76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_00910 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_00910  PilT protein domain protein  100 
 
 
364 aa  724    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000274223  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2488  PilT protein-like  52 
 
 
383 aa  351  1e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000025338  normal  0.0444425 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0165  PilT protein domain protein  53.26 
 
 
366 aa  345  7e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5221  hypothetical protein  50.53 
 
 
367 aa  332  5e-90  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00102382  unclonable  1.43587e-25 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0393  PilT protein domain protein  49.47 
 
 
388 aa  328  8e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2736  PilT protein domain protein  47.17 
 
 
363 aa  326  3e-88  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.0000000848618  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0084  hypothetical protein  50.8 
 
 
369 aa  325  7e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0084  hypothetical protein  50.8 
 
 
369 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0081  hypothetical protein  50.8 
 
 
369 aa  325  7e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0080  hypothetical protein  50.8 
 
 
369 aa  325  7e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0083  hypothetical protein  50.8 
 
 
369 aa  325  7e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0186  PilT domain-containing protein  54.21 
 
 
380 aa  324  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0442376  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0105  hypothetical protein  50.53 
 
 
369 aa  324  1e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0085  PilT protein domain protein  51.81 
 
 
364 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0127482  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0079  PilT domain-containing protein  51.81 
 
 
367 aa  323  4e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0079  PilT domain-containing protein  48.15 
 
 
370 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0081  PilT protein domain protein  54.69 
 
 
364 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0838  PilT domain-containing protein  60.07 
 
 
367 aa  315  5e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000323541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0260  PilT protein domain protein  51.08 
 
 
383 aa  316  5e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000167901  normal  0.0149964 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2427  PIN/TRAM domain-containing protein  47.86 
 
 
368 aa  306  3e-82  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0115  PilT protein domain protein  61.33 
 
 
257 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.673954  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0185  PilT domain-containing protein  48.78 
 
 
371 aa  300  3e-80  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000000117639  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2740  PIN/TRAM domain-containing protein  47.59 
 
 
368 aa  296  4e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0174  PilT protein domain protein  44.44 
 
 
367 aa  282  7.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3656  PilT domain-containing protein  49.48 
 
 
346 aa  280  3e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000367693  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0341  PilT protein domain protein  45.03 
 
 
346 aa  276  3e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.220922  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0400  PilT protein domain protein  50.32 
 
 
369 aa  275  6e-73  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000234721  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0189  PilT protein-like  50.5 
 
 
384 aa  273  4.0000000000000004e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.919011  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2362  pili retraction protein PilT  49.61 
 
 
366 aa  260  3e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.36366  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1561  PilT protein domain protein  42.27 
 
 
357 aa  255  8e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1002  PilT protein domain protein  41.16 
 
 
377 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000369877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1477  PilT protein domain protein  62.94 
 
 
269 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0506591  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0302  PilT domain-containing protein  40.16 
 
 
380 aa  252  8.000000000000001e-66  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1851  PilT protein domain protein  40.81 
 
 
359 aa  249  7e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.165199  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3506  PilT protein domain protein  48.1 
 
 
360 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.133107  normal  0.104798 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2600  PilT protein domain protein  48.1 
 
 
360 aa  248  9e-65  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4460  PilT protein domain protein  44.3 
 
 
360 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0095  PilT protein domain protein  70.83 
 
 
168 aa  242  7e-63  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.33572e-62 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4268  PilT protein domain-containing protein  40.98 
 
 
358 aa  238  1e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.040207  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2222  PilT protein-like  40.85 
 
 
358 aa  231  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2383  nucleotide binding protein, PINc  37.61 
 
 
383 aa  231  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00694087 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2358  integral membrane protein  37.98 
 
 
361 aa  224  2e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1195  PilT protein-like  40.11 
 
 
359 aa  222  6e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0130312 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0167  PilT domain-containing protein  43.11 
 
 
358 aa  220  3e-56  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0563  PilT domain-containing protein  38.44 
 
 
357 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0549  PilT domain-containing protein  38.44 
 
 
357 aa  214  9.999999999999999e-55  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0079  PilT domain-containing protein  34.1 
 
 
385 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.430433  normal  0.692182 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1733  PilT domain-containing protein  42.5 
 
 
361 aa  213  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.147599 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3254  PilT protein domain protein  37.23 
 
 
366 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2018  PilT domain-containing protein  38.81 
 
 
364 aa  204  2e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1515  PilT protein domain protein  48.8 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0185  PilT domain-containing protein  38.74 
 
 
385 aa  200  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000320699  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2116  PilT domain-containing protein  35.42 
 
 
336 aa  193  5e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.960962  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13601  integral membrane protein  47.42 
 
 
371 aa  185  9e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.729181  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1298  PilT protein domain protein  50.52 
 
 
346 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2177  PilT protein domain protein  43.98 
 
 
344 aa  183  3e-45  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1657  PilT domain-containing protein  45.03 
 
 
355 aa  179  7e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.145178  normal  0.591632 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15111  integral membrane protein  44.62 
 
 
369 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.361887  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14981  integral membrane protein  44.62 
 
 
369 aa  178  2e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17331  integral membrane protein  33.52 
 
 
369 aa  177  2e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.07903  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1409  PIN domain superfamily protein  44.1 
 
 
369 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0878  PIN domain superfamily protein  44.85 
 
 
369 aa  177  4e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.412243  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0842  nucleotide binding protein, PINc  43.81 
 
 
385 aa  175  9.999999999999999e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.214431  normal  0.01039 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1547  nucleotide binding protein, PINc  41.75 
 
 
388 aa  172  6.999999999999999e-42  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.111102  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0998  PilT protein-like protein  42.56 
 
 
361 aa  172  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00567105  normal  0.0135719 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20011  integral membrane protein  42.27 
 
 
389 aa  169  5e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.192672 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14731  integral membrane protein  43.59 
 
 
369 aa  167  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.961128  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0223  ATPase  33.09 
 
 
602 aa  52  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0503  ATPase  30 
 
 
633 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2922  ATPase  29.93 
 
 
655 aa  48.1  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.779051  normal  0.431626 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0301  ATPase  28.15 
 
 
629 aa  45.1  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.070648  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3514  PilT protein domain protein  27.7 
 
 
625 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0689  ATPase  31.82 
 
 
642 aa  44.7  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00061638  normal  0.134413 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0094  hypothetical protein  25.83 
 
 
161 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  5.126e-62 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1923  ATPase  30.16 
 
 
658 aa  42.7  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0691  PilT domain-containing protein  33.65 
 
 
133 aa  42.7  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>