  44.54 
 
 
485 aa  427  1e-118  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000396162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0082  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
485 aa  428  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000167432  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0108  glutamyl-tRNA synthetase  43.92 
 
 
491 aa  425  1e-117  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000769227  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1273  glutamyl-tRNA synthetase  45.34 
 
 
477 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.692147  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5218  glutamyl-tRNA synthetase  44.33 
 
 
491 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000214653  unclonable  2.62835e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1866  glutamyl-tRNA synthetase  44.67 
 
 
495 aa  421  1e-116  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0953769  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2538  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
481 aa  417  9.999999999999999e-116  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0083  glutamyl-tRNA synthetase  45.29 
 
 
488 aa  412  1e-114  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.452446  hitchhiker  0.000158184 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0670  glutamyl-tRNA synthetase  47.1 
 
 
464 aa  412  1e-114  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.418683  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0337  glutamyl-tRNA synthetase  44.79 
 
 
499 aa  409  1e-113  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000120471  hitchhiker  0.00000000382568 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1432  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
469 aa  408  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1478  glutamyl-tRNA synthetase  44.03 
 
 
469 aa  406  1.0000000000000001e-112  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0930  glutamyl- and glutaminyl-tRNA synthetases  41.39 
 
 
495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390655  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2357  glutamyl-tRNA synthetase  43.74 
 
 
490 aa  405  1.0000000000000001e-112  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0678  glutamyl-tRNA synthetase  42.94 
 
 
469 aa  405  1.0000000000000001e-112  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0260841  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2300  glutamyl-tRNA synthetase  44.24 
 
 
467 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0121801  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3484  glutamyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 
469 aa  404  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0941  glutamyl-tRNA synthetase  42.89 
 
 
480 aa  400  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2361  glutamyl-tRNA synthetase  43.95 
 
 
483 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000183639  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1646  glutamyl-tRNA synthetase  40.69 
 
 
493 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.875023  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0584  glutamyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 
466 aa  393  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0242919  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2279  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 
467 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000050225  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1944  glutamyl-tRNA synthetase  43 
 
 
467 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1219  glutamyl-tRNA synthetase  41.84 
 
 
466 aa  388  1e-106  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.144634  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2309  glutamyl-tRNA synthetase  43.75 
 
 
483 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0065  glutamyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 
473 aa  387  1e-106  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0249226  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1274  glutamyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 
472 aa  387  1e-106  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4861  glutamyl-tRNA synthetase  42.48 
 
 
481 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000702508  unclonable  0.000000180865 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1736  glutamyl-tRNA synthetase  43.94 
 
 
465 aa  384  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.872954  normal  0.596825 
 
 
-
 
NC_002936  DET1365  glutamyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 
484 aa  380  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1289  glutamyl-tRNA synthetase  42.22 
 
 
500 aa  380  1e-104  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1830  glutamyl-tRNA synthetase  41.51 
 
 
488 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.462923  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4302  glutamyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 
481 aa  377  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0051  glutamyl-tRNA synthetase / glutamate--tRNA(Gln) ligase  41.67 
 
 
518 aa  377  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2856  glutamyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
496 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1366  glutamyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 
468 aa  375  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  decreased coverage  0.000255518  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1176  glutamyl-tRNA synthetase  40.79 
 
 
487 aa  377  1e-103  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3355  glutamyl-tRNA synthetase  39.38 
 
 
504 aa  373  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000992039  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1264  glutamyl-tRNA synthetase  42.21 
 
 
471 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0504  glutamyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 
504 aa  372  1e-102  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0630842  normal  0.758869 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08460  glutamyl-tRNA synthetase  41.07 
 
 
498 aa  372  1e-102  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.842364  normal  0.487414 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2733  glutamyl-tRNA synthetase  38.43 
 
 
494 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0694392  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1650  glutamyl-tRNA synthetase  41.39 
 
 
466 aa  369  1e-101  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.93151e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1409  glutamyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 
463 aa  369  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0714  glutamyl-tRNA synthetase  41.44 
 
 
504 aa  369  1e-101  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.724966  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3060  glutamyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 
481 aa  369  1e-101  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.00000448328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1579  glutamyl-tRNA synthetase  41.27 
 
 
470 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.496089  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2393  glutamyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 
481 aa  366  1e-100  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0156972  hitchhiker  0.00526056 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0077  glutamyl-tRNA synthetase  39.71 
 
 
492 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0814  glutamyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 
468 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.407873  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1251  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
474 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.75767  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1352  glutamyl-tRNA synthetase  41.92 
 
 
474 aa  363  3e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0213404  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0075  glutamyl-tRNA synthetase  39.67 
 
 
464 aa  363  3e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1783  glutamyl-tRNA synthetase  39.92 
 
 
503 aa  363  4e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0500613 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1146  glutamyl-tRNA synthetase  40.58 
 
 
484 aa  363  5.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0188  glutamate--tRNA(Gln) ligase / glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
881 aa  361  1e-98  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.558191 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1302  glutamyl-tRNA synthetase  40.45 
 
 
471 aa  361  1e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09840  glutamyl-tRNA synthetase  39.18 
 
 
492 aa  360  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.224887 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0464  glutamyl-tRNA synthetase  40.85 
 
 
502 aa  359  6e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.295765  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2597  glutamyl-tRNA synthetase  41.31 
 
 
474 aa  359  6e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2346  glutamyl-tRNA synthetase  41.26 
 
 
483 aa  359  6e-98  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0066812  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0427  glutamyl-tRNA synthetase  40.8 
 
 
502 aa  358  9.999999999999999e-98  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1201  glutamyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 
501 aa  356  5e-97  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000196599  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0696  glutamyl-tRNA synthetase  42.13 
 
 
463 aa  355  8.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.69774  normal  0.269454 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1721  glutamyl-tRNA synthetase  38.72 
 
 
504 aa  355  1e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.730284  normal  0.139822 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0422  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
466 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.869081  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0584  glutamyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 
466 aa  355  1e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.779579  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0359  glutamyl-tRNA synthetase  39.01 
 
 
502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0392  glutamyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 
502 aa  353  5e-96  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00651757  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2648  glutamyl-tRNA synthetase  40.57 
 
 
464 aa  352  7e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1234  glutamyl-tRNA synthetase  39.3 
 
 
468 aa  352  8.999999999999999e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.966582  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1604  glutamyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 
465 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.161822  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0184  glutamyl-tRNA synthetase  40.29 
 
 
480 aa  352  1e-95  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.527143 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3196  glutamyl-tRNA synthetase  40.92 
 
 
482 aa  352  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1216  glutamyl-tRNA synthetase  38.6 
 
 
470 aa  351  2e-95  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000500466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>